154 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_0933 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009712  Mboo_0933  dynamin family protein  100 
 
 
679 aa  1386    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.807319  hitchhiker  0.00750508 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1096  GTP-binding protein, HSR1-related  41.22 
 
 
664 aa  466  9.999999999999999e-131  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1273  Dynamin family protein  36.36 
 
 
407 aa  129  2.0000000000000002e-28  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000146438  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2994  dynamin family protein  29.96 
 
 
614 aa  122  3e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.214598  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3036  dynamin family protein  29.96 
 
 
614 aa  122  3e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0241135  normal  0.688737 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1095  dynamin  29.55 
 
 
588 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.845511  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1193  hypothetical protein  29.41 
 
 
614 aa  108  3e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.108086  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6878  Dynamin family protein  32.28 
 
 
620 aa  100  1e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2259  Dynamin family protein  26.34 
 
 
444 aa  100  1e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000551632  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2910  dynamin family protein  25.93 
 
 
605 aa  97.8  6e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.518789  normal  0.400566 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2196  dynamin family protein  31.54 
 
 
506 aa  92  3e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000046764 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0404  glucosamine fructose-6-phosphate aminotransferase (isomerizing)  31.07 
 
 
610 aa  90.9  7e-17  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2106  dynamin  30.35 
 
 
564 aa  86.3  0.000000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.78205 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0438  GTP-binding protein  31.77 
 
 
599 aa  86.3  0.000000000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2424  Dynamin family protein  29.91 
 
 
666 aa  85.1  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0436  GTP-binding protein  33.16 
 
 
569 aa  84  0.000000000000009  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1545  GTP-binding protein  33.16 
 
 
569 aa  84  0.00000000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.712051  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2209  GTP-binding protein  31.28 
 
 
615 aa  82  0.00000000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3084  hypothetical protein  28.96 
 
 
627 aa  82  0.00000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0461  GTP-binding protein  33.15 
 
 
569 aa  80.9  0.00000000000008  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0612543  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0435  GTP-binding protein  25.18 
 
 
728 aa  80.5  0.00000000000009  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0460  GTP-binding protein  24.81 
 
 
728 aa  80.5  0.0000000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.839985  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1546  GTP-binding protein  24.81 
 
 
728 aa  80.1  0.0000000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0398  Dynamin family protein  27.89 
 
 
674 aa  79.3  0.0000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0437  GTP-binding protein  27.66 
 
 
692 aa  79.7  0.0000000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0860  GTP-binding protein  31.72 
 
 
601 aa  79  0.0000000000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0337  conserved hypothetical protein, predicted ATP/GTP-binding protein  28.18 
 
 
605 aa  77.8  0.0000000000006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0397  Dynamin family protein  24.67 
 
 
789 aa  76.3  0.000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0111735  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1654  dynamin  22.87 
 
 
686 aa  75.5  0.000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0311974  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1639  dynamin family protein  28.87 
 
 
605 aa  74.7  0.000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.143429  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2213  Dynamin family protein  26.64 
 
 
587 aa  74.3  0.000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0336  conserved hypothetical protein, predicted ATP/GTP-binding protein  25.81 
 
 
741 aa  72.8  0.00000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0914  Dynamin family protein  27 
 
 
548 aa  72.8  0.00000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.440355 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3531  dynamin family protein  25.62 
 
 
585 aa  72.4  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0273  hypothetical protein  28.21 
 
 
608 aa  72  0.00000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0624  hypothetical protein  29.05 
 
 
602 aa  70.5  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.318926  normal  0.0782013 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0556  GTP-binding protein HSR1-related  31.03 
 
 
602 aa  69.7  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0329351  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1439  Dynamin family protein  26 
 
 
546 aa  69.3  0.0000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.784928  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1654  dynamin family protein  27.32 
 
 
603 aa  68.9  0.0000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.964955 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2545  dynamin  25.79 
 
 
390 aa  68.2  0.0000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0649757  normal  0.0791445 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1351  heat shock protein DnaJ-like  30.86 
 
 
741 aa  66.6  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0473185 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2546  hypothetical protein  22.64 
 
 
719 aa  66.6  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0908682 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0322  Dynamin family protein  25.94 
 
 
585 aa  66.2  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6053  hypothetical protein  26.7 
 
 
570 aa  66.6  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0403  dynamin family protein  22.94 
 
 
693 aa  66.2  0.000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0372  hypothetical protein  27.57 
 
 
587 aa  65.9  0.000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1377  dynamin family protein  25.12 
 
 
585 aa  65.1  0.000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.682843  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0632  Dynamin family protein  24.32 
 
 
589 aa  63.5  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6880  Dynamin family protein  23.83 
 
 
1164 aa  63.5  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0830  hypothetical protein  25.11 
 
