21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_3242 on replicon NC_009429
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009429  Rsph17025_3242  hypothetical protein  100 
 
 		 377 aa  738    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.202403 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3240  hypothetical protein  31.63 
 
 		 537 aa  84  0.000000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.41085  normal  0.440891 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3725  hypothetical protein  33.87 
 
 		 569 aa  79  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.491681  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3459  hypothetical protein  34.22 
 
 		 568 aa  77.8  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.825542 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4146  hypothetical protein  30.17 
 
 		 283 aa  70.5  0.00000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.575249 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6880  Dynamin family protein  30.21 
 
 		 1164 aa  68.2  0.0000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0860  GTP-binding protein  18.77 
 
 		 601 aa  58.2  0.0000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0436  GTP-binding protein  26.32 
 
 		 569 aa  57.8  0.0000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0461  GTP-binding protein  25.88 
 
 		 569 aa  56.6  0.0000006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0612543  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3084  hypothetical protein  29.73 
 
 		 627 aa  51.2  0.00003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1545  GTP-binding protein  25.66 
 
 		 569 aa  51.2  0.00003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.712051  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2213  Dynamin family protein  26.81 
 
 		 587 aa  50.4  0.00004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1654  dynamin family protein  28.95 
 
 		 603 aa  47.8  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.964955 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1639  dynamin family protein  28.89 
 
 		 605 aa  47.8  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.143429  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1377  dynamin family protein  29.56 
 
 		 585 aa  47.4  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.682843  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2106  dynamin  29.24 
 
 		 564 aa  47.4  0.0005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.78205 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_44250  predicted protein  25.1 
 
 		 632 aa  46.6  0.0006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.755773  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0398  Dynamin family protein  22.22 
 
 		 674 aa  46.2  0.0008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0438  GTP-binding protein  25.62 
 
 		 599 aa  46.2  0.0008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2547  dynamin  24.86 
 
 		 551 aa  45.1  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.164219 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1351  heat shock protein DnaJ-like  29.25 
 
 		 741 aa  45.1  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0473185 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>