161 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_3036 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_2994  dynamin family protein  100 
 
 		 614 aa  1243    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.214598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3036  dynamin family protein  100 
 
 		 614 aa  1243    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0241135  normal  0.688737 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1193  hypothetical protein  38.94 
 
 		 614 aa  381  1e-104  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.108086  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2910  dynamin family protein  36.38 
 
 		 605 aa  365  1e-100  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.518789  normal  0.400566 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2196  dynamin family protein  31.27 
 
 		 506 aa  273  9e-72  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000046764 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2259  Dynamin family protein  33.9 
 
 		 444 aa  251  3e-65  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000551632  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1095  dynamin  32.36 
 
 		 588 aa  224  4e-57  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.845511  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1273  Dynamin family protein  33.13 
 
 		 407 aa  181  2.9999999999999997e-44  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000146438  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6878  Dynamin family protein  28.24 
 
 		 620 aa  149  1.0000000000000001e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2424  Dynamin family protein  27.68 
 
 		 666 aa  133  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1654  dynamin  27.81 
 
 		 686 aa  123  9.999999999999999e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0311974  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0933  dynamin family protein  29.96 
 
 		 679 aa  122  3e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.807319  hitchhiker  0.00750508 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1439  Dynamin family protein  31.11 
 
 		 546 aa  120  7e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.784928  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0914  Dynamin family protein  31.19 
 
 		 548 aa  119  1.9999999999999998e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.440355 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1350  dynamin  24.59 
 
 		 693 aa  118  3.9999999999999997e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0228271 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2968  dynamin family protein  29.05 
 
 		 583 aa  115  2.0000000000000002e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5314  hypothetical protein  27.44 
 
 		 952 aa  108  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0322  Dynamin family protein  25.78 
 
 		 585 aa  106  1e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0398  Dynamin family protein  27.86 
 
 		 674 aa  104  6e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2213  Dynamin family protein  29.13 
 
 		 587 aa  103  1e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6880  Dynamin family protein  28 
 
 		 1164 aa  100  5e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0632  Dynamin family protein  30.39 
 
 		 589 aa  99  2e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3531  dynamin family protein  26.82 
 
 		 585 aa  98.2  4e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2106  dynamin  32.53 
 
 		 564 aa  96.3  1e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.78205 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5964  hypothetical protein  38.55 
 
 		 641 aa  95.1  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0285067  normal  0.193033 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0460  GTP-binding protein  25.47 
 
 		 728 aa  94.7  4e-18  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.839985  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0435  GTP-binding protein  25 
 
 		 728 aa  94.7  4e-18  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1639  dynamin family protein  30.3 
 
 		 605 aa  95.1  4e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.143429  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1546  GTP-binding protein  25.2 
 
 		 728 aa  93.2  1e-17  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1096  GTP-binding protein, HSR1-related  27.39 
 
 		 664 aa  92.4  2e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1377  dynamin family protein  26.8 
 
 		 585 aa  91.3  5e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.682843  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3084  hypothetical protein  25.92 
 
 		 627 aa  90.9  6e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0438  GTP-binding protein  31.65 
 
 		 599 aa  90.1  1e-16  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1654  dynamin family protein  29.7 
 
 		 603 aa  89  3e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.964955 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2209  GTP-binding protein  27.8 
 
 		 615 aa  87.4  6e-16  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0397  Dynamin family protein  24.4 
 
 		 789 aa  84.3  0.000000000000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0111735  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3729  hypothetical protein  33.13 
 
 		 626 aa  84.3  0.000000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.731679  normal  0.057897 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_44250  predicted protein  26.64 
 
 		 632 aa  83.6  0.000000000000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.755773  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0336  conserved hypothetical protein, predicted ATP/GTP-binding protein  24.18 
 
 		 741 aa  83.2  0.00000000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2545  dynamin  27.27 
 
 		 390 aa  83.2  0.00000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0649757  normal  0.0791445 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0830  hypothetical protein  27.66 
 
 		 712 aa  82.4  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00896739  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0815  GTPase  27.66 
 
 		 712 aa  82.4  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2547  dynamin  29.06 
 
 		 551 aa  81.6  0.00000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.164219 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0437  GTP-binding protein  26.76 
 
 		 692 aa  82  0.00000000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0337  conserved hypothetical protein, predicted ATP/GTP-binding protein  28.71 
 
 		 605 aa  81.3  0.00000000000005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1351  heat shock protein DnaJ-like  25.82 
 
 		 741 aa  80.5  0.00000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0473185 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0382  hypothetical protein  24.21 
 
 		 652 aa  80.1  0.0000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.874173  normal  0.0118752 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0904  hypothetical protein  29.56 
 
 		 658 aa  79.3  0.0000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0860  GTP-binding protein  28.23 
 
 		 601 aa  79  0.0000000000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0273  hypothetical protein  32.28 
 
 		 608 aa  76.6  0.000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3493  hypothetical protein  28.22 
 
