99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_0397 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013512  Sdel_0397  Dynamin family protein  100 
 
 
789 aa  1614    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0111735  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0336  conserved hypothetical protein, predicted ATP/GTP-binding protein  32.06 
 
 
741 aa  258  2e-67  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0460  GTP-binding protein  30.63 
 
 
728 aa  249  2e-64  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.839985  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0435  GTP-binding protein  30.62 
 
 
728 aa  245  1.9999999999999999e-63  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1546  GTP-binding protein  30.29 
 
 
728 aa  244  6e-63  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0403  dynamin family protein  32.02 
 
 
693 aa  239  2e-61  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0437  GTP-binding protein  29.36 
 
 
692 aa  219  2e-55  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0859  GTP-binding protein  30.16 
 
 
692 aa  191  5.999999999999999e-47  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.547864  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0787  dynamin family protein  29.29 
 
 
655 aa  97.8  7e-19  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0394271  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2259  Dynamin family protein  23.86 
 
 
444 aa  93.2  2e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000551632  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2910  dynamin family protein  23.98 
 
 
605 aa  89.4  2e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.518789  normal  0.400566 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2994  dynamin family protein  23.36 
 
 
614 aa  84.3  0.000000000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.214598  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3036  dynamin family protein  23.36 
 
 
614 aa  84.3  0.000000000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0241135  normal  0.688737 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6878  Dynamin family protein  24.05 
 
 
620 aa  83.2  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1095  dynamin  27.62 
 
 
588 aa  80.9  0.0000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.845511  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1896  Dynamin family protein  25.58 
 
 
1228 aa  80.1  0.0000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00444431  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2547  dynamin  26.81 
 
 
551 aa  78.2  0.0000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.164219 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0830  hypothetical protein  27.98 
 
 
712 aa  77.8  0.0000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00896739  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1406  hypothetical protein  23.26 
 
 
914 aa  78.2  0.0000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0815  GTPase  27.98 
 
 
712 aa  77.8  0.0000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0933  dynamin family protein  24.67 
 
 
679 aa  76.3  0.000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.807319  hitchhiker  0.00750508 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1193  hypothetical protein  20.75 
 
 
614 aa  74.3  0.000000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.108086  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3239  hypothetical protein  26.76 
 
 
669 aa  73.2  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.983308  normal  0.678486 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3460  hypothetical protein  25.53 
 
 
659 aa  72.4  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2392  Dynamin family protein  25.41 
 
 
1249 aa  72.4  0.00000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6054  hypothetical protein  26.44 
 
 
747 aa  72  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0969  Dynamin family protein  25.6 
 
 
648 aa  70.1  0.0000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1351  heat shock protein DnaJ-like  25.88 
 
 
741 aa  70.5  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0473185 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1306  dynamin family protein  24.32 
 
 
1219 aa  68.6  0.0000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.604786  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1494  dynamin family protein  25.65 
 
 
1219 aa  68.2  0.0000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.248245  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0860  GTP-binding protein  25.87 
 
 
601 aa  68.2  0.0000000006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1350  dynamin  27.89 
 
 
693 aa  67.8  0.0000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0228271 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3727  hypothetical protein  27.27 
 
 
764 aa  67.8  0.0000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1273  Dynamin family protein  24.79 
 
 
407 aa  67.4  0.0000000009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000146438  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1096  GTP-binding protein, HSR1-related  25 
 
 
664 aa  67  0.000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2545  dynamin  30.56 
 
 
390 aa  67.4  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0649757  normal  0.0791445 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1741  hypothetical protein  24.45 
 
 
1219 aa  65.5  0.000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000058782  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1630  hypothetical protein  23.42 
 
 
1219 aa  65.1  0.000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00254693  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0337  conserved hypothetical protein, predicted ATP/GTP-binding protein  23.71 
 
 
605 aa  65.1  0.000000005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1665  hypothetical protein  24.77 
 
 
1219 aa  64.3  0.000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1451  GTP1/OBG family GTPase  24.77 
 
 
1219 aa  64.3  0.000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.472831  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1451  GTP1/OBG family GTPase  22.97 
 
 
1219 aa  64.3  0.000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1595  hypothetical protein  22.97 
 
 
1219 aa  64.3  0.000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1479  hypothetical protein  22.97 
 
 
1219 aa  64.3  0.000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2209  GTP-binding protein  28.7 
 
 
615 aa  63.9  0.00000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3715  hypothetical protein  24.77 
 
 
1219 aa  63.9  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1501  hypothetical protein  25.51 
 
 
1146 aa  63.5  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1530  hypothetical protein  25.51 
 
