48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcHS_A4349 on replicon NC_009800
Organism: Escherichia coli HS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001637  EcDH1_3883  conserved hypothetical protein  98.65 
 
 
742 aa  1508    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4349  hypothetical protein  100 
 
 
742 aa  1531    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4663  hypothetical protein  100 
 
 
742 aa  1531    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4574  hypothetical protein  97.44 
 
 
742 aa  1463    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03980  conserved protein with nucleoside triphosphate hydrolase domain  99.19 
 
 
742 aa  1515    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0312  hypothetical protein  60.97 
 
 
784 aa  937    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0131093 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03941  hypothetical protein  99.19 
 
 
742 aa  1515    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5622  hypothetical protein  98.52 
 
 
742 aa  1506    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.889676 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1396  hypothetical protein  33.33 
 
 
794 aa  384  1e-105  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.318277 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1070  hypothetical protein  33.04 
 
 
798 aa  373  1e-102  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0611355 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3684  hypothetical protein  32.68 
 
 
794 aa  366  1e-99  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2971  hypothetical protein  26.49 
 
 
788 aa  157  5.0000000000000005e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.816575  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3138  hypothetical protein  22.2 
 
 
788 aa  71.6  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0143921  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1225  hypothetical protein  35.63 
 
 
793 aa  55.5  0.000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.640343  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0438  GTP-binding protein  34.57 
 
 
599 aa  53.1  0.00002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3715  hypothetical protein  23.21 
 
 
1219 aa  51.6  0.00005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1630  hypothetical protein  23.21 
 
 
1219 aa  51.2  0.00006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00254693  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1701  hypothetical protein  22.92 
 
 
1219 aa  51.2  0.00007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0787  dynamin family protein  22.94 
 
 
655 aa  51.2  0.00007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0394271  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1665  hypothetical protein  23.37 
 
 
1219 aa  50.4  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1595  hypothetical protein  23.37 
 
 
1219 aa  50.8  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1451  GTP1/OBG family GTPase  23.08 
 
 
1219 aa  50.4  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.472831  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1451  GTP1/OBG family GTPase  23.37 
 
 
1219 aa  50.4  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1479  hypothetical protein  23.37 
 
 
1219 aa  50.8  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1741  hypothetical protein  23.88 
 
 
1219 aa  49.7  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000058782  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1273  Dynamin family protein  38.55 
 
 
407 aa  49.7  0.0002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000146438  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1095  dynamin  54 
 
 
588 aa  49.7  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.845511  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0625  isoniazid inductible gene protein IniC  41.79 
 
 
496 aa  48.9  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0105414  normal  0.124728 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2392  Dynamin family protein  23.45 
 
 
1249 aa  48.5  0.0005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1896  Dynamin family protein  23.2 
 
 
1228 aa  48.5  0.0005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00444431  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0933  dynamin family protein  35.24 
 
 
679 aa  48.1  0.0005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.807319  hitchhiker  0.00750508 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0435  isoniazid inductible gene protein IniC  41.79 
 
 
502 aa  47.4  0.0009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.495119  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0458  isoniazid inductible gene protein IniC  41.79 
 
 
502 aa  47.4  0.0009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.148496  normal  0.646066 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0448  isoniazid inductible gene protein IniC  41.79 
 
 
502 aa  47.4  0.0009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.608591  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1306  dynamin family protein  24.49 
 
 
1219 aa  47.4  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.604786  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6053  hypothetical protein  29.37 
 
 
570 aa  45.8  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1639  dynamin family protein  45 
 
 
605 aa  45.8  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.143429  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2209  GTP-binding protein  42.11 
 
 
615 aa  45.8  0.003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1096  GTP-binding protein, HSR1-related  30.1 
 
 
664 aa  45.4  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1494  dynamin family protein  23.18 
 
 
1219 aa  45.4  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.248245  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2233  tRNA modification GTPase TrmE  32.17 
 
 
461 aa  45.4  0.004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0272  isoniazid inductible gene protein IniC  38.81 
 
 
468 aa  45.4  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1350  dynamin  38.46 
 
 
693 aa  45.1  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0228271 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2259  Dynamin family protein  36.62 
 
 
444 aa  45.1  0.005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000551632  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0435  GTP-binding protein  23.78 
 
 
728 aa  45.1  0.005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0922  hypothetical protein  37.88 
 
 
766 aa  44.7  0.007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00229589 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1654  dynamin family protein  45 
 
 
603 aa  44.3  0.008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.964955 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1546  GTP-binding protein  23.78 
 
 
728 aa  43.9  0.01  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>