109 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_1096 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_1096  GTP-binding protein, HSR1-related  100 
 
 
664 aa  1360    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0933  dynamin family protein  41.22 
 
 
679 aa  475  1e-132  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.807319  hitchhiker  0.00750508 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1095  dynamin  27.92 
 
 
588 aa  104  4e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.845511  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1273  Dynamin family protein  32.32 
 
 
407 aa  95.5  3e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000146438  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1193  hypothetical protein  28.33 
 
 
614 aa  93.6  1e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.108086  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2994  dynamin family protein  27.39 
 
 
614 aa  92.4  2e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.214598  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3036  dynamin family protein  27.39 
 
 
614 aa  92.4  2e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0241135  normal  0.688737 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2259  Dynamin family protein  26.62 
 
 
444 aa  88.6  3e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000551632  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6878  Dynamin family protein  29.41 
 
 
620 aa  87.8  6e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2910  dynamin family protein  25.15 
 
 
605 aa  85.1  0.000000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.518789  normal  0.400566 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0436  GTP-binding protein  40.5 
 
 
569 aa  83.2  0.00000000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2424  Dynamin family protein  34.97 
 
 
666 aa  83.2  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0461  GTP-binding protein  39.67 
 
 
569 aa  81.3  0.00000000000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0612543  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1545  GTP-binding protein  39.67 
 
 
569 aa  79.7  0.0000000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.712051  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2106  dynamin  30.88 
 
 
564 aa  78.2  0.0000000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.78205 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0437  GTP-binding protein  28.05 
 
 
692 aa  75.5  0.000000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2209  GTP-binding protein  35.29 
 
 
615 aa  74.7  0.000000000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0404  glucosamine fructose-6-phosphate aminotransferase (isomerizing)  30.46 
 
 
610 aa  73.2  0.00000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0398  Dynamin family protein  33.33 
 
 
674 aa  73.2  0.00000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1439  Dynamin family protein  29 
 
 
546 aa  72  0.00000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.784928  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1654  dynamin  27.4 
 
 
686 aa  71.2  0.00000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0311974  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0914  Dynamin family protein  28 
 
 
548 aa  70.9  0.00000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.440355 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0632  Dynamin family protein  23.53 
 
 
589 aa  70.9  0.00000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2196  dynamin family protein  28.87 
 
 
506 aa  70.1  0.0000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000046764 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2545  dynamin  28.99 
 
 
390 aa  69.7  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0649757  normal  0.0791445 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1639  dynamin family protein  29.45 
 
 
605 aa  69.7  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.143429  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0438  GTP-binding protein  33.9 
 
 
599 aa  68.6  0.0000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6880  Dynamin family protein  27.69 
 
 
1164 aa  68.6  0.0000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1654  dynamin family protein  28.22 
 
 
603 aa  67.8  0.0000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.964955 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0397  Dynamin family protein  25 
 
 
789 aa  67.4  0.0000000008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0111735  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2213  Dynamin family protein  26 
 
 
587 aa  65.9  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1546  GTP-binding protein  29.7 
 
 
728 aa  65.5  0.000000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0435  GTP-binding protein  27.62 
 
 
728 aa  64.7  0.000000005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0860  GTP-binding protein  28.8 
 
 
601 aa  64.7  0.000000005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0460  GTP-binding protein  27.2 
 
 
728 aa  63.2  0.00000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.839985  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3531  dynamin family protein  27.22 
 
 
585 aa  62.4  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2968  dynamin family protein  25.31 
 
 
583 aa  62.8  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1351  heat shock protein DnaJ-like  31.33 
 
 
741 aa  62  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0473185 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1377  dynamin family protein  24.71 
 
 
585 aa  62  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.682843  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0859  GTP-binding protein  25.5 
 
 
692 aa  61.6  0.00000005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.547864  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0372  hypothetical protein  30.48 
 
 
587 aa  61.2  0.00000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6053  hypothetical protein  27.62 
 
 
570 aa  61.2  0.00000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1013  hypothetical protein  24.1 
 
 
1145 aa  61.2  0.00000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.445275  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3084  hypothetical protein  28.1 
 
 
627 aa  60.5  0.00000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1350  dynamin  26.44 
 
 
693 aa  60.1  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0228271 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1501  hypothetical protein  21.8 
 
 
1146 aa  59.7  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1530  hypothetical protein  21.8 
 
 
1146 aa  59.7  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.532706  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0337  conserved hypothetical protein, predicted ATP/GTP-binding protein  26.17 
 
 
605 aa  59.7  0.0000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2546  hypothetical protein  25.79 
 
 
719 aa  58.5  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0908682 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0322  Dynamin family protein  25.25 
 
