22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_3727 on replicon NC_007494
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007494  RSP_3727  hypothetical protein  100 
 
 		 764 aa  1518    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3460  hypothetical protein  98.03 
 
 		 659 aa  1270    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3239  hypothetical protein  75.46 
 
 		 669 aa  977    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.983308  normal  0.678486 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4145  hypothetical protein  38.32 
 
 		 690 aa  355  2e-96  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.487831 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3241  hypothetical protein  33.39 
 
 		 701 aa  213  7.999999999999999e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.424081  normal  0.24585 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0787  dynamin family protein  21.13 
 
 		 655 aa  74.3  0.000000000008  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0394271  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0397  Dynamin family protein  27.27 
 
 		 789 aa  67.8  0.0000000008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0111735  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0403  dynamin family protein  38.24 
 
 		 693 aa  57.8  0.0000008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0969  Dynamin family protein  27.5 
 
 		 648 aa  57.4  0.0000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6054  hypothetical protein  25.74 
 
 		 747 aa  56.2  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1546  GTP-binding protein  22.22 
 
 		 728 aa  52  0.00004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0400  hypothetical protein  30.77 
 
 		 662 aa  50.1  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0733804  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0435  GTP-binding protein  21.75 
 
 		 728 aa  50.4  0.0001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0336  conserved hypothetical protein, predicted ATP/GTP-binding protein  21.34 
 
 		 741 aa  50.4  0.0001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0373  hypothetical protein  26.86 
 
 		 737 aa  50.1  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0460  GTP-binding protein  22.22 
 
 		 728 aa  49.7  0.0002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.839985  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1095  dynamin  22.14 
 
 		 588 aa  48.9  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.845511  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2392  Dynamin family protein  22.26 
 
 		 1249 aa  48.9  0.0004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0282  hypothetical protein  30.28 
 
 		 648 aa  47.4  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1350  dynamin  36.26 
 
 		 693 aa  46.6  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0228271 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3234  hypothetical protein  26.88 
 
 		 675 aa  45.8  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.220852  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2259  Dynamin family protein  34.15 
 
 		 444 aa  45.1  0.005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000551632  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>