40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_3684 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012912  Dd1591_3684  hypothetical protein  100 
 
 
794 aa  1624    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1396  hypothetical protein  64.91 
 
 
794 aa  995    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.318277 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1070  hypothetical protein  64.46 
 
 
798 aa  996    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0611355 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0312  hypothetical protein  33.17 
 
 
784 aa  418  9.999999999999999e-116  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0131093 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4574  hypothetical protein  32.76 
 
 
742 aa  371  1e-101  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03980  conserved protein with nucleoside triphosphate hydrolase domain  32.49 
 
 
742 aa  369  1e-100  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03941  hypothetical protein  32.49 
 
 
742 aa  369  1e-100  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5622  hypothetical protein  33.15 
 
 
742 aa  366  1e-100  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.889676 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4663  hypothetical protein  33.07 
 
 
742 aa  368  1e-100  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4349  hypothetical protein  33.07 
 
 
742 aa  368  1e-100  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3883  conserved hypothetical protein  33.02 
 
 
742 aa  365  2e-99  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2847  hypothetical protein  63.11 
 
 
227 aa  272  2e-71  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.24978 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2971  hypothetical protein  24.87 
 
 
788 aa  152  2e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.816575  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3138  hypothetical protein  23.64 
 
 
788 aa  59.3  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0143921  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0438  GTP-binding protein  41.18 
 
 
599 aa  52.4  0.00003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1225  hypothetical protein  46.81 
 
 
793 aa  52  0.00005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.640343  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0625  isoniazid inductible gene protein IniC  35.23 
 
 
496 aa  51.2  0.00008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0105414  normal  0.124728 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0787  dynamin family protein  40.98 
 
 
655 aa  50.4  0.0001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0394271  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1896  Dynamin family protein  23.53 
 
 
1228 aa  49.7  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00444431  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1273  Dynamin family protein  39.29 
 
 
407 aa  49.3  0.0003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000146438  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1095  dynamin  37.5 
 
 
588 aa  48.9  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.845511  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0272  isoniazid inductible gene protein IniC  38.57 
 
 
468 aa  47.8  0.0008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0969  Dynamin family protein  24.01 
 
 
648 aa  47  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2910  dynamin family protein  38.98 
 
 
605 aa  47.4  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.518789  normal  0.400566 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1494  dynamin family protein  21.22 
 
 
1219 aa  47  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.248245  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3339  transcriptional regulator, XRE family  36.76 
 
 
733 aa  46.2  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0458  isoniazid inductible gene protein IniC  35.06 
 
 
502 aa  45.8  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.148496  normal  0.646066 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1090  hypothetical protein  25 
 
 
737 aa  45.8  0.003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5313  hypothetical protein  28.8 
 
 
743 aa  45.8  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0448  isoniazid inductible gene protein IniC  35.06 
 
 
502 aa  45.8  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.608591  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0435  isoniazid inductible gene protein IniC  35.06 
 
 
502 aa  45.8  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.495119  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0933  dynamin family protein  44.23 
 
 
679 aa  45.4  0.004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.807319  hitchhiker  0.00750508 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6053  hypothetical protein  43.75 
 
 
570 aa  45.4  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1451  GTP1/OBG family GTPase  24.35 
 
 
1219 aa  44.7  0.007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1350  dynamin  33.33 
 
 
693 aa  44.7  0.007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0228271 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1630  hypothetical protein  23.21 
 
 
1219 aa  44.7  0.008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00254693  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1595  hypothetical protein  24.35 
 
 
1219 aa  44.3  0.008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1479  hypothetical protein  24.35 
 
 
1219 aa  44.3  0.008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1665  hypothetical protein  24.35 
 
 
1219 aa  44.3  0.009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2213  Dynamin family protein  36.23 
 
 
587 aa  44.3  0.009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>