 
585 aa  58.9  0.0000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1896  Dynamin family protein  26.32 
 
 
1228 aa  58.5  0.0000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00444431  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0336  conserved hypothetical protein, predicted ATP/GTP-binding protein  23.96 
 
 
741 aa  58.2  0.0000005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_44250  predicted protein  26.04 
 
 
632 aa  55.8  0.000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.755773  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3839  small GTP-binding protein  28.57 
 
 
481 aa  55.5  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.674432 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2958  GTPase  28.39 
 
 
768 aa  54.7  0.000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.000000016463  unclonable  0.0000121851 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3709  small GTP-binding protein  33.66 
 
 
462 aa  54.3  0.000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1741  hypothetical protein  35.05 
 
 
1219 aa  54.3  0.000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000058782  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1630  hypothetical protein  36.08 
 
 
1219 aa  53.9  0.000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00254693  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4509  small GTP-binding protein domain-containing protein  40.3 
 
 
457 aa  53.9  0.000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0815  GTPase  24.75 
 
 
712 aa  53.1  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1701  hypothetical protein  35.05 
 
 
1219 aa  53.1  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0830  hypothetical protein  24.75 
 
 
712 aa  53.1  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00896739  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1451  GTP1/OBG family GTPase  34.02 
 
 
1219 aa  52.8  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1451  GTP1/OBG family GTPase  35.05 
 
 
1219 aa  53.1  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.472831  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0787  dynamin family protein  25.12 
 
 
655 aa  53.1  0.00002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0394271  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1665  hypothetical protein  34.02 
 
 
1219 aa  52.8  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1510  GTP-binding protein HSR1-related  25 
 
 
523 aa  52.4  0.00003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2392  Dynamin family protein  24.23 
 
 
1249 aa  52.4  0.00003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1225  hypothetical protein  37.5 
 
 
793 aa  50.8  0.00007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.640343  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1479  hypothetical protein  32.99 
 
 
1219 aa  50.8  0.00008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1595  hypothetical protein  32.99 
 
 
1219 aa  50.8  0.00008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0497  GTPase  26.02 
 
 
420 aa  50.1  0.0001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3715  hypothetical protein  35.05 
 
 
1219 aa  50.4  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0403  dynamin family protein  23.18 
 
 
693 aa  49.3  0.0002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39120  GTPase of unknown function  32.5 
 
 
536 aa  48.5  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.480255 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1653  GTP-binding protein, HSR1-related  25.41 
 
 
524 aa  48.5  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0754256  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2547  dynamin  26.88 
 
 
551 aa  48.1  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.164219 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6054  hypothetical protein  41.38 
 
 
747 aa  48.1  0.0005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1306  dynamin family protein  57.14 
 
 
1219 aa  48.1  0.0005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.604786  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1494  dynamin family protein  31.87 
 
 
1219 aa  47.8  0.0006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.248245  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5212  small GTP-binding protein  23.41 
 
 
489 aa  48.1  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000545834 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3727  hypothetical protein  29.2 
 
 
503 aa  48.1  0.0006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0286482 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1616  small GTP-binding protein  24.1 
 
 
453 aa  47.8  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00206677 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0374  hypothetical protein  25.41 
 
 
621 aa  47.4  0.0008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2342  small GTP-binding protein  46.15 
 
 
448 aa  47.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0556  GTP-binding protein HSR1-related  25.29 
 
 
602 aa  46.6  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0329351  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7006  hypothetical protein  27.89 
 
 
497 aa  47  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.707702  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2393  small GTP-binding protein  46.15 
 
 
448 aa  47  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3725  hypothetical protein  61.54 
 
 
569 aa  46.2  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.491681  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0624  hypothetical protein  24.87 
 
 
602 aa  46.6  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.318926  normal  0.0782013 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3138  hypothetical protein  24.02 
 
 
788 aa  46.2  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0143921  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3459  hypothetical protein  58.97 
 
 
568 aa  45.8  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.825542 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15631  GTPase SAR1 and related small G protein  25.27 
 
 
440 aa  45.8  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4574  hypothetical protein  30.1 
 
 
742 aa  45.4  0.003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03980  conserved protein with nucleoside triphosphate hydrolase domain  30.1 
 
 
742 aa  45.4  0.004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3883  conserved hypothetical protein  30.1 
 
 
742 aa  45.4  0.004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4349  hypothetical protein  30.1 
 
 
742 aa  45.4  0.004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4663  hypothetical protein  30.1 
 
 
742 aa  45.4  0.004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5622  hypothetical protein  30.1 
 
 
742 aa  45.1  0.004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.889676 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03941  hypothetical protein  30.1 
 
 
742 aa  45.4  0.004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>