67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_2425 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_2425  GTP-binding protein HSR1-related  100 
 
 
533 aa  1098    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1653  GTP-binding protein, HSR1-related  50.48 
 
 
524 aa  494  9.999999999999999e-139  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0754256  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1653  GTP-binding protein, HSR1-related  29.39 
 
 
501 aa  179  1e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.481236  normal  0.975567 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1638  GTP-binding protein HSR1-related  28.16 
 
 
501 aa  174  2.9999999999999996e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.178731  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3083  putative GTPase of unknown function  27.33 
 
 
496 aa  166  1.0000000000000001e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3806  GTP-binding protein, HSR1-related  28.18 
 
 
527 aa  137  4e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0425817  normal  0.277341 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0625  isoniazid inductible gene protein IniC  24.78 
 
 
496 aa  137  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0105414  normal  0.124728 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0435  isoniazid inductible gene protein IniC  25.74 
 
 
502 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.495119  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0272  isoniazid inductible gene protein IniC  26.69 
 
 
468 aa  136  9.999999999999999e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0448  isoniazid inductible gene protein IniC  25.51 
 
 
502 aa  134  3e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.608591  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0458  isoniazid inductible gene protein IniC  25.51 
 
 
502 aa  134  3e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.148496  normal  0.646066 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10348  isoniazid inductible gene protein iniC  24.56 
 
 
493 aa  133  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3727  hypothetical protein  30.06 
 
 
503 aa  115  2.0000000000000002e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0286482 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7006  hypothetical protein  30.46 
 
 
497 aa  112  2.0000000000000002e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.707702  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39120  GTPase of unknown function  26.29 
 
 
536 aa  95.9  2e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.480255 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5963  hypothetical protein  23.73 
 
 
610 aa  85.1  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0107791  normal  0.0849156 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0555  hypothetical protein  22.6 
 
 
478 aa  79  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0965162  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0398  Dynamin family protein  32.84 
 
 
674 aa  72.8  0.00000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0860  GTP-binding protein  34.92 
 
 
601 aa  70.1  0.00000000008  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0438  GTP-binding protein  34.92 
 
 
599 aa  68.6  0.0000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0404  glucosamine fructose-6-phosphate aminotransferase (isomerizing)  32.81 
 
 
610 aa  66.2  0.000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2209  GTP-binding protein  30.08 
 
 
615 aa  65.5  0.000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1273  Dynamin family protein  31.21 
 
 
407 aa  63.9  0.000000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000146438  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6880  Dynamin family protein  27.33 
 
 
1164 aa  63.9  0.000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0337  conserved hypothetical protein, predicted ATP/GTP-binding protein  31.3 
 
 
605 aa  62.4  0.00000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0461  GTP-binding protein  28.26 
 
 
569 aa  61.6  0.00000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0612543  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1545  GTP-binding protein  28.99 
 
 
569 aa  60.5  0.00000007  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.712051  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0859  GTP-binding protein  30.83 
 
 
692 aa  60.1  0.0000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.547864  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0436  GTP-binding protein  28.26 
 
 
569 aa  59.3  0.0000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0273  hypothetical protein  26.38 
 
 
608 aa  58.9  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0624  hypothetical protein  26.5 
 
 
602 aa  55.5  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.318926  normal  0.0782013 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5313  hypothetical protein  26.55 
 
 
743 aa  55.1  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0397  Dynamin family protein  37.35 
 
 
789 aa  55.5  0.000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0111735  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1193  hypothetical protein  24.24 
 
 
614 aa  53.5  0.00001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.108086  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3036  dynamin family protein  27.5 
 
 
614 aa  52.4  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0241135  normal  0.688737 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2994  dynamin family protein  27.5 
 
 
614 aa  52.4  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.214598  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0914  Dynamin family protein  23.35 
 
 
548 aa  52.4  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.440355 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6878  Dynamin family protein  25.32 
 
 
620 aa  52  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0815  GTPase  28.97 
 
 
712 aa  52  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0830  hypothetical protein  28.97 
 
 
712 aa  52  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00896739  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0336  conserved hypothetical protein, predicted ATP/GTP-binding protein  39.62 
 
 
741 aa  50.8  0.00007  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0457  hypothetical protein  28.88 
 
 
619 aa  50.1  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.374169  normal  0.488282 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0447  hypothetical protein  28.88 
 
 
619 aa  50.1  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.276019  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0322  Dynamin family protein  28.33 
 
 
585 aa  50.1  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_44250  predicted protein  26.81 
 
 
632 aa  49.7  0.0001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.755773  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0434  hypothetical protein  28.88 
 
 
619 aa  50.1  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.827508  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0460  GTP-binding protein  39.29 
 
 
728 aa  49.3  0.0002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.839985  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1350  dynamin  27.59 
 
 
693 aa  49.3  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0228271 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2968  dynamin family protein  24.69 
 
 
583 aa  49.7  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0933  dynamin family protein  25.81 
 
 
679 aa  48.9  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.807319  hitchhiker  0.00750508 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1546  GTP-binding protein  39.29 
 
 
728 aa  49.3  0.0002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10347  isoniazid inductible gene protein iniA  26.79 
 
 
640 aa  49.3  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.997288 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0435  GTP-binding protein  39.29 
 
 
728 aa  49.3  0.0002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3459  hypothetical protein  28.97 
 
 
568 aa  48.5  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.825542 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2910  dynamin family protein  30.23 
 
 
605 aa  48.1  0.0004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.518789  normal  0.400566 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2424  Dynamin family protein  23.94 
 
 
666 aa  47.8  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3725  hypothetical protein  28.04 
 
 
569 aa  47.8  0.0005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.491681  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2545  dynamin  30.4 
 
 
390 aa  47.4  0.0006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0649757  normal  0.0791445 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7004  GTP-binding protein HSR1-related  32.11 
 
 
610 aa  47.4  0.0006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.793634  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1439  Dynamin family protein  24.55 
 
 
546 aa  46.6  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.784928  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0403  dynamin family protein  28.17 
 
 
693 aa  46.6  0.001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0437  GTP-binding protein  29.06 
 
 
692 aa  45.8  0.002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2259  Dynamin family protein  25.17 
 
 
444 aa  45.1  0.004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000551632  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39100  GTPase of unknown function  30.19 
 
 
617 aa  44.7  0.005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.0000974304  normal  0.356305 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5314  hypothetical protein  26.96 
 
 
952 aa  44.3  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2547  dynamin  24.8 
 
 
551 aa  43.5  0.009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.164219 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1896  Dynamin family protein  31.25 
 
 
1228 aa  43.5  0.009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00444431  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>