 
712 aa  62.8  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00896739  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0815  GTPase  25.11 
 
 
712 aa  62.8  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1350  dynamin  32.76 
 
 
693 aa  63.2  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0228271 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2968  dynamin family protein  24.74 
 
 
583 aa  62  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1501  hypothetical protein  22.34 
 
 
1146 aa  61.6  0.00000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1530  hypothetical protein  22.34 
 
 
1146 aa  61.6  0.00000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.532706  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2958  GTPase  32.23 
 
 
768 aa  60.5  0.00000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.000000016463  unclonable  0.0000121851 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15631  GTPase SAR1 and related small G protein  25.96 
 
 
440 aa  60.1  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0497  GTPase  28.84 
 
 
420 aa  58.9  0.0000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1013  hypothetical protein  19.89 
 
 
1145 aa  58.5  0.0000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.445275  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0787  dynamin family protein  26.78 
 
 
655 aa  57.4  0.0000008  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0394271  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39120  GTPase of unknown function  33.06 
 
 
536 aa  57.4  0.0000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.480255 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0625  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  25.41 
 
 
220 aa  56.6  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0859  GTP-binding protein  26 
 
 
692 aa  57  0.000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.547864  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36820  hypothetical protein  25.11 
 
 
624 aa  56.2  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.19264 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1896  Dynamin family protein  37.68 
 
 
1228 aa  55.5  0.000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00444431  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1225  hypothetical protein  36.76 
 
 
793 aa  55.5  0.000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.640343  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1653  GTP-binding protein, HSR1-related  33.33 
 
 
501 aa  55.5  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.481236  normal  0.975567 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1638  GTP-binding protein HSR1-related  32.61 
 
 
501 aa  55.8  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.178731  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0374  hypothetical protein  25.84 
 
 
621 aa  55.1  0.000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1354  GTP-binding protein HSR1-related protein  27.51 
 
 
542 aa  54.7  0.000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0428896  hitchhiker  0.0000949376 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0447  hypothetical protein  28.38 
 
 
619 aa  54.3  0.000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.276019  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0457  hypothetical protein  28.38 
 
 
619 aa  54.3  0.000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.374169  normal  0.488282 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0434  hypothetical protein  28.38 
 
 
619 aa  54.3  0.000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.827508  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3805  hypothetical protein  22.66 
 
 
927 aa  54.3  0.000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.206657  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1733  hypothetical protein  31.78 
 
 
976 aa  53.1  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3506  TPR repeat-containing protein  22.66 
 
 
927 aa  53.9  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0255227  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2392  Dynamin family protein  42.25 
 
 
1249 aa  53.5  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10348  isoniazid inductible gene protein iniC  30.68 
 
 
493 aa  53.9  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7006  hypothetical protein  31.78 
 
 
497 aa  53.9  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.707702  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3518  TPR repeat-containing protein  22.3 
 
 
927 aa  52.8  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3738  hypothetical protein  29.88 
 
 
618 aa  52.4  0.00003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7004  GTP-binding protein HSR1-related  28.22 
 
 
610 aa  52.4  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.793634  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5314  hypothetical protein  22.64 
 
 
952 aa  52  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1306  dynamin family protein  22.28 
 
 
1219 aa  52  0.00004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.604786  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3777  hypothetical protein  22.3 
 
 
927 aa  51.6  0.00004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00148359 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1630  hypothetical protein  29.94 
 
 
1219 aa  52  0.00004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00254693  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2547  dynamin  23.03 
 
 
551 aa  51.6  0.00005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.164219 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3865  hypothetical protein  21.51 
 
 
927 aa  51.6  0.00005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1701  hypothetical protein  46.81 
 
 
1219 aa  50.8  0.00008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3715  hypothetical protein  46.81 
 
 
1219 aa  50.8  0.00008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1665  hypothetical protein  46.81 
 
 
1219 aa  50.8  0.00009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1479  hypothetical protein  46.81 
 
 
1219 aa  50.8  0.00009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1451  GTP1/OBG family GTPase  46.81 
 
 
1219 aa  50.8  0.00009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1451  GTP1/OBG family GTPase  46.81 
 
 
1219 aa  50.8  0.00009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.472831  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1595  hypothetical protein  46.81 
 
 
1219 aa  50.8  0.00009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1741  hypothetical protein  21.28 
 
 
1219 aa  50.8  0.00009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000058782  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1494  dynamin family protein  20.74 
 
 
1219 aa  50.8  0.00009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.248245  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4311  hypothetical protein  24.79 
 
 
768 aa  50.1  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.369673 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5963  hypothetical protein  30.65 
 
 
610 aa  50.1  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0107791  normal  0.0849156 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5313  hypothetical protein  29.09 
 
 
743 aa  50.4  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>