105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_2546 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008312  Tery_2546  hypothetical protein  100 
 
 		 719 aa  1462    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0908682 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2545  dynamin  64.84 
 
 		 390 aa  430  1e-119  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0649757  normal  0.0791445 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1350  dynamin  26.68 
 
 		 693 aa  243  1e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0228271 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1095  dynamin  28.31 
 
 		 588 aa  106  1e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.845511  normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5314  hypothetical protein  22.17 
 
 		 952 aa  106  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2910  dynamin family protein  27.27 
 
 		 605 aa  101  4e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.518789  normal  0.400566 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2259  Dynamin family protein  26.33 
 
 		 444 aa  84.3  0.000000000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000551632  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1193  hypothetical protein  22.08 
 
 		 614 aa  84.3  0.000000000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.108086  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6878  Dynamin family protein  27.12 
 
 		 620 aa  83.2  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2994  dynamin family protein  25.52 
 
 		 614 aa  79.3  0.0000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.214598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3036  dynamin family protein  25.52 
 
 		 614 aa  79.3  0.0000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0241135  normal  0.688737 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1351  heat shock protein DnaJ-like  27.98 
 
 		 741 aa  77  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0473185 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1273  Dynamin family protein  25.14 
 
 		 407 aa  73.6  0.00000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000146438  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0815  GTPase  27.07 
 
 		 712 aa  72.4  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0398  Dynamin family protein  29.17 
 
 		 674 aa  73.2  0.00000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0830  hypothetical protein  27.07 
 
 		 712 aa  72.4  0.00000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00896739  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1439  Dynamin family protein  25.18 
 
 		 546 aa  72  0.00000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.784928  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2547  dynamin  28.74 
 
 		 551 aa  68.6  0.0000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.164219 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3084  hypothetical protein  25.56 
 
 		 627 aa  68.9  0.0000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1639  dynamin family protein  26.42 
 
 		 605 aa  67.8  0.0000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.143429  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2424  Dynamin family protein  27.23 
 
 		 666 aa  67.8  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0624  hypothetical protein  24.71 
 
 		 602 aa  67.4  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.318926  normal  0.0782013 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0933  dynamin family protein  22.64 
 
 		 679 aa  67  0.000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.807319  hitchhiker  0.00750508 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2213  Dynamin family protein  22.8 
 
 		 587 aa  65.1  0.000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1654  dynamin family protein  25.79 
 
 		 603 aa  64.7  0.000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.964955 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6880  Dynamin family protein  23.57 
 
 		 1164 aa  64.7  0.000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2209  GTP-binding protein  33.33 
 
 		 615 aa  63.9  0.00000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0556  GTP-binding protein HSR1-related  24 
 
 		 602 aa  63.5  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0329351  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0322  Dynamin family protein  21.03 
 
 		 585 aa  61.2  0.00000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0860  GTP-binding protein  27.95 
 
 		 601 aa  61.2  0.00000007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2968  dynamin family protein  22.49 
 
 		 583 aa  61.2  0.00000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3725  hypothetical protein  25 
 
 		 649 aa  60.5  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.24696 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0337  conserved hypothetical protein, predicted ATP/GTP-binding protein  33.59 
 
 		 605 aa  60.1  0.0000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3622  hypothetical protein  22.75 
 
 		 654 aa  59.7  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.300251  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0914  Dynamin family protein  25.88 
 
 		 548 aa  59.3  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.440355 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0397  Dynamin family protein  26.63 
 
 		 789 aa  59.7  0.0000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0111735  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2106  dynamin  22.5 
 
 		 564 aa  58.9  0.0000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.78205 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0273  hypothetical protein  22.94 
 
 		 608 aa  58.9  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1096  GTP-binding protein, HSR1-related  25.79 
 
 		 664 aa  58.2  0.0000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3459  hypothetical protein  23.43 
 
 		 568 aa  57.8  0.0000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.825542 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0438  GTP-binding protein  32.5 
 
 		 599 aa  57  0.000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0404  glucosamine fructose-6-phosphate aminotransferase (isomerizing)  31.69 
 
 		 610 aa  56.6  0.000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0336  conserved hypothetical protein, predicted ATP/GTP-binding protein  25.13 
 
 		 741 aa  57  0.000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3725  hypothetical protein  23.43 
 
 		 569 aa  56.6  0.000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.491681  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0294  hypothetical protein  22.64 
 
 		 672 aa  56.2  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6053  hypothetical protein  30.08 
 
 		 570 aa  56.2  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2377  hypothetical protein  26.48 
 
 		 659 aa  56.6  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0503347 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2756  hypothetical protein  26.48 
 
 		 659 aa  56.6  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0632  Dynamin family protein  25.13 
 
 		 589 aa  55.8  0.000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0900  hypothetical protein  22.14 
 
