22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_2227 on replicon NC_011726
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011726  PCC8801_2227  hypothetical protein  100 
 
 
888 aa  1807    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4313  hypothetical protein  36.36 
 
 
797 aa  146  1e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.173972  normal  0.605686 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2374  hypothetical protein  40.83 
 
 
137 aa  72  0.00000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2375  hypothetical protein  33.61 
 
 
661 aa  59.3  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1273  Dynamin family protein  24.64 
 
 
407 aa  54.7  0.000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000146438  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2547  dynamin  23.27 
 
 
551 aa  53.9  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.164219 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1351  heat shock protein DnaJ-like  28.17 
 
 
741 aa  50.1  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0473185 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0398  Dynamin family protein  23.84 
 
 
674 aa  48.9  0.0005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3083  putative GTPase of unknown function  41.1 
 
 
496 aa  48.5  0.0006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7006  hypothetical protein  57.5 
 
 
497 aa  47.4  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.707702  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39120  GTPase of unknown function  46.81 
 
 
536 aa  47  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.480255 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0404  glucosamine fructose-6-phosphate aminotransferase (isomerizing)  29.48 
 
 
610 aa  46.6  0.002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1630  hypothetical protein  23.29 
 
 
1219 aa  46.2  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00254693  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1451  GTP1/OBG family GTPase  23.29 
 
 
1219 aa  46.6  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.472831  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1494  dynamin family protein  22.37 
 
 
1219 aa  46.2  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.248245  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28619  mitochondrial dynamin-like GTPase  31.01 
 
 
856 aa  45.8  0.003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.222715  normal  0.433771 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3727  hypothetical protein  43.1 
 
 
503 aa  45.4  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0286482 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3715  hypothetical protein  23.29 
 
 
1219 aa  45.4  0.005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2209  GTP-binding protein  25 
 
 
615 aa  45.1  0.006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0336  conserved hypothetical protein, predicted ATP/GTP-binding protein  28.57 
 
 
741 aa  44.7  0.007  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5963  hypothetical protein  55.88 
 
 
610 aa  45.1  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0107791  normal  0.0849156 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1070  hypothetical protein  22.42 
 
 
798 aa  44.3  0.009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0611355 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>