132 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_1654 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_1654  dynamin family protein  100 
 
 		 603 aa  1220    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.964955 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1639  dynamin family protein  95.02 
 
 		 605 aa  1091    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.143429  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0624  hypothetical protein  38.8 
 
 		 602 aa  394  1e-108  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.318926  normal  0.0782013 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3084  hypothetical protein  37.09 
 
 		 627 aa  382  1e-104  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0273  hypothetical protein  37.41 
 
 		 608 aa  363  4e-99  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0447  hypothetical protein  37.31 
 
 		 619 aa  354  2e-96  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.276019  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0457  hypothetical protein  37.31 
 
 		 619 aa  354  2e-96  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.374169  normal  0.488282 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0434  hypothetical protein  37.48 
 
 		 619 aa  353  4e-96  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.827508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10347  isoniazid inductible gene protein iniA  37.07 
 
 		 640 aa  343  7e-93  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.997288 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0556  GTP-binding protein HSR1-related  35.08 
 
 		 602 aa  317  4e-85  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0329351  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36820  hypothetical protein  31.81 
 
 		 624 aa  280  6e-74  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.19264 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3807  dynamin family protein  32.95 
 
 		 645 aa  218  2.9999999999999998e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0702524  normal  0.282695 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1654  dynamin  27.13 
 
 		 686 aa  133  9e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0311974  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3729  hypothetical protein  38.35 
 
 		 626 aa  119  1.9999999999999998e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.731679  normal  0.057897 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2424  Dynamin family protein  22.68 
 
 		 666 aa  119  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39100  GTPase of unknown function  36.22 
 
 		 617 aa  112  2.0000000000000002e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.0000974304  normal  0.356305 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7004  GTP-binding protein HSR1-related  35.25 
 
 		 610 aa  107  7e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.793634  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2910  dynamin family protein  31.44 
 
 		 605 aa  94.7  4e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.518789  normal  0.400566 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1095  dynamin  27.04 
 
 		 588 aa  94.4  5e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.845511  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1193  hypothetical protein  34.05 
 
 		 614 aa  94  6e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.108086  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2259  Dynamin family protein  25.84 
 
 		 444 aa  92.4  2e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000551632  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6878  Dynamin family protein  35.83 
 
 		 620 aa  91.7  4e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2994  dynamin family protein  28.9 
 
 		 614 aa  89.7  1e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.214598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3036  dynamin family protein  28.9 
 
 		 614 aa  89.7  1e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0241135  normal  0.688737 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1273  Dynamin family protein  30.81 
 
 		 407 aa  90.1  1e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000146438  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1149  hypothetical protein  25.48 
 
 		 602 aa  87  0.000000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.141307  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2968  dynamin family protein  31.64 
 
 		 583 aa  80.9  0.00000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5964  hypothetical protein  34.5 
 
 		 641 aa  80.5  0.00000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0285067  normal  0.193033 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1896  Dynamin family protein  28.92 
 
 		 1228 aa  79.3  0.0000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00444431  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0322  Dynamin family protein  26.42 
 
 		 585 aa  73.9  0.000000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0632  Dynamin family protein  25.99 
 
 		 589 aa  73.2  0.00000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0914  Dynamin family protein  29.35 
 
 		 548 aa  72.8  0.00000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.440355 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1350  dynamin  29.87 
 
 		 693 aa  72  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0228271 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2392  Dynamin family protein  27.61 
 
 		 1249 aa  71.2  0.00000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6880  Dynamin family protein  31.21 
 
 		 1164 aa  70.9  0.00000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2545  dynamin  25.27 
 
 		 390 aa  70.1  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0649757  normal  0.0791445 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5314  hypothetical protein  31.33 
 
 		 952 aa  70.1  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0933  dynamin family protein  27.18 
 
 		 679 aa  68.9  0.0000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.807319  hitchhiker  0.00750508 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1377  dynamin family protein  26.55 
 
 		 585 aa  67.4  0.0000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.682843  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1096  GTP-binding protein, HSR1-related  28.22 
 
 		 664 aa  67  0.0000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1439  Dynamin family protein  26.15 
 
 		 546 aa  67  0.0000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.784928  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2106  dynamin  27.27 
 
 		 564 aa  67  0.000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.78205 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2546  hypothetical protein  25.43 
 
 		 719 aa  66.6  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0908682 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5313  hypothetical protein  35 
 
 		 743 aa  65.5  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0438  GTP-binding protein  24.64 
 
 		 599 aa  64.7  0.000000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0815  GTPase  27.5 
 
 		 712 aa  63.9  0.000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0830  hypothetical protein  27.5 
 
 		 712 aa  63.5  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00896739  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_44250  predicted protein  25.98 
 
 		 632 aa  63.2  0.00000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.755773  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2213  Dynamin family protein  25.93 
 
 		 587 aa  62.4  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0787  dynamin family protein  25.26 
 
