142 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_1639 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_1654  dynamin family protein  95.02 
 
 		 603 aa  1092    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.964955 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1639  dynamin family protein  100 
 
 		 605 aa  1219    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.143429  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0624  hypothetical protein  38.96 
 
 		 602 aa  405  1e-111  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.318926  normal  0.0782013 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3084  hypothetical protein  37.2 
 
 		 627 aa  379  1e-104  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0273  hypothetical protein  37.71 
 
 		 608 aa  376  1e-103  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0447  hypothetical protein  37.19 
 
 		 619 aa  364  3e-99  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.276019  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0457  hypothetical protein  37.19 
 
 		 619 aa  364  3e-99  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.374169  normal  0.488282 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0434  hypothetical protein  37.44 
 
 		 619 aa  363  5.0000000000000005e-99  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.827508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10347  isoniazid inductible gene protein iniA  37.27 
 
 		 640 aa  348  2e-94  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.997288 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0556  GTP-binding protein HSR1-related  35.73 
 
 		 602 aa  320  5e-86  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0329351  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36820  hypothetical protein  32.3 
 
 		 624 aa  277  3e-73  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.19264 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3807  dynamin family protein  33.84 
 
 		 645 aa  218  2.9999999999999998e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0702524  normal  0.282695 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1654  dynamin  27.39 
 
 		 686 aa  139  2e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0311974  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3729  hypothetical protein  39.3 
 
 		 626 aa  117  5e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.731679  normal  0.057897 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2424  Dynamin family protein  22.15 
 
 		 666 aa  116  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39100  GTPase of unknown function  36.1 
 
 		 617 aa  107  8e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.0000974304  normal  0.356305 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7004  GTP-binding protein HSR1-related  37.23 
 
 		 610 aa  105  3e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.793634  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6878  Dynamin family protein  25.87 
 
 		 620 aa  97.8  5e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2994  dynamin family protein  29.48 
 
 		 614 aa  96.3  1e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.214598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3036  dynamin family protein  29.48 
 
 		 614 aa  96.3  1e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0241135  normal  0.688737 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2910  dynamin family protein  31.63 
 
 		 605 aa  96.3  2e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.518789  normal  0.400566 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1193  hypothetical protein  34.24 
 
 		 614 aa  94.7  4e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.108086  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1095  dynamin  25.25 
 
 		 588 aa  94.4  5e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.845511  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1273  Dynamin family protein  31.28 
 
 		 407 aa  92.4  2e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000146438  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2259  Dynamin family protein  28.66 
 
 		 444 aa  89.7  1e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000551632  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1896  Dynamin family protein  30.12 
 
 		 1228 aa  82.8  0.00000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00444431  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2968  dynamin family protein  31.23 
 
 		 583 aa  80.5  0.00000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5964  hypothetical protein  33.33 
 
 		 641 aa  79.3  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0285067  normal  0.193033 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1149  hypothetical protein  25 
 
 		 602 aa  79  0.0000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.141307  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0632  Dynamin family protein  27.21 
 
 		 589 aa  77.4  0.0000000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2392  Dynamin family protein  29.01 
 
 		 1249 aa  74.7  0.000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0933  dynamin family protein  28.87 
 
 		 679 aa  74.7  0.000000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.807319  hitchhiker  0.00750508 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0914  Dynamin family protein  29.23 
 
 		 548 aa  74.7  0.000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.440355 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0322  Dynamin family protein  26.89 
 
 		 585 aa  74.3  0.000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2545  dynamin  25.81 
 
 		 390 aa  73.2  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0649757  normal  0.0791445 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5314  hypothetical protein  30.72 
 
 		 952 aa  73.6  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1439  Dynamin family protein  26.72 
 
 		 546 aa  71.6  0.00000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.784928  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6880  Dynamin family protein  31.21 
 
 		 1164 aa  70.9  0.00000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1350  dynamin  29.87 
 
 		 693 aa  70.5  0.00000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0228271 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2546  hypothetical protein  26.01 
 
 		 719 aa  70.1  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0908682 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1096  GTP-binding protein, HSR1-related  29.45 
 
 		 664 aa  69.3  0.0000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1377  dynamin family protein  27.6 
 
 		 585 aa  68.2  0.0000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.682843  normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5313  hypothetical protein  34.17 
 
 		 743 aa  66.2  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0787  dynamin family protein  25.26 
 
 		 655 aa  65.1  0.000000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0394271  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2196  dynamin family protein  21.49 
 
 		 506 aa  63.2  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000046764 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3083  putative GTPase of unknown function  31.91 
 
 		 496 aa  63.5  0.00000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2213  Dynamin family protein  26.99 
 
 		 587 aa  63.5  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2106  dynamin  26.89 
 
 		 564 aa  62.8  0.00000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.78205 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0438  GTP-binding protein  23.75 
 
 		 599 aa  61.2  0.00000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0815  GTPase  23.06 
 
