90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_0336 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012039  Cla_0336  conserved hypothetical protein, predicted ATP/GTP-binding protein  100 
 
 		 741 aa  1429    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0460  GTP-binding protein  46.37 
 
 		 728 aa  542  1e-153  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.839985  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0435  GTP-binding protein  45.96 
 
 		 728 aa  541  9.999999999999999e-153  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1546  GTP-binding protein  45.42 
 
 		 728 aa  537  1e-151  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0437  GTP-binding protein  31.5 
 
 		 692 aa  275  3e-72  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0397  Dynamin family protein  32.78 
 
 		 789 aa  270  7e-71  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0111735  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0403  dynamin family protein  35.14 
 
 		 693 aa  257  6e-67  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0859  GTP-binding protein  32.33 
 
 		 692 aa  257  7e-67  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.547864  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1406  hypothetical protein  27.25 
 
 		 914 aa  107  1e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0787  dynamin family protein  29.19 
 
 		 655 aa  100  1e-19  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0394271  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6878  Dynamin family protein  23.97 
 
 		 620 aa  89.7  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3036  dynamin family protein  24.18 
 
 		 614 aa  83.2  0.00000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0241135  normal  0.688737 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2994  dynamin family protein  24.18 
 
 		 614 aa  83.2  0.00000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.214598  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1896  Dynamin family protein  23.67 
 
 		 1228 aa  78.2  0.0000000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00444431  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2259  Dynamin family protein  23.08 
 
 		 444 aa  77.8  0.0000000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000551632  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0969  Dynamin family protein  24.18 
 
 		 648 aa  75.5  0.000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0933  dynamin family protein  25.81 
 
 		 679 aa  72.8  0.00000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.807319  hitchhiker  0.00750508 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2910  dynamin family protein  22.37 
 
 		 605 aa  71.6  0.00000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.518789  normal  0.400566 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1095  dynamin  24.52 
 
 		 588 aa  70.9  0.00000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.845511  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2213  Dynamin family protein  24.22 
 
 		 587 aa  70.9  0.00000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1306  dynamin family protein  24.21 
 
 		 1219 aa  70.5  0.0000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.604786  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2392  Dynamin family protein  23.9 
 
 		 1249 aa  70.5  0.0000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0373  hypothetical protein  23.26 
 
 		 737 aa  68.9  0.0000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1701  hypothetical protein  23.67 
 
 		 1219 aa  68.2  0.0000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1479  hypothetical protein  23.67 
 
 		 1219 aa  67.8  0.0000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1595  hypothetical protein  23.67 
 
 		 1219 aa  67.8  0.0000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1451  GTP1/OBG family GTPase  23.33 
 
 		 1219 aa  67  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.472831  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1451  GTP1/OBG family GTPase  23.33 
 
 		 1219 aa  66.6  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1741  hypothetical protein  23.33 
 
 		 1219 aa  66.6  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000058782  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1494  dynamin family protein  23.42 
 
 		 1219 aa  66.2  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.248245  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1665  hypothetical protein  23.33 
 
 		 1219 aa  66.6  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1630  hypothetical protein  23 
 
 		 1219 aa  65.9  0.000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00254693  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3715  hypothetical protein  23.33 
 
 		 1219 aa  65.9  0.000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6054  hypothetical protein  22.66 
 
 		 747 aa  64.3  0.000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2424  Dynamin family protein  27.03 
 
 		 666 aa  63.5  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1193  hypothetical protein  23.79 
 
 		 614 aa  62.8  0.00000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.108086  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1530  hypothetical protein  26.85 
 
 		 1146 aa  63.2  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.532706  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1501  hypothetical protein  26.85 
 
 		 1146 aa  63.2  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0914  Dynamin family protein  25.09 
 
 		 548 aa  62  0.00000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.440355 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2547  dynamin  24.6 
 
 		 551 aa  62  0.00000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.164219 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2545  dynamin  27.14 
 
 		 390 aa  60.5  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0649757  normal  0.0791445 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4145  hypothetical protein  22.33 
 
 		 690 aa  59.7  0.0000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.487831 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1225  hypothetical protein  27.64 
 
 		 793 aa  60.1  0.0000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.640343  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1350  dynamin  22.78 
 
 		 693 aa  59.7  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0228271 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6880  Dynamin family protein  21.82 
 
