57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_0533 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_0533  GTPase (dynamin-related)  100 
 
 
654 aa  1343    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4154  GTPase (dynamin-related)-like protein  47 
 
 
660 aa  599  1e-170  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.67903 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05110  hypothetical protein  45.68 
 
 
655 aa  573  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0490  hypothetical protein  45.52 
 
 
655 aa  570  1e-161  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0700  hypothetical protein  36.63 
 
 
652 aa  367  1e-100  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.471001  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3725  hypothetical protein  33.28 
 
 
649 aa  339  9.999999999999999e-92  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.24696 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3622  hypothetical protein  33.11 
 
 
654 aa  334  4e-90  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.300251  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2415  hypothetical protein  34.88 
 
 
648 aa  326  9e-88  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0829723  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1655  hypothetical protein  33.16 
 
 
659 aa  315  9.999999999999999e-85  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.92413  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1298  hypothetical protein  34.02 
 
 
659 aa  309  9e-83  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.594857  normal  0.225568 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0382  hypothetical protein  33.61 
 
 
652 aa  309  1.0000000000000001e-82  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.874173  normal  0.0118752 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0900  hypothetical protein  31.08 
 
 
660 aa  308  2.0000000000000002e-82  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.347456  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0829  hypothetical protein  31.08 
 
 
660 aa  308  3e-82  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0612198  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0347  hypothetical protein  31.25 
 
 
651 aa  300  5e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.512067  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0904  hypothetical protein  42.28 
 
 
658 aa  297  5e-79  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0400  hypothetical protein  31.16 
 
 
662 aa  296  6e-79  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0733804  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0282  hypothetical protein  29.7 
 
 
648 aa  295  2e-78  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4340  hypothetical protein  43.26 
 
 
655 aa  294  4e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0246276  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5428  hypothetical protein  30.59 
 
 
672 aa  293  5e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.832093 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0294  hypothetical protein  31.27 
 
 
672 aa  292  2e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0255  hypothetical protein  29.86 
 
 
648 aa  290  5.0000000000000004e-77  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.142183  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3605  hypothetical protein  31.41 
 
 
653 aa  290  5.0000000000000004e-77  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.169107  normal  0.037636 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3234  hypothetical protein  32.59 
 
 
675 aa  277  5e-73  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.220852  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3493  hypothetical protein  40.16 
 
 
709 aa  270  8e-71  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000901673 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2377  hypothetical protein  29.27 
 
 
659 aa  266  1e-69  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0503347 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2756  hypothetical protein  29.27 
 
 
659 aa  266  1e-69  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2910  dynamin family protein  23.88 
 
 
605 aa  67  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.518789  normal  0.400566 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1193  hypothetical protein  25.68 
 
 
614 aa  66.2  0.000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.108086  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2196  dynamin family protein  24.58 
 
 
506 aa  59.3  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000046764 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1095  dynamin  23.99 
 
 
588 aa  59.3  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.845511  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2424  Dynamin family protein  22.89 
 
 
666 aa  58.2  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3036  dynamin family protein  22.43 
 
 
614 aa  58.2  0.0000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0241135  normal  0.688737 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2994  dynamin family protein  22.43 
 
 
614 aa  58.2  0.0000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.214598  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4018  hypothetical protein  26.52 
 
 
814 aa  56.2  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.505763 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2968  dynamin family protein  33.57 
 
 
583 aa  53.1  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5314  hypothetical protein  21.49 
 
 
952 aa  51.6  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1273  Dynamin family protein  30.22 
 
 
407 aa  50.8  0.00007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000146438  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2546  hypothetical protein  23.24 
 
 
719 aa  50.8  0.00007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0908682 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2259  Dynamin family protein  21.53 
 
 
444 aa  50.4  0.00009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000551632  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_44250  predicted protein  28.67 
 
 
632 aa  49.7  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.755773  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0914  Dynamin family protein  29.91 
 
 
548 aa  49.3  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.440355 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2545  dynamin  22.98 
 
 
390 aa  49.3  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0649757  normal  0.0791445 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1439  Dynamin family protein  29.86 
 
 
546 aa  48.9  0.0003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.784928  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2209  GTP-binding protein  22.95 
 
 
615 aa  48.1  0.0005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3531  dynamin family protein  29.45 
 
 
585 aa  48.1  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4205  hypothetical protein  22.55 
 
 
809 aa  46.2  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1377  dynamin family protein  28.97 
 
 
585 aa  46.2  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.682843  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0436  GTP-binding protein  22.01 
 
 
569 aa  46.6  0.002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4244  GTPase (dynamin-related)-like protein  22.55 
 
 
809 aa  46.2  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.000109098  hitchhiker  0.00000166794 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0398  Dynamin family protein  22.1 
 
 
674 aa  46.2  0.002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0251  hypothetical protein  24.21 
 
 
819 aa  46.6  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0811563  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0787  dynamin family protein  21.79 
 
 
655 aa  45.8  0.003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0394271  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0434  hypothetical protein  23.65 
 
 
619 aa  45.4  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.827508  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0457  hypothetical protein  23.65 
 
 
619 aa  45.8  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.374169  normal  0.488282 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0447  hypothetical protein  23.65 
 
 
619 aa  45.8  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.276019  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1350  dynamin  22.96 
 
 
693 aa  45.1  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0228271 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0404  glucosamine fructose-6-phosphate aminotransferase (isomerizing)  22.71 
 
 
610 aa  44.7  0.006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>