 		 655 aa  60.5  0.00000009  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0394271  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3531  dynamin family protein  25.38 
 
 		 585 aa  60.5  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2196  dynamin family protein  24.41 
 
 		 506 aa  58.2  0.0000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000046764 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1306  dynamin family protein  22.41 
 
 		 1219 aa  58.2  0.0000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.604786  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1479  hypothetical protein  21.84 
 
 		 1219 aa  57.8  0.0000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1451  GTP1/OBG family GTPase  21.84 
 
 		 1219 aa  57.8  0.0000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1451  GTP1/OBG family GTPase  21.84 
 
 		 1219 aa  57.8  0.0000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.472831  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1595  hypothetical protein  21.84 
 
 		 1219 aa  57.8  0.0000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0435  GTP-binding protein  21.6 
 
 		 728 aa  57.8  0.0000005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1741  hypothetical protein  21.84 
 
 		 1219 aa  58.2  0.0000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000058782  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1665  hypothetical protein  21.84 
 
 		 1219 aa  57.8  0.0000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3715  hypothetical protein  20.62 
 
 		 1219 aa  57.4  0.0000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3083  putative GTPase of unknown function  33.8 
 
 		 496 aa  57.4  0.0000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1701  hypothetical protein  21.84 
 
 		 1219 aa  57.4  0.0000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1653  GTP-binding protein, HSR1-related  29.76 
 
 		 524 aa  57  0.0000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0754256  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1546  GTP-binding protein  21.2 
 
 		 728 aa  57  0.0000009  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1630  hypothetical protein  20.62 
 
 		 1219 aa  57  0.0000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00254693  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0460  GTP-binding protein  21.6 
 
 		 728 aa  56.6  0.000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.839985  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1494  dynamin family protein  21.76 
 
 		 1219 aa  57  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.248245  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1545  GTP-binding protein  28.83 
 
 		 569 aa  55.1  0.000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.712051  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2547  dynamin  29.1 
 
 		 551 aa  55.1  0.000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.164219 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6053  hypothetical protein  32.64 
 
 		 570 aa  54.7  0.000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0436  GTP-binding protein  28.83 
 
 		 569 aa  54.3  0.000006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2377  hypothetical protein  24.28 
 
 		 659 aa  53.9  0.000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0503347 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2756  hypothetical protein  24.28 
 
 		 659 aa  53.9  0.000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3725  hypothetical protein  24.65 
 
 		 649 aa  53.1  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.24696 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0336  conserved hypothetical protein, predicted ATP/GTP-binding protein  23.31 
 
 		 741 aa  52.4  0.00003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2958  GTPase  26.67 
 
 		 768 aa  51.6  0.00004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.000000016463  unclonable  0.0000121851 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0282  hypothetical protein  27.04 
 
 		 648 aa  51.6  0.00004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0255  hypothetical protein  27.04 
 
 		 648 aa  51.6  0.00004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.142183  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1013  hypothetical protein  18.33 
 
 		 1145 aa  50.8  0.00006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.445275  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0372  hypothetical protein  27.71 
 
 		 587 aa  50.8  0.00006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4340  hypothetical protein  24.91 
 
 		 655 aa  50.8  0.00007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0246276  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0337  conserved hypothetical protein, predicted ATP/GTP-binding protein  24.29 
 
 		 605 aa  50.8  0.00007  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1510  GTP-binding protein HSR1-related  22.29 
 
 		 523 aa  50.8  0.00007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1655  hypothetical protein  27.01 
 
 		 659 aa  50.8  0.00008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.92413  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0900  hypothetical protein  26.27 
 
 		 660 aa  50.4  0.00009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.347456  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0829  hypothetical protein  26.27 
 
 		 660 aa  50.4  0.00009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0612198  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0400  hypothetical protein  26.07 
 
 		 662 aa  50.4  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0733804  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0461  GTP-binding protein  29.09 
 
 		 569 aa  50.1  0.0001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0612543  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1501  hypothetical protein  18.39 
 
 		 1146 aa  50.1  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1530  hypothetical protein  18.39 
 
 		 1146 aa  50.1  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.532706  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1733  hypothetical protein  29.52 
 
 		 976 aa  50.4  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7006  hypothetical protein  34.81 
 
 		 497 aa  49.3  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.707702  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39120  GTPase of unknown function  33.33 
 
 		 536 aa  48.9  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.480255 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3727  hypothetical protein  35.09 
 
 		 503 aa  49.3  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0286482 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3622  hypothetical protein  26.54 
 
 		 654 aa  48.9  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.300251  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0347  hypothetical protein  26 
 
 		 651 aa  48.9  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.512067  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0294  hypothetical protein  25.12 
 
 		 672 aa  48.9  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2209  GTP-binding protein  26.55 
 
 		 615 aa  48.1  0.0005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0625  isoniazid inductible gene protein IniC  44.44 
 
 		 496 aa  47.8  0.0006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0105414  normal  0.124728 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>