 		 1164 aa  58.5  0.0000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3239  hypothetical protein  24.18 
 
 		 669 aa  58.2  0.0000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.983308  normal  0.678486 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1096  GTP-binding protein, HSR1-related  23.96 
 
 		 664 aa  58.2  0.0000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1351  heat shock protein DnaJ-like  24.28 
 
 		 741 aa  57.8  0.0000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0473185 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0398  Dynamin family protein  24.66 
 
 		 674 aa  57.8  0.0000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5314  hypothetical protein  23.86 
 
 		 952 aa  57.8  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1377  dynamin family protein  28.7 
 
 		 585 aa  57.8  0.0000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.682843  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2546  hypothetical protein  25 
 
 		 719 aa  57.8  0.0000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0908682 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2209  GTP-binding protein  26.5 
 
 		 615 aa  57.8  0.0000008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3241  hypothetical protein  22.52 
 
 		 701 aa  55.8  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.424081  normal  0.24585 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1013  hypothetical protein  23.98 
 
 		 1145 aa  55.1  0.000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.445275  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0337  conserved hypothetical protein, predicted ATP/GTP-binding protein  27.31 
 
 		 605 aa  54.7  0.000007  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1273  Dynamin family protein  21.9 
 
 		 407 aa  54.7  0.000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000146438  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1654  dynamin  24.73 
 
 		 686 aa  53.5  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0311974  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1439  Dynamin family protein  25.5 
 
 		 546 aa  53.9  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.784928  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0815  GTPase  29.08 
 
 		 712 aa  53.1  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3531  dynamin family protein  31.76 
 
 		 585 aa  52.8  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0830  hypothetical protein  29.08 
 
 		 712 aa  53.1  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00896739  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3460  hypothetical protein  22.05 
 
 		 659 aa  53.1  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1639  dynamin family protein  23.53 
 
 		 605 aa  52.4  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.143429  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2106  dynamin  30.49 
 
 		 564 aa  51.6  0.00006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.78205 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1545  GTP-binding protein  26.73 
 
 		 569 aa  51.2  0.00008  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.712051  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0632  Dynamin family protein  23.22 
 
 		 589 aa  50.8  0.00009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2425  GTP-binding protein HSR1-related  39.62 
 
 		 533 aa  50.4  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3727  hypothetical protein  21.34 
 
 		 764 aa  50.4  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0436  GTP-binding protein  25.81 
 
 		 569 aa  50.1  0.0001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0461  GTP-binding protein  25.9 
 
 		 569 aa  50.4  0.0001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0612543  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5964  hypothetical protein  22.19 
 
 		 641 aa  49.7  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0285067  normal  0.193033 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1654  dynamin family protein  23.38 
 
 		 603 aa  49.3  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.964955 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2968  dynamin family protein  29.63 
 
 		 583 aa  48.5  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3729  hypothetical protein  20.57 
 
 		 626 aa  48.9  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.731679  normal  0.057897 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0322  Dynamin family protein  27.78 
 
 		 585 aa  48.5  0.0004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0251  hypothetical protein  24.77 
 
 		 819 aa  46.6  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0811563  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0404  glucosamine fructose-6-phosphate aminotransferase (isomerizing)  26.64 
 
 		 610 aa  46.2  0.002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2196  dynamin family protein  24.37 
 
 		 506 aa  46.2  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000046764 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_44250  predicted protein  32.53 
 
 		 632 aa  46.2  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.755773  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4018  hypothetical protein  24.26 
 
 		 814 aa  46.6  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.505763 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1653  GTP-binding protein, HSR1-related  33.33 
 
 		 524 aa  46.6  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0754256  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0860  GTP-binding protein  25.86 
 
 		 601 aa  45.8  0.003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1733  hypothetical protein  41.18 
 
 		 976 aa  45.1  0.005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3084  hypothetical protein  19.46 
 
 		 627 aa  45.1  0.005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4205  hypothetical protein  23.9 
 
 		 809 aa  44.7  0.006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4244  GTPase (dynamin-related)-like protein  23.9 
 
 		 809 aa  44.7  0.006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.000109098  hitchhiker  0.00000166794 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2227  hypothetical protein  28.57 
 
 		 888 aa  44.7  0.006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0438  GTP-binding protein  38.33 
 
 		 599 aa  44.7  0.007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0374  hypothetical protein  24.06 
 
 		 621 aa  44.3  0.009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>