 		 709 aa  75.5  0.000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000901673 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4340  hypothetical protein  26.45 
 
 		 655 aa  75.5  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0246276  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3234  hypothetical protein  30.89 
 
 		 675 aa  75.5  0.000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.220852  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0829  hypothetical protein  22.47 
 
 		 660 aa  75.1  0.000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0612198  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0900  hypothetical protein  22.47 
 
 		 660 aa  75.1  0.000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.347456  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0624  hypothetical protein  23.6 
 
 		 602 aa  74.7  0.000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.318926  normal  0.0782013 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0403  dynamin family protein  24.84 
 
 		 693 aa  74.7  0.000000000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2546  hypothetical protein  25.08 
 
 		 719 aa  73.9  0.000000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0908682 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1306  dynamin family protein  24.83 
 
 		 1219 aa  73.6  0.000000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.604786  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0700  hypothetical protein  24.22 
 
 		 652 aa  73.6  0.00000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.471001  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0400  hypothetical protein  27.57 
 
 		 662 aa  72.8  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0733804  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3725  hypothetical protein  23.87 
 
 		 649 aa  72.8  0.00000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.24696 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2392  Dynamin family protein  31.03 
 
 		 1249 aa  72.8  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1298  hypothetical protein  27.62 
 
 		 659 aa  72.4  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.594857  normal  0.225568 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1896  Dynamin family protein  25.66 
 
 		 1228 aa  72.8  0.00000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00444431  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05110  hypothetical protein  23.62 
 
 		 655 aa  72.8  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0490  hypothetical protein  23.62 
 
 		 655 aa  72.8  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6053  hypothetical protein  31.72 
 
 		 570 aa  72.8  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0282  hypothetical protein  26.09 
 
 		 648 aa  72  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1451  GTP1/OBG family GTPase  31.05 
 
 		 1219 aa  71.2  0.00000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.472831  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0859  GTP-binding protein  23.25 
 
 		 692 aa  71.2  0.00000000005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.547864  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1665  hypothetical protein  31.05 
 
 		 1219 aa  71.2  0.00000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1451  GTP1/OBG family GTPase  31.05 
 
 		 1219 aa  71.2  0.00000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5428  hypothetical protein  24.28 
 
 		 672 aa  71.2  0.00000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.832093 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1013  hypothetical protein  27 
 
 		 1145 aa  70.5  0.00000000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.445275  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0404  glucosamine fructose-6-phosphate aminotransferase (isomerizing)  26.29 
 
 		 610 aa  70.5  0.00000000009  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1501  hypothetical protein  25.34 
 
 		 1146 aa  70.1  0.0000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1530  hypothetical protein  25.34 
 
 		 1146 aa  70.1  0.0000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.532706  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0787  dynamin family protein  21.87 
 
 		 655 aa  69.7  0.0000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0394271  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1630  hypothetical protein  29.47 
 
 		 1219 aa  69.3  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00254693  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0347  hypothetical protein  28.26 
 
 		 651 aa  68.9  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.512067  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1741  hypothetical protein  24.46 
 
 		 1219 aa  69.3  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000058782  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1545  GTP-binding protein  28.18 
 
 		 569 aa  69.3  0.0000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.712051  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3715  hypothetical protein  29.47 
 
 		 1219 aa  69.3  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1701  hypothetical protein  29.47 
 
 		 1219 aa  68.9  0.0000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1479  hypothetical protein  30.53 
 
 		 1219 aa  68.6  0.0000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1595  hypothetical protein  30.53 
 
 		 1219 aa  68.6  0.0000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1655  hypothetical protein  23.8 
 
 		 659 aa  68.9  0.0000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.92413  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7004  GTP-binding protein HSR1-related  29.95 
 
 		 610 aa  68.9  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.793634  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0436  GTP-binding protein  27.62 
 
 		 569 aa  68.2  0.0000000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1494  dynamin family protein  30 
 
 		 1219 aa  67.4  0.0000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.248245  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3622  hypothetical protein  28.43 
 
 		 654 aa  66.6  0.000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.300251  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0372  hypothetical protein  27.51 
 
 		 587 aa  66.6  0.000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0255  hypothetical protein  24.24 
 
 		 648 aa  66.2  0.000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.142183  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4154  GTPase (dynamin-related)-like protein  21.45 
 
 		 660 aa  66.2  0.000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.67903 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39100  GTPase of unknown function  24.85 
 
 		 617 aa  63.2  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.0000974304  normal  0.356305 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0461  GTP-binding protein  26.82 
 
 		 569 aa  63.2  0.00000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0612543  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1653  GTP-binding protein, HSR1-related  32.52 
 
 		 524 aa  63.2  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0754256  normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5313  hypothetical protein  25.31 
 
 		 743 aa  62.4  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0556  GTP-binding protein HSR1-related  26.01 
 
 		 602 aa  61.2  0.00000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0329351  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>