 
1146 aa  63.5  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.532706  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1701  hypothetical protein  23.58 
 
 
1219 aa  62.8  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0398  Dynamin family protein  23.86 
 
 
674 aa  62.8  0.00000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3241  hypothetical protein  26.29 
 
 
701 aa  61.6  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.424081  normal  0.24585 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2546  hypothetical protein  25.89 
 
 
719 aa  60.1  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0908682 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6880  Dynamin family protein  22.53 
 
 
1164 aa  60.8  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0438  GTP-binding protein  25.65 
 
 
599 aa  59.7  0.0000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2196  dynamin family protein  21.56 
 
 
506 aa  59.3  0.0000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000046764 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0373  hypothetical protein  42.67 
 
 
737 aa  58.9  0.0000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1225  hypothetical protein  27.57 
 
 
793 aa  58.5  0.0000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.640343  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1013  hypothetical protein  25.97 
 
 
1145 aa  57.4  0.000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.445275  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0700  hypothetical protein  23.01 
 
 
652 aa  57  0.000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.471001  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0436  GTP-binding protein  24.34 
 
 
569 aa  57.4  0.000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1545  GTP-binding protein  24.34 
 
 
569 aa  56.6  0.000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.712051  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0404  glucosamine fructose-6-phosphate aminotransferase (isomerizing)  25.74 
 
 
610 aa  56.2  0.000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2425  GTP-binding protein HSR1-related  37.35 
 
 
533 aa  55.5  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3138  hypothetical protein  24.14 
 
 
788 aa  55.1  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0143921  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3725  hypothetical protein  20.63 
 
 
649 aa  55.1  0.000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.24696 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0322  Dynamin family protein  43.55 
 
 
585 aa  55.1  0.000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2213  Dynamin family protein  51.06 
 
 
587 aa  54.7  0.000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4145  hypothetical protein  21.51 
 
 
690 aa  52  0.00004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.487831 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6053  hypothetical protein  37.04 
 
 
570 aa  52  0.00005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0461  GTP-binding protein  24.23 
 
 
569 aa  51.6  0.00005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0612543  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3622  hypothetical protein  20.12 
 
 
654 aa  50.8  0.00009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.300251  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0813  hypothetical protein  23.67 
 
 
516 aa  50.4  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5314  hypothetical protein  20.52 
 
 
952 aa  50.4  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3084  hypothetical protein  21.36 
 
 
627 aa  50.4  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4018  hypothetical protein  25.89 
 
 
814 aa  50.8  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.505763 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36820  hypothetical protein  22.3 
 
 
624 aa  50.1  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.19264 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2968  dynamin family protein  33.33 
 
 
583 aa  48.9  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1653  GTP-binding protein, HSR1-related  38.6 
 
 
524 aa  48.9  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0754256  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1733  hypothetical protein  46.15 
 
 
976 aa  48.1  0.0006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0828  hypothetical protein  22.71 
 
 
516 aa  48.1  0.0007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000529126  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3531  dynamin family protein  37.04 
 
 
585 aa  47.8  0.0008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5964  hypothetical protein  22.33 
 
 
641 aa  47.8  0.0009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0285067  normal  0.193033 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0251  hypothetical protein  26.37 
 
 
819 aa  47.4  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0811563  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0372  hypothetical protein  27.42 
 
 
587 aa  47.4  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4311  hypothetical protein  25.1 
 
 
768 aa  47.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.369673 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1377  dynamin family protein  37.04 
 
 
585 aa  47  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.682843  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4244  GTPase (dynamin-related)-like protein  26.29 
 
 
809 aa  46.2  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.000109098  hitchhiker  0.00000166794 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0273  hypothetical protein  23.87 
 
 
608 aa  46.2  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4205  hypothetical protein  26.29 
 
 
809 aa  46.2  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0914  Dynamin family protein  27.71 
 
 
548 aa  46.2  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.440355 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2424  Dynamin family protein  20.73 
 
 
666 aa  45.8  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3896  hypothetical protein  20.56 
 
 
927 aa  45.4  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5313  hypothetical protein  24.8 
 
 
743 aa  45.4  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3777  hypothetical protein  20.56 
 
 
927 aa  45.4  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00148359 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3609  hypothetical protein  20.56 
 
 
927 aa  45.4  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3805  hypothetical protein  20.88 
 
 
927 aa  45.1  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.206657  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3518  TPR repeat-containing protein  21 
 
 
927 aa  44.7  0.006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1439  Dynamin family protein  42.22 
 
 
546 aa  44.3  0.008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.784928  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0624  hypothetical protein  24.32 
 
 
602 aa  44.3  0.009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.318926  normal  0.0782013 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>