78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_3807 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_3807  dynamin family protein  100 
 
 		 645 aa  1251    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0702524  normal  0.282695 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1654  dynamin family protein  32.64 
 
 		 603 aa  250  5e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.964955 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1639  dynamin family protein  32.76 
 
 		 605 aa  248  3e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.143429  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3084  hypothetical protein  30.25 
 
 		 627 aa  246  8e-64  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0624  hypothetical protein  29.61 
 
 		 602 aa  241  2.9999999999999997e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.318926  normal  0.0782013 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0556  GTP-binding protein HSR1-related  32.55 
 
 		 602 aa  233  7.000000000000001e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0329351  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0273  hypothetical protein  31.12 
 
 		 608 aa  233  7.000000000000001e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0447  hypothetical protein  29.73 
 
 		 619 aa  218  4e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.276019  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0457  hypothetical protein  29.73 
 
 		 619 aa  218  4e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.374169  normal  0.488282 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0434  hypothetical protein  29.74 
 
 		 619 aa  216  9.999999999999999e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.827508  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36820  hypothetical protein  29.2 
 
 		 624 aa  204  4e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.19264 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10347  isoniazid inductible gene protein iniA  29.64 
 
 		 640 aa  197  5.000000000000001e-49  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.997288 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1654  dynamin  26.32 
 
 		 686 aa  91.7  4e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0311974  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6878  Dynamin family protein  27.33 
 
 		 620 aa  81.3  0.00000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1095  dynamin  26.9 
 
 		 588 aa  79  0.0000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.845511  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2424  Dynamin family protein  21.09 
 
 		 666 aa  79  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3729  hypothetical protein  30.17 
 
 		 626 aa  78.2  0.0000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.731679  normal  0.057897 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5964  hypothetical protein  25.88 
 
 		 641 aa  74.3  0.000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0285067  normal  0.193033 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1273  Dynamin family protein  31 
 
 		 407 aa  72.4  0.00000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000146438  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1193  hypothetical protein  27.54 
 
 		 614 aa  71.6  0.00000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.108086  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2994  dynamin family protein  28.42 
 
 		 614 aa  65.5  0.000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.214598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3036  dynamin family protein  28.42 
 
 		 614 aa  65.5  0.000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0241135  normal  0.688737 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39100  GTPase of unknown function  28.85 
 
 		 617 aa  65.1  0.000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.0000974304  normal  0.356305 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2546  hypothetical protein  22.67 
 
 		 719 aa  64.7  0.000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0908682 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1149  hypothetical protein  29.3 
 
 		 602 aa  64.3  0.000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.141307  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7004  GTP-binding protein HSR1-related  31.89 
 
 		 610 aa  61.6  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.793634  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4340  hypothetical protein  30.64 
 
 		 655 aa  60.5  0.00000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0246276  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2545  dynamin  23.53 
 
 		 390 aa  58.9  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0649757  normal  0.0791445 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2259  Dynamin family protein  22.75 
 
 		 444 aa  58.2  0.0000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000551632  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2910  dynamin family protein  26.29 
 
 		 605 aa  57.8  0.0000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.518789  normal  0.400566 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1350  dynamin  28.57 
 
 		 693 aa  57.4  0.0000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0228271 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0700  hypothetical protein  26.91 
 
 		 652 aa  57  0.000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.471001  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3605  hypothetical protein  27.24 
 
 		 653 aa  56.6  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.169107  normal  0.037636 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5428  hypothetical protein  26.53 
 
 		 672 aa  55.8  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.832093 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05110  hypothetical protein  24.49 
 
 		 655 aa  55.5  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0294  hypothetical protein  29.96 
 
 		 672 aa  55.5  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0933  dynamin family protein  25.19 
 
 		 679 aa  55.5  0.000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.807319  hitchhiker  0.00750508 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0490  hypothetical protein  24.49 
 
