66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_24700 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_24700  hypothetical protein  100 
 
 		 784 aa  1494    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.303383  normal  0.0806263 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1353  putative ABC transporter  63.37 
 
 		 667 aa  619  1e-176  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00435841  hitchhiker  0.000139423 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2641  putative ABC transporter  61.9 
 
 		 669 aa  570  1e-161  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.374728  normal  0.779452 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1090  hypothetical protein  57.79 
 
 		 737 aa  550  1e-155  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2523  putative ABC transporter  50.54 
 
 		 571 aa  465  1e-129  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08690  hypothetical protein  49.46 
 
 		 602 aa  457  1e-127  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2260  putative ABC transporter  49.55 
 
 		 571 aa  454  1.0000000000000001e-126  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000139745 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08870  hypothetical protein  49.83 
 
 		 566 aa  451  1e-125  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0706838  normal  0.0205572 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0932  hypothetical protein  46.64 
 
 		 650 aa  431  1e-119  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1520  putative ABC transporter  47.22 
 
 		 576 aa  412  1e-113  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.703438  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8871  putative ABC transporter  48.94 
 
 		 629 aa  411  1e-113  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.872872  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1549  putative ABC transporter  47.04 
 
 		 586 aa  409  1e-113  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1572  putative ABC transporter  47.04 
 
 		 586 aa  409  1e-113  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0079  putative ABC transporter  50.27 
 
 		 565 aa  403  1e-111  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.459634  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24320  hypothetical protein  46.56 
 
 		 584 aa  404  1e-111  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3266  putative ABC transporter  47.68 
 
 		 571 aa  402  9.999999999999999e-111  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.025779  normal  0.223838 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1366  putative ABC transporter  44.66 
 
 		 572 aa  375  1e-102  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1324  hypothetical protein  38.87 
 
 		 569 aa  333  5e-90  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.577358  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7362  hypothetical protein  39.23 
 
 		 564 aa  318  3e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0821059  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2560  AAA ATPase  38.86 
 
 		 687 aa  316  9.999999999999999e-85  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3430  putative ABC transporter  36.23 
 
 		 631 aa  271  2.9999999999999997e-71  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.790282  normal  0.301569 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2220  putative ABC transporter  35.37 
 
 		 619 aa  267  7e-70  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1349  hypothetical protein  41.38 
 
 		 566 aa  214  7e-54  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000440573 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1086  hypothetical protein  41.39 
 
 		 551 aa  209  1e-52  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  decreased coverage  0.00952601  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24740  hypothetical protein  37.71 
 
 		 551 aa  187  4e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.043803  normal  0.105516 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0928  hypothetical protein  39.46 
 
 		 540 aa  179  1e-43  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2645  putative transcriptional regulator, TetR family  40.33 
 
 		 526 aa  166  2.0000000000000002e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1736  putative ABC transporter  28.54 
 
 		 556 aa  114  6e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1735  putative ABC transporter  31.54 
 
 		 552 aa  81.6  0.00000000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.43735  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1354  GTP-binding protein HSR1-related protein  33.5 
 
 		 542 aa  69.7  0.0000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0428896  hitchhiker  0.0000949376 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1091  putative ABC transporter  32.27 
 
 		 585 aa  65.1  0.000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.631509  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1394  hypothetical protein  26.33 
 
 		 543 aa  62  0.00000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3265  putative ABC transporter  30.73 
 
 		 532 aa  61.2  0.00000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.169453  normal  0.30236 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24310  hypothetical protein  31.05 
 
 		 568 aa  61.2  0.00000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3997  hypothetical protein  27.35 
 
 		 642 aa  60.5  0.0000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1326  hypothetical protein  29.44 
 
 		 568 aa  59.3  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0933  hypothetical protein  33.54 
 
 		 578 aa  59.7  0.0000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24690  GTPase of unknown function  31.07 
 
 		 539 aa  58.2  0.0000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.6041  normal  0.0378138 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3738  hypothetical protein  28.71 
 
 		 618 aa  57.4  0.0000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2640  GTP-binding protein HSR1-related protein  33.5 
 
 		 550 aa  57.4  0.0000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.133942  normal  0.721182 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0080  GTP-binding protein HSR1-related protein  28.74 
 
 		 532 aa  55.8  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.170633  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2522  putative ABC transporter  27.21 
 
 		 539 aa  55.5  0.000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.504723  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08880  predicted GTPase  32.52 
 
 		 564 aa  54.3  0.000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.141009  normal  0.0562111 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2259  GTP-binding protein HSR1-related  30.62 
 
 		 537 aa  54.3  0.000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000117964 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08700  hypothetical protein  36.08 
 
 		 586 aa  53.9  0.00001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1367  putative ABC transporter  27.83 
 
 		 555 aa  52.8  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.621246  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7361  putative ABC transporter  30.26 
 
 		 547 aa  52  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.901699  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3429  hypothetical protein  27.14 
 
 		 802 aa  52  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.224896 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0914  Dynamin family protein  25.12 
 
 		 548 aa  52  0.00004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.440355 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6775  putative ABC transporter  27.75 
 
 		 589 aa  52  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.122043  normal  0.131288 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0322  Dynamin family protein  28.57 
 
 		 585 aa  51.6  0.00005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2644  ATP-binding membrane protein  32.55 
 
 		 453 aa  50.8  0.00009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.908609 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1519  putative ABC transporter  28.4 
 
 		 525 aa  50.4  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1548  putative ABC transporter  28.02 
 
 		 525 aa  49.7  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2219  GTPase  29.15 
 
 		 673 aa  49.7  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1571  putative ABC transporter  28.02 
 
 		 525 aa  49.7  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5964  hypothetical protein  29.5 
 
 		 641 aa  50.1  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0285067  normal  0.193033 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1350  putative ABC transporter  28.04 
 
 		 524 aa  48.1  0.0006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.43815  hitchhiker  0.000106139 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1070  hypothetical protein  29.55 
 
 		 798 aa  46.6  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0611355 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8870  putative ABC transporter  30.32 
 
 		 590 aa  46.6  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0939636  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2910  dynamin family protein  25.86 
 
 		 605 aa  45.4  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.518789  normal  0.400566 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1087  putative ABC transporter  28.1 
 
 		 523 aa  45.4  0.004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0151577  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2392  Dynamin family protein  27.37 
 
 		 1249 aa  45.1  0.005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24730  predicted GTPase  27.37 
 
 		 517 aa  45.1  0.006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0664672  normal  0.0671171 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2559  putative ABC transporter  26.42 
 
 		 542 aa  44.3  0.009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2106  dynamin  26.52 
 
 		 564 aa  44.3  0.01  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.78205 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>