60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_2756 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011206  Lferr_2377  hypothetical protein  100 
 
 		 659 aa  1338    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0503347 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2756  hypothetical protein  100 
 
 		 659 aa  1338    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0382  hypothetical protein  34.33 
 
 		 652 aa  336  7.999999999999999e-91  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.874173  normal  0.0118752 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0700  hypothetical protein  33.22 
 
 		 652 aa  322  9.999999999999999e-87  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.471001  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3622  hypothetical protein  32.21 
 
 		 654 aa  318  2e-85  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.300251  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3725  hypothetical protein  31.79 
 
 		 649 aa  313  6.999999999999999e-84  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.24696 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2415  hypothetical protein  34.52 
 
 		 648 aa  310  6.999999999999999e-83  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0829723  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0282  hypothetical protein  29.86 
 
 		 648 aa  296  9e-79  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4154  GTPase (dynamin-related)-like protein  31.81 
 
 		 660 aa  296  1e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.67903 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0400  hypothetical protein  29.7 
 
 		 662 aa  295  2e-78  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0733804  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0255  hypothetical protein  29.86 
 
 		 648 aa  291  2e-77  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.142183  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0900  hypothetical protein  30.19 
 
 		 660 aa  289  9e-77  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.347456  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0829  hypothetical protein  30.19 
 
 		 660 aa  289  1e-76  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0612198  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0347  hypothetical protein  29.36 
 
 		 651 aa  289  1e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.512067  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0294  hypothetical protein  29.59 
 
 		 672 aa  285  1.0000000000000001e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1655  hypothetical protein  31.79 
 
 		 659 aa  276  1.0000000000000001e-72  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.92413  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1298  hypothetical protein  29.95 
 
 		 659 aa  276  1.0000000000000001e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.594857  normal  0.225568 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0904  hypothetical protein  30.46 
 
 		 658 aa  273  8.000000000000001e-72  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3234  hypothetical protein  33.23 
 
 		 675 aa  271  2.9999999999999997e-71  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.220852  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5428  hypothetical protein  29.98 
 
 		 672 aa  270  5.9999999999999995e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.832093 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05110  hypothetical protein  31.42 
 
 		 655 aa  270  8e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0490  hypothetical protein  31.1 
 
 		 655 aa  269  1e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3493  hypothetical protein  30.59 
 
 		 709 aa  268  2e-70  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000901673 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0533  GTPase (dynamin-related)  29.27 
 
 		 654 aa  266  1e-69  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3605  hypothetical protein  29.94 
 
 		 653 aa  265  2e-69  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.169107  normal  0.037636 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4340  hypothetical protein  29.24 
 
 		 655 aa  257  5e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0246276  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1095  dynamin  30.64 
 
 		 588 aa  65.5  0.000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.845511  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2259  Dynamin family protein  21.31 
 
 		 444 aa  60.1  0.0000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000551632  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0787  dynamin family protein  24.79 
 
 		 655 aa  59.3  0.0000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0394271  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3531  dynamin family protein  30.91 
 
 		 585 aa  59.7  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1377  dynamin family protein  29.69 
 
 		 585 aa  57.4  0.0000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.682843  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2546  hypothetical protein  26.48 
 
 		 719 aa  57  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0908682 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2910  dynamin family protein  22.02 
 
 		 605 aa  57  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.518789  normal  0.400566 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2545  dynamin  25.12 
 
 		 390 aa  55.1  0.000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0649757  normal  0.0791445 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2209  GTP-binding protein  22.61 
 
 		 615 aa  55.1  0.000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2968  dynamin family protein  33.11 
 
 		 583 aa  55.1  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1639  dynamin family protein  25.51 
 
 		 605 aa  54.7  0.000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.143429  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1654  dynamin family protein  24.28 
 
 		 603 aa  54.3  0.000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.964955 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1193  hypothetical protein  28.39 
 
 		 614 aa  52.4  0.00003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.108086  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2213  Dynamin family protein  33.33 
 
 		 587 aa  51.2  0.00005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1439  Dynamin family protein  35.71 
 
 		 546 aa  51.6  0.00005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.784928  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2424  Dynamin family protein  30.56 
 
 		 666 aa  51.2  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2196  dynamin family protein  24.7 
 
 		 506 aa  50.4  0.00009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000046764 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0914  Dynamin family protein  42.68 
 
 		 548 aa  49.3  0.0003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.440355 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3036  dynamin family protein  22.88 
 
 		 614 aa  48.5  0.0004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0241135  normal  0.688737 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2994  dynamin family protein  22.88 
 
 		 614 aa  48.5  0.0004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.214598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_44250  predicted protein  34.82 
 
 		 632 aa  48.1  0.0005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.755773  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6878  Dynamin family protein  29.63 
 
 		 620 aa  47.8  0.0006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1896  Dynamin family protein  22.26 
 
 		 1228 aa  47.8  0.0007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00444431  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0624  hypothetical protein  28.89 
 
 		 602 aa  47  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.318926  normal  0.0782013 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0969  Dynamin family protein  24.09 
 
 		 648 aa  45.8  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2392  Dynamin family protein  24.17 
 
 		 1249 aa  46.6  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1350  dynamin  25.48 
 
 		 693 aa  45.4  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0228271 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6880  Dynamin family protein  29.41 
 
 		 1164 aa  45.4  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1273  Dynamin family protein  25.75 
 
 		 407 aa  45.4  0.004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000146438  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3240  hypothetical protein  50.98 
 
 		 537 aa  44.7  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.41085  normal  0.440891 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10347  isoniazid inductible gene protein iniA  38.46 
 
 		 640 aa  44.7  0.006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.997288 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0397  Dynamin family protein  22.65 
 
 		 789 aa  43.9  0.009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0111735  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4018  hypothetical protein  21.47 
 
 		 814 aa  43.9  0.01  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.505763 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3460  hypothetical protein  30.09 
 
 		 659 aa  43.9  0.01  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>