129 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_0438 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008599  CFF8240_0438  GTP-binding protein  100 
 
 		 599 aa  1198    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2209  GTP-binding protein  44.21 
 
 		 615 aa  497  1e-139  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0860  GTP-binding protein  44.2 
 
 		 601 aa  474  1e-132  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0404  glucosamine fructose-6-phosphate aminotransferase (isomerizing)  36.35 
 
 		 610 aa  366  1e-100  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0337  conserved hypothetical protein, predicted ATP/GTP-binding protein  35.59 
 
 		 605 aa  331  2e-89  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1545  GTP-binding protein  36.33 
 
 		 569 aa  302  1e-80  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.712051  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0436  GTP-binding protein  36.13 
 
 		 569 aa  298  2e-79  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0398  Dynamin family protein  31.52 
 
 		 674 aa  292  1e-77  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0461  GTP-binding protein  35.39 
 
 		 569 aa  290  5.0000000000000004e-77  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0612543  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6880  Dynamin family protein  30.29 
 
 		 1164 aa  102  2e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6878  Dynamin family protein  31.8 
 
 		 620 aa  95.5  2e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2259  Dynamin family protein  27.71 
 
 		 444 aa  93.2  1e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000551632  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2994  dynamin family protein  31.65 
 
 		 614 aa  90.1  1e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.214598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3036  dynamin family protein  31.65 
 
 		 614 aa  90.1  1e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0241135  normal  0.688737 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2910  dynamin family protein  25.75 
 
 		 605 aa  89.4  2e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.518789  normal  0.400566 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3240  hypothetical protein  33.13 
 
 		 537 aa  88.6  3e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.41085  normal  0.440891 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0933  dynamin family protein  31.77 
 
 		 679 aa  86.3  0.000000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.807319  hitchhiker  0.00750508 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0914  Dynamin family protein  26.28 
 
 		 548 aa  86.3  0.000000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.440355 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2213  Dynamin family protein  27.51 
 
 		 587 aa  79.3  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1095  dynamin  32.52 
 
 		 588 aa  78.6  0.0000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.845511  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1273  Dynamin family protein  27.24 
 
 		 407 aa  78.2  0.0000000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000146438  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6053  hypothetical protein  42.86 
 
 		 570 aa  77.8  0.0000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1439  Dynamin family protein  27.59 
 
 		 546 aa  77.8  0.0000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.784928  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0322  Dynamin family protein  28.12 
 
 		 585 aa  77.4  0.0000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3459  hypothetical protein  33.33 
 
 		 568 aa  75.5  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.825542 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3725  hypothetical protein  32.73 
 
 		 569 aa  74.7  0.000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.491681  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1351  heat shock protein DnaJ-like  34.31 
 
 		 741 aa  74.3  0.000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0473185 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0787  dynamin family protein  31.28 
 
 		 655 aa  74.3  0.000000000005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0394271  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1377  dynamin family protein  22.35 
 
 		 585 aa  71.2  0.00000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.682843  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1653  GTP-binding protein, HSR1-related  38.1 
 
 		 524 aa  70.5  0.00000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0754256  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0632  Dynamin family protein  22.78 
 
 		 589 aa  68.9  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3531  dynamin family protein  22.73 
 
 		 585 aa  68.6  0.0000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2425  GTP-binding protein HSR1-related  34.92 
 
 		 533 aa  68.6  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1096  GTP-binding protein, HSR1-related  33.9 
 
 		 664 aa  68.2  0.0000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1510  GTP-binding protein HSR1-related  27.7 
 
 		 523 aa  65.5  0.000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1193  hypothetical protein  29.17 
 
 		 614 aa  64.3  0.000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.108086  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2547  dynamin  27.41 
 
 		 551 aa  64.3  0.000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.164219 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1654  dynamin family protein  24.64 
 
 		 603 aa  63.9  0.000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.964955 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10348  isoniazid inductible gene protein iniC  29.69 
 
 		 493 aa  63.2  0.00000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39120  GTPase of unknown function  30.61 
 
 		 536 aa  62.4  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.480255 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2545  dynamin  30.3 
 
 		 390 aa  62.8  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0649757  normal  0.0791445 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1639  dynamin family protein  24.17 
 
 		 605 aa  61.2  0.00000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.143429  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3083  putative GTPase of unknown function  24.7 
 
 		 496 aa  60.8  0.00000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7006  hypothetical protein  34.75 
 
 		 497 aa  60.5  0.00000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.707702  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0830  hypothetical protein  31.69 
 
 		 712 aa  59.7  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00896739  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0815  GTPase  31.69 
 
 		 712 aa  59.7  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0435  GTP-binding protein  24.9 
 
 		 728 aa  60.1  0.0000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0397  Dynamin family protein  25.65 
 
 		 789 aa  59.7  0.0000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0111735  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1546  GTP-binding protein  25.42 
 
