49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_4574 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001637  EcDH1_3883  conserved hypothetical protein  97.3 
 
 		 742 aa  1439    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4663  hypothetical protein  97.44 
 
 		 742 aa  1445    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4349  hypothetical protein  97.44 
 
 		 742 aa  1445    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4574  hypothetical protein  100 
 
 		 742 aa  1531    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5622  hypothetical protein  97.3 
 
 		 742 aa  1439    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.889676 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0312  hypothetical protein  60.71 
 
 		 784 aa  938    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0131093 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03941  hypothetical protein  97.44 
 
 		 742 aa  1443    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03980  conserved protein with nucleoside triphosphate hydrolase domain  97.44 
 
 		 742 aa  1443    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1396  hypothetical protein  33.12 
 
 		 794 aa  375  1e-102  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.318277 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1070  hypothetical protein  32.54 
 
 		 798 aa  369  1e-100  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0611355 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3684  hypothetical protein  32.27 
 
 		 794 aa  363  5.0000000000000005e-99  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2971  hypothetical protein  26.51 
 
 		 788 aa  155  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.816575  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3138  hypothetical protein  23.65 
 
 		 788 aa  67.8  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0143921  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1225  hypothetical protein  35.63 
 
 		 793 aa  54.7  0.000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.640343  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0438  GTP-binding protein  34.57 
 
 		 599 aa  53.1  0.00002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3715  hypothetical protein  22.84 
 
 		 1219 aa  52.4  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1595  hypothetical protein  22.99 
 
 		 1219 aa  52  0.00004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1479  hypothetical protein  22.99 
 
 		 1219 aa  52  0.00004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1630  hypothetical protein  22.84 
 
 		 1219 aa  52  0.00004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00254693  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1665  hypothetical protein  22.99 
 
 		 1219 aa  51.6  0.00005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1701  hypothetical protein  22.56 
 
 		 1219 aa  51.6  0.00005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1451  GTP1/OBG family GTPase  22.99 
 
 		 1219 aa  51.6  0.00005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1451  GTP1/OBG family GTPase  22.7 
 
 		 1219 aa  50.8  0.00008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.472831  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1741  hypothetical protein  23.41 
 
 		 1219 aa  50.4  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000058782  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0787  dynamin family protein  38.6 
 
 		 655 aa  49.7  0.0002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0394271  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1095  dynamin  54 
 
 		 588 aa  50.1  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.845511  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0625  isoniazid inductible gene protein IniC  41.79 
 
 		 496 aa  48.9  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0105414  normal  0.124728 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1896  Dynamin family protein  23.2 
 
 		 1228 aa  48.9  0.0004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00444431  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2392  Dynamin family protein  23.81 
 
 		 1249 aa  48.5  0.0005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1273  Dynamin family protein  37.35 
 
 		 407 aa  48.1  0.0006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000146438  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0933  dynamin family protein  34.29 
 
 		 679 aa  48.1  0.0006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.807319  hitchhiker  0.00750508 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0448  isoniazid inductible gene protein IniC  43.55 
 
 		 502 aa  47.4  0.0009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.608591  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0458  isoniazid inductible gene protein IniC  43.55 
 
 		 502 aa  47.4  0.0009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.148496  normal  0.646066 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0435  isoniazid inductible gene protein IniC  43.55 
 
 		 502 aa  47.4  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.495119  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1639  dynamin family protein  45 
 
 		 605 aa  46.2  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.143429  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1306  dynamin family protein  24.4 
 
 		 1219 aa  46.2  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.604786  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2209  GTP-binding protein  42.11 
 
 		 615 aa  45.8  0.003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1096  GTP-binding protein, HSR1-related  30.1 
 
 		 664 aa  45.4  0.004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6053  hypothetical protein  29.37 
 
 		 570 aa  45.4  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0272  isoniazid inductible gene protein IniC  38.81 
 
 		 468 aa  45.4  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1494  dynamin family protein  23.18 
 
 		 1219 aa  45.1  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.248245  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1350  dynamin  38.46 
 
 		 693 aa  45.1  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0228271 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2259  Dynamin family protein  36.62 
 
 		 444 aa  45.1  0.005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000551632  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0435  GTP-binding protein  23.78 
 
 		 728 aa  45.1  0.005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2233  tRNA modification GTPase TrmE  32.17 
 
 		 461 aa  45.1  0.005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1654  dynamin family protein  45 
 
 		 603 aa  44.3  0.008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.964955 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3239  hypothetical protein  25.09 
 
 		 669 aa  44.3  0.008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.983308  normal  0.678486 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1546  GTP-binding protein  23.78 
 
 		 728 aa  44.3  0.009  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0922  hypothetical protein  37.88 
 
 		 766 aa  43.9  0.01  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00229589 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>