50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_1070 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012912  Dd1591_3684  hypothetical protein  64.46 
 
 		 794 aa  1013    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1396  hypothetical protein  91.1 
 
 		 794 aa  1419    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.318277 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1070  hypothetical protein  100 
 
 		 798 aa  1642    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0611355 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2847  hypothetical protein  100 
 
 		 227 aa  437  1e-121  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.24978 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0312  hypothetical protein  33.5 
 
 		 784 aa  419  9.999999999999999e-116  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0131093 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03941  hypothetical protein  33.47 
 
 		 742 aa  377  1e-103  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03980  conserved protein with nucleoside triphosphate hydrolase domain  33.47 
 
 		 742 aa  377  1e-103  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3883  conserved hypothetical protein  33.2 
 
 		 742 aa  369  1e-101  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5622  hypothetical protein  33.33 
 
 		 742 aa  372  1e-101  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.889676 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4574  hypothetical protein  32.98 
 
 		 742 aa  372  1e-101  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4663  hypothetical protein  33.33 
 
 		 742 aa  370  1e-101  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4349  hypothetical protein  33.33 
 
 		 742 aa  370  1e-101  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2971  hypothetical protein  24.11 
 
 		 788 aa  149  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.816575  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1896  Dynamin family protein  23.7 
 
 		 1228 aa  61.2  0.00000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00444431  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1494  dynamin family protein  24.91 
 
 		 1219 aa  53.9  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.248245  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1225  hypothetical protein  48.15 
 
 		 793 aa  53.9  0.00001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.640343  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1665  hypothetical protein  26.28 
 
 		 1219 aa  52.8  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1451  GTP1/OBG family GTPase  26.28 
 
 		 1219 aa  53.1  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.472831  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1701  hypothetical protein  26.28 
 
 		 1219 aa  52.8  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1479  hypothetical protein  26.28 
 
 		 1219 aa  52.8  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1451  GTP1/OBG family GTPase  26.28 
 
 		 1219 aa  52.8  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1595  hypothetical protein  26.28 
 
 		 1219 aa  52.8  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1741  hypothetical protein  25.69 
 
 		 1219 aa  52  0.00005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000058782  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0438  GTP-binding protein  43.18 
 
 		 599 aa  50.8  0.00009  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3715  hypothetical protein  25.91 
 
 		 1219 aa  50.4  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1630  hypothetical protein  25.36 
 
 		 1219 aa  49.7  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00254693  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0787  dynamin family protein  21.72 
 
 		 655 aa  49.3  0.0003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0394271  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1273  Dynamin family protein  43.55 
 
 		 407 aa  48.5  0.0005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000146438  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1095  dynamin  50 
 
 		 588 aa  48.1  0.0006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.845511  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3339  transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 		 733 aa  48.1  0.0006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0969  Dynamin family protein  25.31 
 
 		 648 aa  47.8  0.0008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1306  dynamin family protein  24.32 
 
 		 1219 aa  47.8  0.0008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.604786  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24700  hypothetical protein  29.55 
 
 		 784 aa  47  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.303383  normal  0.0806263 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2910  dynamin family protein  52.38 
 
 		 605 aa  47.4  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.518789  normal  0.400566 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0625  isoniazid inductible gene protein IniC  38.03 
 
 		 496 aa  47.4  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0105414  normal  0.124728 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0143  transcriptional regulator, XRE family  41.18 
 
 		 825 aa  46.6  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.514651 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3138  hypothetical protein  27.82 
 
 		 788 aa  46.6  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0143921  normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5313  hypothetical protein  41.67 
 
 		 743 aa  46.2  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0435  isoniazid inductible gene protein IniC  50 
 
 		 502 aa  45.8  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.495119  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0458  isoniazid inductible gene protein IniC  50 
 
 		 502 aa  45.8  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.148496  normal  0.646066 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0448  isoniazid inductible gene protein IniC  50 
 
 		 502 aa  45.8  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.608591  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1350  dynamin  47.5 
 
 		 693 aa  45.8  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0228271 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2213  Dynamin family protein  38.89 
 
 		 587 aa  45.4  0.004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0933  dynamin family protein  45.45 
 
 		 679 aa  45.4  0.004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.807319  hitchhiker  0.00750508 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0337  conserved hypothetical protein, predicted ATP/GTP-binding protein  36.73 
 
 		 605 aa  45.4  0.004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1639  dynamin family protein  45 
 
 		 605 aa  45.1  0.005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.143429  normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5314  hypothetical protein  37.88 
 
 		 952 aa  44.7  0.006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6053  hypothetical protein  39.06 
 
 		 570 aa  45.1  0.006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2227  hypothetical protein  22.42 
 
 		 888 aa  44.7  0.008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0272  isoniazid inductible gene protein IniC  47.73 
 
 		 468 aa  44.7  0.008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>