 		 655 aa  55.8  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0282  hypothetical protein  29.13 
 
 		 648 aa  54.7  0.000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0255  hypothetical protein  29.13 
 
 		 648 aa  54.7  0.000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.142183  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0347  hypothetical protein  31.42 
 
 		 651 aa  54.7  0.000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.512067  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3493  hypothetical protein  27.46 
 
 		 709 aa  53.9  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000901673 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3622  hypothetical protein  30.05 
 
 		 654 aa  53.9  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.300251  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0400  hypothetical protein  27.95 
 
 		 662 aa  53.5  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0733804  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4154  GTPase (dynamin-related)-like protein  25.21 
 
 		 660 aa  52.8  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.67903 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0815  GTPase  23.62 
 
 		 712 aa  52.4  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0382  hypothetical protein  27.79 
 
 		 652 aa  52.8  0.00002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.874173  normal  0.0118752 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0438  GTP-binding protein  28.19 
 
 		 599 aa  52.8  0.00002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3725  hypothetical protein  25.87 
 
 		 649 aa  52.4  0.00003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.24696 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0830  hypothetical protein  23.62 
 
 		 712 aa  52.4  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00896739  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0860  GTP-binding protein  25.65 
 
 		 601 aa  51.6  0.00004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0397  Dynamin family protein  21.43 
 
 		 789 aa  51.6  0.00004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0111735  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2377  hypothetical protein  27.39 
 
 		 659 aa  51.6  0.00005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0503347 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2756  hypothetical protein  27.39 
 
 		 659 aa  51.6  0.00005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1351  heat shock protein DnaJ-like  27.91 
 
 		 741 aa  50.4  0.00009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0473185 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1653  GTP-binding protein, HSR1-related  27.84 
 
 		 524 aa  50.4  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0754256  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0337  conserved hypothetical protein, predicted ATP/GTP-binding protein  31.06 
 
 		 605 aa  50.4  0.0001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1655  hypothetical protein  28.09 
 
 		 659 aa  49.7  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.92413  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6880  Dynamin family protein  31.87 
 
 		 1164 aa  48.5  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0859  GTP-binding protein  22.16 
 
 		 692 aa  48.1  0.0006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.547864  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3234  hypothetical protein  28.7 
 
 		 675 aa  47.8  0.0006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.220852  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1896  Dynamin family protein  23.41 
 
 		 1228 aa  47.4  0.0008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00444431  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09991  GTPase SAR1 and related small G proteins  32.18 
 
 		 496 aa  47  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5314  hypothetical protein  24.06 
 
 		 952 aa  46.6  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2425  GTP-binding protein HSR1-related  25.45 
 
 		 533 aa  46.6  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09441  GTPase SAR1 and related small G protein  32.99 
 
 		 499 aa  47  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2415  hypothetical protein  26.53 
 
 		 648 aa  46.6  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0829723  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0322  Dynamin family protein  27.04 
 
 		 585 aa  46.2  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09451  GTPase SAR1  31.96 
 
 		 499 aa  45.8  0.003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0829  hypothetical protein  25.7 
 
 		 660 aa  45.1  0.004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0612198  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2392  Dynamin family protein  23.24 
 
 		 1249 aa  45.1  0.004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0900  hypothetical protein  25.7 
 
 		 660 aa  45.1  0.004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.347456  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1494  dynamin family protein  23.31 
 
 		 1219 aa  44.7  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.248245  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2547  dynamin  25.82 
 
 		 551 aa  44.7  0.005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.164219 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0403  dynamin family protein  24.74 
 
 		 693 aa  44.3  0.008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0914  Dynamin family protein  25.16 
 
 		 548 aa  44.3  0.008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.440355 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1298  hypothetical protein  26.07 
 
 		 659 aa  43.9  0.009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.594857  normal  0.225568 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1302  translation initiation factor IF-2  26.52 
 
 		 602 aa  43.9  0.01  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>