 		 728 aa  59.7  0.0000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5313  hypothetical protein  31.18 
 
 		 743 aa  59.7  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2392  Dynamin family protein  31.9 
 
 		 1249 aa  59.3  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0859  GTP-binding protein  25.65 
 
 		 692 aa  59.3  0.0000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.547864  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0460  GTP-binding protein  25 
 
 		 728 aa  58.9  0.0000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.839985  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2546  hypothetical protein  33.62 
 
 		 719 aa  57.4  0.0000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0908682 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0437  GTP-binding protein  24.54 
 
 		 692 aa  57.4  0.0000008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2106  dynamin  26.96 
 
 		 564 aa  57  0.000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.78205 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0403  dynamin family protein  26.11 
 
 		 693 aa  55.8  0.000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0372  hypothetical protein  27.08 
 
 		 587 aa  55.5  0.000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1451  GTP1/OBG family GTPase  27.17 
 
 		 1219 aa  54.7  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.472831  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1494  dynamin family protein  27.17 
 
 		 1219 aa  55.1  0.000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.248245  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1741  hypothetical protein  27.17 
 
 		 1219 aa  55.1  0.000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000058782  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0556  GTP-binding protein HSR1-related  25.31 
 
 		 602 aa  54.7  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0329351  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1630  hypothetical protein  26.46 
 
 		 1219 aa  54.7  0.000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00254693  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1665  hypothetical protein  27.17 
 
 		 1219 aa  54.7  0.000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1479  hypothetical protein  27.17 
 
 		 1219 aa  54.7  0.000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1451  GTP1/OBG family GTPase  27.17 
 
 		 1219 aa  54.7  0.000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1595  hypothetical protein  27.17 
 
 		 1219 aa  54.7  0.000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0624  hypothetical protein  24.08 
 
 		 602 aa  54.3  0.000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.318926  normal  0.0782013 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1306  dynamin family protein  27.75 
 
 		 1219 aa  54.3  0.000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.604786  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2968  dynamin family protein  29.81 
 
 		 583 aa  54.3  0.000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2424  Dynamin family protein  28.02 
 
 		 666 aa  53.9  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03980  conserved protein with nucleoside triphosphate hydrolase domain  34.57 
 
 		 742 aa  53.1  0.00001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3883  conserved hypothetical protein  34.57 
 
 		 742 aa  53.1  0.00001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1701  hypothetical protein  27.17 
 
 		 1219 aa  53.5  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03941  hypothetical protein  34.57 
 
 		 742 aa  53.1  0.00001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4349  hypothetical protein  34.57 
 
 		 742 aa  53.1  0.00001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4663  hypothetical protein  34.57 
 
 		 742 aa  53.1  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4574  hypothetical protein  34.57 
 
 		 742 aa  53.1  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5622  hypothetical protein  34.57 
 
 		 742 aa  53.1  0.00001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.889676 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3715  hypothetical protein  27.17 
 
 		 1219 aa  53.5  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1350  dynamin  31.25 
 
 		 693 aa  52.8  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0228271 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3684  hypothetical protein  41.18 
 
 		 794 aa  52.8  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_21455  predicted protein  28.78 
 
 		 815 aa  52  0.00003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0312  hypothetical protein  38.46 
 
 		 784 aa  51.6  0.00004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0131093 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0374  hypothetical protein  28.27 
 
 		 621 aa  51.6  0.00004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1896  Dynamin family protein  30.25 
 
 		 1228 aa  50.8  0.00007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00444431  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1070  hypothetical protein  43.18 
 
 		 798 aa  50.8  0.00007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0611355 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1396  hypothetical protein  43.18 
 
 		 794 aa  50.8  0.00007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.318277 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1013  hypothetical protein  25.97 
 
 		 1145 aa  50.4  0.00008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.445275  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6055  hypothetical protein  26.06 
 
 		 696 aa  50.4  0.00008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1733  hypothetical protein  30 
 
 		 976 aa  50.4  0.00009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1654  dynamin  24.51 
 
 		 686 aa  49.7  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0311974  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0273  hypothetical protein  30.26 
 
 		 608 aa  49.7  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3727  hypothetical protein  28.97 
 
 		 503 aa  50.1  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0286482 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_44250  predicted protein  23.2 
 
 		 632 aa  48.9  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.755773  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6054  hypothetical protein  32.93 
 
 		 747 aa  48.5  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1225  hypothetical protein  53.85 
 
 		 793 aa  48.5  0.0004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.640343  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1653  GTP-binding protein, HSR1-related  25.85 
 
 		 501 aa  48.5  0.0004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.481236  normal  0.975567 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1638  GTP-binding protein HSR1-related  25.85 
 
 		 501 aa  48.5  0.0004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.178731  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2958  GTPase  33.03 
 
 		 768 aa  47.8  0.0006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.000000016463  unclonable  0.0000121851 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>