57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_0382 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_3725  hypothetical protein  52.46 
 
 		 649 aa  657    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.24696 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0382  hypothetical protein  100 
 
 		 652 aa  1319    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.874173  normal  0.0118752 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0700  hypothetical protein  51.94 
 
 		 652 aa  655    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.471001  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3622  hypothetical protein  49.92 
 
 		 654 aa  621  1e-176  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.300251  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0282  hypothetical protein  45.4 
 
 		 648 aa  566  1e-160  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0400  hypothetical protein  44.91 
 
 		 662 aa  565  1.0000000000000001e-159  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0733804  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0347  hypothetical protein  45.21 
 
 		 651 aa  556  1e-157  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.512067  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0255  hypothetical protein  45.24 
 
 		 648 aa  555  1e-156  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.142183  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0294  hypothetical protein  44.88 
 
 		 672 aa  541  9.999999999999999e-153  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0829  hypothetical protein  40.36 
 
 		 660 aa  460  9.999999999999999e-129  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0612198  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0900  hypothetical protein  40.36 
 
 		 660 aa  461  9.999999999999999e-129  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.347456  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5428  hypothetical protein  39.32 
 
 		 672 aa  447  1.0000000000000001e-124  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.832093 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1298  hypothetical protein  40.16 
 
 		 659 aa  443  1e-123  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.594857  normal  0.225568 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3605  hypothetical protein  39.84 
 
 		 653 aa  445  1e-123  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.169107  normal  0.037636 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1655  hypothetical protein  38.74 
 
 		 659 aa  434  1e-120  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.92413  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0904  hypothetical protein  39.67 
 
 		 658 aa  432  1e-119  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4340  hypothetical protein  38.88 
 
 		 655 aa  429  1e-118  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0246276  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3234  hypothetical protein  39.05 
 
 		 675 aa  401  9.999999999999999e-111  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.220852  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2415  hypothetical protein  38.76 
 
 		 648 aa  397  1e-109  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0829723  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3493  hypothetical protein  37.99 
 
 		 709 aa  387  1e-106  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000901673 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4154  GTPase (dynamin-related)-like protein  35.35 
 
 		 660 aa  377  1e-103  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.67903 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0490  hypothetical protein  35.94 
 
 		 655 aa  370  1e-101  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05110  hypothetical protein  35.79 
 
 		 655 aa  368  1e-100  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2756  hypothetical protein  34.33 
 
 		 659 aa  336  7.999999999999999e-91  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2377  hypothetical protein  34.33 
 
 		 659 aa  336  7.999999999999999e-91  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0503347 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0533  GTPase (dynamin-related)  33.61 
 
 		 654 aa  309  1.0000000000000001e-82  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1193  hypothetical protein  28.98 
 
 		 614 aa  86.3  0.000000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.108086  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3036  dynamin family protein  24.21 
 
 		 614 aa  79.3  0.0000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0241135  normal  0.688737 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2994  dynamin family protein  24.21 
 
 		 614 aa  79.3  0.0000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.214598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2910  dynamin family protein  24.92 
 
 		 605 aa  79  0.0000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.518789  normal  0.400566 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1095  dynamin  24.14 
 
 		 588 aa  78.6  0.0000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.845511  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2196  dynamin family protein  29.8 
 
 		 506 aa  73.9  0.000000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000046764 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1350  dynamin  22.43 
 
 		 693 aa  68.6  0.0000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0228271 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0787  dynamin family protein  21.25 
 
 		 655 aa  67  0.0000000009  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0394271  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0914  Dynamin family protein  37.66 
 
 		 548 aa  61.6  0.00000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.440355 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2259  Dynamin family protein  19.38 
 
 		 444 aa  61.2  0.00000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000551632  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1273  Dynamin family protein  27.01 
 
 		 407 aa  60.1  0.0000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000146438  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2968  dynamin family protein  38.51 
 
 		 583 aa  57.8  0.0000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2424  Dynamin family protein  26.43 
 
 		 666 aa  57.8  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3531  dynamin family protein  34.23 
 
 		 585 aa  55.8  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1377  dynamin family protein  29.31 
 
 		 585 aa  55.1  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.682843  normal  1 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_44250  predicted protein  34.48 
 
 		 632 aa  54.3  0.000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.755773  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2546  hypothetical protein  21.2 
 
 		 719 aa  51.6  0.00005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0908682 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0632  Dynamin family protein  28.8 
 
 		 589 aa  50.1  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6878  Dynamin family protein  22.74 
 
 		 620 aa  50.1  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0624  hypothetical protein  25 
 
 		 602 aa  49.3  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.318926  normal  0.0782013 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1654  dynamin  23.18 
 
 		 686 aa  48.1  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0311974  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0322  Dynamin family protein  31.58 
 
 		 585 aa  47.8  0.0007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2213  Dynamin family protein  32.35 
 
 		 587 aa  47  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2106  dynamin  38.27 
 
 		 564 aa  47  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.78205 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3684  hypothetical protein  27.78 
 
 		 794 aa  46.2  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10347  isoniazid inductible gene protein iniA  36.59 
 
 		 640 aa  46.2  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.997288 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0273  hypothetical protein  27.33 
 
 		 608 aa  45.8  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0337  conserved hypothetical protein, predicted ATP/GTP-binding protein  22.09 
 
 		 605 aa  45.4  0.003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3084  hypothetical protein  25 
 
 		 627 aa  45.1  0.005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0556  GTP-binding protein HSR1-related  26.67 
 
 		 602 aa  43.9  0.008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0329351  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1439  Dynamin family protein  38.1 
 
 		 546 aa  43.9  0.01  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.784928  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>