63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_10348 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_10348  isoniazid inductible gene protein iniC  100 
 
 
493 aa  972    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0625  isoniazid inductible gene protein IniC  75.91 
 
 
496 aa  689    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0105414  normal  0.124728 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0458  isoniazid inductible gene protein IniC  77.8 
 
 
502 aa  699    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.148496  normal  0.646066 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0435  isoniazid inductible gene protein IniC  78.01 
 
 
502 aa  699    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.495119  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0272  isoniazid inductible gene protein IniC  77.68 
 
 
468 aa  682    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0448  isoniazid inductible gene protein IniC  77.8 
 
 
502 aa  699    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.608591  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3083  putative GTPase of unknown function  43.32 
 
 
496 aa  345  1e-93  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1653  GTP-binding protein, HSR1-related  40.77 
 
 
501 aa  293  7e-78  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.481236  normal  0.975567 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1638  GTP-binding protein HSR1-related  40.57 
 
 
501 aa  290  6e-77  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.178731  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3806  GTP-binding protein, HSR1-related  35.69 
 
 
527 aa  213  7.999999999999999e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0425817  normal  0.277341 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0555  hypothetical protein  34.98 
 
 
478 aa  201  3e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0965162  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36810  hypothetical protein  31.36 
 
 
420 aa  179  9e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.163741 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1653  GTP-binding protein, HSR1-related  25.51 
 
 
524 aa  156  6e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0754256  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2425  GTP-binding protein HSR1-related  24.56 
 
 
533 aa  134  3e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3727  hypothetical protein  31.57 
 
 
503 aa  126  1e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0286482 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39120  GTPase of unknown function  30.54 
 
 
536 aa  119  9.999999999999999e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.480255 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5963  hypothetical protein  36.09 
 
 
610 aa  119  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0107791  normal  0.0849156 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7006  hypothetical protein  33.72 
 
 
497 aa  118  1.9999999999999998e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.707702  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0398  Dynamin family protein  25.66 
 
 
674 aa  76.3  0.000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1273  Dynamin family protein  33.33 
 
 
407 aa  70.5  0.00000000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000146438  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0860  GTP-binding protein  30.22 
 
 
601 aa  67.4  0.0000000006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2209  GTP-binding protein  25.11 
 
 
615 aa  65.9  0.000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6880  Dynamin family protein  28.89 
 
 
1164 aa  64.7  0.000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0438  GTP-binding protein  29.69 
 
 
599 aa  63.2  0.00000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0273  hypothetical protein  27.21 
 
 
608 aa  61.2  0.00000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2910  dynamin family protein  26.85 
 
 
605 aa  61.2  0.00000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.518789  normal  0.400566 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2259  Dynamin family protein  23.08 
 
 
444 aa  60.1  0.0000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000551632  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2213  Dynamin family protein  32.37 
 
 
587 aa  58.5  0.0000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6878  Dynamin family protein  32.86 
 
 
620 aa  57.8  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3036  dynamin family protein  28.68 
 
 
614 aa  56.2  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0241135  normal  0.688737 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2994  dynamin family protein  28.68 
 
 
614 aa  56.2  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.214598  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2968  dynamin family protein  28.8 
 
 
583 aa  55.5  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1095  dynamin  26.09 
 
 
588 aa  55.8  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.845511  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0787  dynamin family protein  25.81 
 
 
655 aa  54.3  0.000006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0394271  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0933  dynamin family protein  30.68 
 
 
679 aa  53.9  0.000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.807319  hitchhiker  0.00750508 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0830  hypothetical protein  26.63 
 
 
712 aa  53.5  0.000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00896739  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0815  GTPase  26.63 
 
 
712 aa  53.5  0.000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1350  dynamin  31.4 
 
 
693 aa  52.4  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0228271 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3084  hypothetical protein  30.22 
 
 
627 aa  51.2  0.00004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1193  hypothetical protein  25.57 
 
 
614 aa  51.2  0.00005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.108086  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3531  dynamin family protein  28.07 
 
 
585 aa  50.4  0.00006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5313  hypothetical protein  28.92 
 
 
743 aa  50.4  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2545  dynamin  29.9 
 
 
390 aa  50.1  0.00009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0649757  normal  0.0791445 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0337  conserved hypothetical protein, predicted ATP/GTP-binding protein  29.13 
 
 
605 aa  50.1  0.0001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0404  glucosamine fructose-6-phosphate aminotransferase (isomerizing)  24.32 
 
 
610 aa  48.9  0.0002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1377  dynamin family protein  30.56 
 
 
585 aa  49.3  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.682843  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1654  dynamin  28.31 
 
 
686 aa  49.3  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0311974  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0624  hypothetical protein  32.34 
 
 
602 aa  49.3  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.318926  normal  0.0782013 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1733  hypothetical protein  27.83 
 
 
976 aa  48.5  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0322  Dynamin family protein  27.19 
 
 
585 aa  47.8  0.0005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3240  hypothetical protein  47.62 
 
 
537 aa  46.6  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.41085  normal  0.440891 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0922  hypothetical protein  24.64 
 
 
766 aa  45.8  0.002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00229589 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0632  Dynamin family protein  25 
 
 
589 aa  45.4  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0556  GTP-binding protein HSR1-related  31.41 
 
 
602 aa  45.1  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0329351  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6053  hypothetical protein  31.13 
 
 
570 aa  45.1  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5964  hypothetical protein  31.79 
 
 
641 aa  44.7  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0285067  normal  0.193033 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3725  hypothetical protein  45.24 
 
 
569 aa  44.7  0.004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.491681  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3459  hypothetical protein  42.86 
 
 
568 aa  43.9  0.007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.825542 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0914  Dynamin family protein  24.63 
 
 
548 aa  43.9  0.007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.440355 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3684  hypothetical protein  50 
 
 
794 aa  43.5  0.009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1396  hypothetical protein  47.62 
 
 
794 aa  43.5  0.009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.318277 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1070  hypothetical protein  47.62 
 
 
798 aa  43.5  0.01  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0611355 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2424  Dynamin family protein  24.02 
 
 
666 aa  43.5  0.01  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>