 		 660 aa  55.1  0.000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.347456  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0829  hypothetical protein  22.14 
 
 		 660 aa  55.1  0.000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0612198  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1225  hypothetical protein  38.71 
 
 		 793 aa  55.1  0.000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.640343  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1377  dynamin family protein  25.42 
 
 		 585 aa  54.7  0.000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.682843  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1653  GTP-binding protein, HSR1-related  26.82 
 
 		 524 aa  53.9  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0754256  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3234  hypothetical protein  23.43 
 
 		 675 aa  53.9  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.220852  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1654  dynamin  25 
 
 		 686 aa  52.4  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0311974  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0372  hypothetical protein  28.17 
 
 		 587 aa  52.4  0.00003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0382  hypothetical protein  21.6 
 
 		 652 aa  51.6  0.00004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.874173  normal  0.0118752 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4340  hypothetical protein  22.14 
 
 		 655 aa  51.6  0.00004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0246276  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36820  hypothetical protein  22.47 
 
 		 624 aa  52  0.00004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.19264 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0461  GTP-binding protein  30.16 
 
 		 569 aa  50.4  0.0001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0612543  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0700  hypothetical protein  23.47 
 
 		 652 aa  50.1  0.0001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.471001  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0533  GTPase (dynamin-related)  23.24 
 
 		 654 aa  50.4  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3605  hypothetical protein  21.6 
 
 		 653 aa  50.4  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.169107  normal  0.037636 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0436  GTP-binding protein  30.4 
 
 		 569 aa  50.4  0.0001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3083  putative GTPase of unknown function  25 
 
 		 496 aa  50.4  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0447  hypothetical protein  23.92 
 
 		 619 aa  49.7  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.276019  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0457  hypothetical protein  23.92 
 
 		 619 aa  49.7  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.374169  normal  0.488282 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0435  GTP-binding protein  25.64 
 
 		 728 aa  49.7  0.0002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0434  hypothetical protein  23.92 
 
 		 619 aa  49.7  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.827508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1545  GTP-binding protein  30.4 
 
 		 569 aa  49.7  0.0002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.712051  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3807  dynamin family protein  22.49 
 
 		 645 aa  49.7  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0702524  normal  0.282695 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1655  hypothetical protein  23.04 
 
 		 659 aa  48.9  0.0003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.92413  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1546  GTP-binding protein  26.18 
 
 		 728 aa  49.3  0.0003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0787  dynamin family protein  27.14 
 
 		 655 aa  48.9  0.0003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0394271  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0460  GTP-binding protein  25.13 
 
 		 728 aa  48.5  0.0004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.839985  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3240  hypothetical protein  22.15 
 
 		 537 aa  48.9  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.41085  normal  0.440891 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4154  GTPase (dynamin-related)-like protein  23.3 
 
 		 660 aa  48.1  0.0005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.67903 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0400  hypothetical protein  21.86 
 
 		 662 aa  47.8  0.0006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0733804  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06897  transmembrane GTPase Fzo1, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G13392)  26.52 
 
 		 935 aa  47.8  0.0007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.456649 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5428  hypothetical protein  23.11 
 
 		 672 aa  47.8  0.0007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.832093 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3531  dynamin family protein  19.32 
 
 		 585 aa  47.4  0.0009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1479  hypothetical protein  28.29 
 
 		 1219 aa  47.4  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1451  GTP1/OBG family GTPase  28.29 
 
 		 1219 aa  47.4  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1451  GTP1/OBG family GTPase  28.29 
 
 		 1219 aa  47.4  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.472831  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2415  hypothetical protein  22.22 
 
 		 648 aa  47.4  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0829723  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1595  hypothetical protein  28.29 
 
 		 1219 aa  47.4  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0403  dynamin family protein  28.66 
 
 		 693 aa  47.4  0.001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1494  dynamin family protein  28.29 
 
 		 1219 aa  47  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.248245  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1741  hypothetical protein  28.29 
 
 		 1219 aa  47.4  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000058782  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1630  hypothetical protein  28.29 
 
 		 1219 aa  47.4  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00254693  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1665  hypothetical protein  28.29 
 
 		 1219 aa  47.4  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1701  hypothetical protein  28.29 
 
 		 1219 aa  46.2  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3865  hypothetical protein  23.16 
 
 		 927 aa  46.2  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3715  hypothetical protein  28.29 
 
 		 1219 aa  46.2  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3805  hypothetical protein  22.63 
 
 		 927 aa  45.8  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.206657  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0490  hypothetical protein  21.63 
 
 		 655 aa  45.4  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1306  dynamin family protein  27.63 
 
 		 1219 aa  45.4  0.004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.604786  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0969  Dynamin family protein  21.22 
 
 		 648 aa  45.1  0.004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05110  hypothetical protein  21.63 
 
 		 655 aa  45.1  0.005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>