49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_3240 on replicon NC_009429
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009429  Rsph17025_3240  hypothetical protein  100 
 
 		 537 aa  1035    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.41085  normal  0.440891 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3725  hypothetical protein  48.58 
 
 		 569 aa  401  9.999999999999999e-111  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.491681  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3459  hypothetical protein  63.7 
 
 		 568 aa  318  2e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.825542 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4146  hypothetical protein  41.5 
 
 		 283 aa  151  3e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.575249 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0438  GTP-binding protein  33.13 
 
 		 599 aa  87.4  6e-16  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0860  GTP-binding protein  34.86 
 
 		 601 aa  82  0.00000000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3242  hypothetical protein  31.67 
 
 		 377 aa  79  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.202403 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6880  Dynamin family protein  33.14 
 
 		 1164 aa  72.4  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2209  GTP-binding protein  34.12 
 
 		 615 aa  72.4  0.00000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0461  GTP-binding protein  26.09 
 
 		 569 aa  66.2  0.000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0612543  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0436  GTP-binding protein  26.49 
 
 		 569 aa  65.9  0.000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0398  Dynamin family protein  26.67 
 
 		 674 aa  64.7  0.000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1545  GTP-binding protein  25.89 
 
 		 569 aa  63.2  0.00000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.712051  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2106  dynamin  29.67 
 
 		 564 aa  62  0.00000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.78205 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1439  Dynamin family protein  31.18 
 
 		 546 aa  61.6  0.00000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.784928  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2213  Dynamin family protein  29.63 
 
 		 587 aa  59.7  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6878  Dynamin family protein  28.82 
 
 		 620 aa  59.3  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1653  GTP-binding protein, HSR1-related  27.1 
 
 		 524 aa  58.9  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0754256  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2968  dynamin family protein  28.29 
 
 		 583 aa  58.5  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0914  Dynamin family protein  31.74 
 
 		 548 aa  58.2  0.0000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.440355 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0337  conserved hypothetical protein, predicted ATP/GTP-binding protein  25.62 
 
 		 605 aa  57.8  0.0000005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0404  glucosamine fructose-6-phosphate aminotransferase (isomerizing)  28.05 
 
 		 610 aa  57.4  0.0000006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1351  heat shock protein DnaJ-like  24.08 
 
 		 741 aa  55.5  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0473185 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3531  dynamin family protein  28.89 
 
 		 585 aa  52.8  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1733  hypothetical protein  24 
 
 		 976 aa  52.4  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2547  dynamin  24.16 
 
 		 551 aa  52  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.164219 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2545  dynamin  23.75 
 
 		 390 aa  50.1  0.00009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0649757  normal  0.0791445 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39120  GTPase of unknown function  30 
 
 		 536 aa  48.9  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.480255 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3083  putative GTPase of unknown function  32.43 
 
 		 496 aa  48.5  0.0003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0625  isoniazid inductible gene protein IniC  50 
 
 		 496 aa  48.5  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0105414  normal  0.124728 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2546  hypothetical protein  22.15 
 
 		 719 aa  48.1  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0908682 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3429  hypothetical protein  25.78 
 
 		 802 aa  47  0.0008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.224896 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0294  hypothetical protein  25.76 
 
 		 672 aa  47  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0448  isoniazid inductible gene protein IniC  47.62 
 
 		 502 aa  46.6  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.608591  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10348  isoniazid inductible gene protein iniC  47.62 
 
 		 493 aa  46.6  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0435  isoniazid inductible gene protein IniC  47.62 
 
 		 502 aa  46.6  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.495119  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0458  isoniazid inductible gene protein IniC  47.62 
 
 		 502 aa  46.6  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.148496  normal  0.646066 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5963  hypothetical protein  27.86 
 
 		 610 aa  45.8  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0107791  normal  0.0849156 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3727  hypothetical protein  26.1 
 
 		 503 aa  45.8  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0286482 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1193  hypothetical protein  28 
 
 		 614 aa  45.4  0.003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.108086  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0632  Dynamin family protein  23.95 
 
 		 589 aa  45.4  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0322  Dynamin family protein  24.26 
 
 		 585 aa  45.4  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2756  hypothetical protein  50.98 
 
 		 659 aa  45.1  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2377  hypothetical protein  50.98 
 
 		 659 aa  45.1  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0503347 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7006  hypothetical protein  31 
 
 		 497 aa  44.3  0.006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.707702  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0272  isoniazid inductible gene protein IniC  45.24 
 
 		 468 aa  44.3  0.006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2994  dynamin family protein  25.15 
 
 		 614 aa  43.9  0.007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.214598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3036  dynamin family protein  25.15 
 
 		 614 aa  43.9  0.007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0241135  normal  0.688737 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1095  dynamin  51.22 
 
 		 588 aa  43.5  0.01  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.845511  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>