58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_1655 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_5428  hypothetical protein  57.76 
 
 		 672 aa  755    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.832093 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0829  hypothetical protein  63.01 
 
 		 660 aa  833    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0612198  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4340  hypothetical protein  59.13 
 
 		 655 aa  790    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0246276  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0900  hypothetical protein  63.17 
 
 		 660 aa  835    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.347456  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0904  hypothetical protein  69.51 
 
 		 658 aa  882    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3605  hypothetical protein  63.11 
 
 		 653 aa  835    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.169107  normal  0.037636 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1655  hypothetical protein  100 
 
 		 659 aa  1343    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.92413  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1298  hypothetical protein  72.81 
 
 		 659 aa  944    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.594857  normal  0.225568 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3234  hypothetical protein  48.59 
 
 		 675 aa  580  1e-164  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.220852  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3493  hypothetical protein  46.73 
 
 		 709 aa  532  1e-150  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000901673 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3725  hypothetical protein  42.43 
 
 		 649 aa  481  1e-134  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.24696 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0347  hypothetical protein  39.76 
 
 		 651 aa  471  1.0000000000000001e-131  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.512067  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0400  hypothetical protein  38.91 
 
 		 662 aa  464  1e-129  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0733804  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3622  hypothetical protein  40.89 
 
 		 654 aa  461  9.999999999999999e-129  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.300251  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0282  hypothetical protein  38.88 
 
 		 648 aa  461  9.999999999999999e-129  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0294  hypothetical protein  40.59 
 
 		 672 aa  461  9.999999999999999e-129  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0700  hypothetical protein  40.49 
 
 		 652 aa  457  1e-127  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.471001  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0255  hypothetical protein  38.75 
 
 		 648 aa  452  1.0000000000000001e-126  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.142183  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0382  hypothetical protein  38.74 
 
 		 652 aa  450  1e-125  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.874173  normal  0.0118752 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2415  hypothetical protein  36.64 
 
 		 648 aa  373  1e-102  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0829723  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0490  hypothetical protein  37.29 
 
 		 655 aa  328  3e-88  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05110  hypothetical protein  37 
 
 		 655 aa  325  2e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4154  GTPase (dynamin-related)-like protein  34.02 
 
 		 660 aa  325  2e-87  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.67903 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0533  GTPase (dynamin-related)  32.26 
 
 		 654 aa  316  9e-85  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2377  hypothetical protein  31.79 
 
 		 659 aa  281  2e-74  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0503347 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2756  hypothetical protein  31.79 
 
 		 659 aa  281  2e-74  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1193  hypothetical protein  27.41 
 
 		 614 aa  82.8  0.00000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.108086  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2910  dynamin family protein  26.65 
 
 		 605 aa  71.2  0.00000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.518789  normal  0.400566 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3036  dynamin family protein  23.8 
 
 		 614 aa  68.9  0.0000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0241135  normal  0.688737 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2994  dynamin family protein  23.8 
 
 		 614 aa  68.9  0.0000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.214598  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1095  dynamin  30.57 
 
 		 588 aa  63.2  0.00000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.845511  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0787  dynamin family protein  25.2 
 
 		 655 aa  62.8  0.00000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0394271  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2259  Dynamin family protein  20.57 
 
 		 444 aa  60.1  0.0000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000551632  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2196  dynamin family protein  23.94 
 
 		 506 aa  53.5  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000046764 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2424  Dynamin family protein  27.74 
 
 		 666 aa  53.1  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3531  dynamin family protein  36.09 
 
 		 585 aa  52.4  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1654  dynamin  27.56 
 
 		 686 aa  51.2  0.00005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0311974  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6878  Dynamin family protein  22.66 
 
 		 620 aa  50.8  0.00009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1350  dynamin  22.41 
 
 		 693 aa  50.1  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0228271 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2968  dynamin family protein  31.82 
 
 		 583 aa  48.9  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2546  hypothetical protein  23.04 
 
 		 719 aa  48.9  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0908682 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0322  Dynamin family protein  32.17 
 
 		 585 aa  48.5  0.0004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_44250  predicted protein  30.5 
 
 		 632 aa  48.1  0.0005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.755773  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36820  hypothetical protein  25.76 
 
 		 624 aa  48.1  0.0006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.19264 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1654  dynamin family protein  27.27 
 
 		 603 aa  47.8  0.0006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.964955 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4018  hypothetical protein  24.34 
 
 		 814 aa  47  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.505763 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0914  Dynamin family protein  34.65 
 
 		 548 aa  46.6  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.440355 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1639  dynamin family protein  24.87 
 
 		 605 aa  46.2  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.143429  normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5314  hypothetical protein  21.27 
 
 		 952 aa  45.4  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1377  dynamin family protein  32.12 
 
 		 585 aa  45.8  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.682843  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0251  hypothetical protein  27.03 
 
 		 819 aa  45.4  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0811563  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1701  hypothetical protein  22.27 
 
 		 1219 aa  45.4  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1741  hypothetical protein  22.05 
 
 		 1219 aa  45.1  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000058782  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2392  Dynamin family protein  23.34 
 
 		 1249 aa  44.7  0.005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0859  GTP-binding protein  26.67 
 
 		 692 aa  44.7  0.006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.547864  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1595  hypothetical protein  22.27 
 
 		 1219 aa  44.7  0.006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1479  hypothetical protein  22.27 
 
 		 1219 aa  44.7  0.006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2209  GTP-binding protein  23.68 
 
 		 615 aa  43.9  0.009  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>