 		 712 aa  61.2  0.00000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_44250  predicted protein  26.13 
 
 		 632 aa  60.8  0.00000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.755773  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0830  hypothetical protein  26.57 
 
 		 712 aa  60.5  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00896739  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0435  GTP-binding protein  22.22 
 
 		 728 aa  59.7  0.0000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3531  dynamin family protein  28.14 
 
 		 585 aa  60.5  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1479  hypothetical protein  23.31 
 
 		 1219 aa  59.3  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1451  GTP1/OBG family GTPase  23.31 
 
 		 1219 aa  59.3  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1451  GTP1/OBG family GTPase  23.31 
 
 		 1219 aa  59.3  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.472831  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1665  hypothetical protein  23.31 
 
 		 1219 aa  59.7  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1595  hypothetical protein  23.31 
 
 		 1219 aa  59.3  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1741  hypothetical protein  23.31 
 
 		 1219 aa  59.7  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000058782  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1701  hypothetical protein  23.31 
 
 		 1219 aa  58.9  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0460  GTP-binding protein  22.22 
 
 		 728 aa  58.5  0.0000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.839985  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3715  hypothetical protein  21.86 
 
 		 1219 aa  58.9  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1546  GTP-binding protein  21.83 
 
 		 728 aa  58.9  0.0000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1630  hypothetical protein  21.86 
 
 		 1219 aa  58.5  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00254693  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1306  dynamin family protein  23.93 
 
 		 1219 aa  58.5  0.0000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.604786  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1494  dynamin family protein  23.9 
 
 		 1219 aa  58.2  0.0000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.248245  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6053  hypothetical protein  33.33 
 
 		 570 aa  57.8  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1545  GTP-binding protein  30 
 
 		 569 aa  56.6  0.000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.712051  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0436  GTP-binding protein  30 
 
 		 569 aa  55.8  0.000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1653  GTP-binding protein, HSR1-related  28.16 
 
 		 524 aa  55.5  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0754256  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0336  conserved hypothetical protein, predicted ATP/GTP-binding protein  23.43 
 
 		 741 aa  55.1  0.000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2377  hypothetical protein  25.51 
 
 		 659 aa  53.9  0.000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0503347 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2756  hypothetical protein  25.51 
 
 		 659 aa  53.9  0.000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1013  hypothetical protein  19.23 
 
 		 1145 aa  53.5  0.00001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.445275  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0461  GTP-binding protein  30.91 
 
 		 569 aa  53.5  0.00001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0612543  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2958  GTPase  26.67 
 
 		 768 aa  52.4  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.000000016463  unclonable  0.0000121851 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0372  hypothetical protein  29.48 
 
 		 587 aa  52.8  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0337  conserved hypothetical protein, predicted ATP/GTP-binding protein  23.36 
 
 		 605 aa  52  0.00003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3291  small GTP-binding protein domain-containing protein  29.25 
 
 		 492 aa  51.6  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2547  dynamin  23.98 
 
 		 551 aa  52  0.00004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.164219 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2209  GTP-binding protein  28.32 
 
 		 615 aa  51.6  0.00004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3725  hypothetical protein  25.24 
 
 		 649 aa  51.2  0.00006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.24696 
 
 
-
 
NC_006691  CNF03260  conserved hypothetical protein  26.21 
 
 		 887 aa  50.1  0.0001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0625  isoniazid inductible gene protein IniC  44.44 
 
 		 496 aa  49.7  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0105414  normal  0.124728 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3234  hypothetical protein  26.32 
 
 		 675 aa  50.1  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.220852  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1733  hypothetical protein  29.52 
 
 		 976 aa  50.1  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1225  hypothetical protein  34.15 
 
 		 793 aa  49.3  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.640343  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1655  hypothetical protein  24.76 
 
 		 659 aa  49.3  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.92413  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5963  hypothetical protein  30.21 
 
 		 610 aa  49.3  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0107791  normal  0.0849156 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3806  GTP-binding protein, HSR1-related  35.77 
 
 		 527 aa  49.3  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0425817  normal  0.277341 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0533  GTPase (dynamin-related)  24.63 
 
 		 654 aa  48.9  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1501  hypothetical protein  17.54 
 
 		 1146 aa  48.5  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1530  hypothetical protein  17.54 
 
 		 1146 aa  48.5  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.532706  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0312  hypothetical protein  37.04 
 
 		 784 aa  48.5  0.0004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0131093 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1510  GTP-binding protein HSR1-related  21.71 
 
 		 523 aa  48.5  0.0004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4574  hypothetical protein  36.67 
 
 		 742 aa  48.1  0.0004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3493  hypothetical protein  25.6 
 
 		 709 aa  48.1  0.0004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000901673 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3883  conserved hypothetical protein  36.67 
 
 		 742 aa  48.1  0.0005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03941  hypothetical protein  36.67 
 
 		 742 aa  48.1  0.0005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>