More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_2968 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_2968  dynamin family protein  100 
 
 
583 aa  1178    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3531  dynamin family protein  47.91 
 
 
585 aa  531  1e-149  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0632  Dynamin family protein  44.41 
 
 
589 aa  515  1e-144  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1377  dynamin family protein  47.45 
 
 
585 aa  503  1e-141  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.682843  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2213  Dynamin family protein  47.05 
 
 
587 aa  498  1e-139  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0322  Dynamin family protein  37.7 
 
 
585 aa  361  2e-98  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2106  dynamin  38.04 
 
 
564 aa  345  1e-93  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.78205 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0914  Dynamin family protein  36.49 
 
 
548 aa  304  3.0000000000000004e-81  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.440355 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1439  Dynamin family protein  34.2 
 
 
546 aa  277  4e-73  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.784928  normal 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_44250  predicted protein  43.37 
 
 
632 aa  223  6e-57  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.755773  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6878  Dynamin family protein  35.83 
 
 
620 aa  127  4.0000000000000003e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2994  dynamin family protein  29.05 
 
 
614 aa  115  1.0000000000000001e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.214598  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3036  dynamin family protein  29.05 
 
 
614 aa  115  1.0000000000000001e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0241135  normal  0.688737 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6880  Dynamin family protein  34.8 
 
 
1164 aa  115  2.0000000000000002e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1193  hypothetical protein  31.58 
 
 
614 aa  114  3e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.108086  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1095  dynamin  30.38 
 
 
588 aa  108  2e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.845511  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1273  Dynamin family protein  27.3 
 
 
407 aa  107  6e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000146438  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2910  dynamin family protein  32.35 
 
 
605 aa  107  6e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.518789  normal  0.400566 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2259  Dynamin family protein  26.82 
 
 
444 aa  105  2e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000551632  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1510  GTP-binding protein HSR1-related  26.67 
 
 
523 aa  98.2  3e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2196  dynamin family protein  28.12 
 
 
506 aa  94  7e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000046764 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0398  Dynamin family protein  25 
 
 
674 aa  87  9e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2424  Dynamin family protein  27.17 
 
 
666 aa  85.5  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2209  GTP-binding protein  29.11 
 
 
615 aa  85.5  0.000000000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1654  dynamin  27.03 
 
 
686 aa  77.4  0.0000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0311974  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1654  dynamin family protein  30.22 
 
 
603 aa  73.9  0.000000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.964955 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1639  dynamin family protein  29.73 
 
 
605 aa  73.9  0.000000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.143429  normal 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5314  hypothetical protein  24.91 
 
 
952 aa  70.1  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2547  dynamin  28.63 
 
 
551 aa  70.1  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.164219 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1350  dynamin  22.55 
 
 
693 aa  67.4  0.0000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0228271 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0404  glucosamine fructose-6-phosphate aminotransferase (isomerizing)  27.49 
 
 
610 aa  67  0.0000000009  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1351  heat shock protein DnaJ-like  29.06 
 
 
741 aa  66.6  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0473185 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1735  putative ABC transporter  28.1 
 
 
552 aa  66.2  0.000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.43735  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0273  hypothetical protein  27.31 
 
 
608 aa  65.5  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1407  small GTP-binding protein  31.58 
 
 
479 aa  63.5  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5156  small GTP-binding protein  31.3 
 
 
566 aa  63.5  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.61556 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3084  hypothetical protein  27.27 
 
 
627 aa  63.2  0.00000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1080  small GTP-binding protein  33.12 
 
 
484 aa  62.4  0.00000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3291  small GTP-binding protein domain-containing protein  31.95 
 
 
492 aa  62.8  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1096  GTP-binding protein, HSR1-related  25.31 
 
 
664 aa  62.4  0.00000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2560  AAA ATPase  26.47 
 
 
687 aa  62.4  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1436  small GTP-binding protein  31.58 
 
 
479 aa  62.4  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.741449  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0624  hypothetical protein  24.48 
 
 
602 aa  62.4  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.318926  normal  0.0782013 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1616  small GTP-binding protein  29.41 
 
 
453 aa  62  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00206677 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3493  hypothetical protein  30.77 
 
 
709 aa  62  0.00000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000901673 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0933  dynamin family protein  24.74 
 
 
679 aa  62  0.00000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.807319  hitchhiker  0.00750508 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7362  hypothetical protein  26.61 
 
 
564 aa  62  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0821059  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3622  hypothetical protein  30.17 
 
 
654 aa  62  0.00000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.300251  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2392  Dynamin family protein  26.98 
 
 
1249 aa  61.6  0.00000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3725  hypothetical protein  31.11 
 
 
569 aa  61.6  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.491681  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0499  small GTP-binding protein  29.73 
 
 
475 aa  61.6  0.00000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.362987  normal  0.723657 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1896  Dynamin family protein  26.23 
 
 
1228 aa  61.2  0.00000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00444431  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5212  small GTP-binding protein  26.85 
 
 
489 aa  61.2  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000545834 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1530  hypothetical protein  30 
 
 
1146 aa  60.8  0.00000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.532706  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1501  hypothetical protein  30 
 
 
1146 aa  60.8  0.00000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3459  hypothetical protein  30.37 
 
 
568 aa  60.8  0.00000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.825542 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0437  GTP-binding protein  25.76 
 
 
692 aa  60.5  0.00000007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6053  hypothetical protein  25.75 
 
 
570 aa  60.5  0.00000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0372  hypothetical protein  27.6 
 
 
587 aa  60.5  0.00000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7004  GTP-binding protein HSR1-related  28.97 
 
 
610 aa  59.3  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.793634  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0700  hypothetical protein  32.49 
 
 
652 aa  59.7  0.0000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.471001  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3240  hypothetical protein  28.29 
 
 
537 aa  59.3  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.41085  normal  0.440891 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0080  GTP-binding protein Era  28.29 
 
 
301 aa  59.7  0.0000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000412844  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0859  GTP-binding protein  25.57 
 
 
692 aa  59.3  0.0000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.547864  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3465  tRNA modification GTPase TrmE  28.81 
 
 
456 aa  58.5  0.0000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3235  GTP-binding protein Era  27.32 
 
 
489 aa  58.5  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00276402  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2545  dynamin  22.56 
 
 
390 aa  58.2  0.0000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0649757  normal  0.0791445 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0434  hypothetical protein  33.33 
 
 
619 aa  57.8  0.0000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.827508  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0813  hypothetical protein  24.44 
 
 
516 aa  57.8  0.0000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1387  GTP-binding protein Era  30.5 
 
 
308 aa  57.8  0.0000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.263237  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0382  hypothetical protein  38.51 
 
 
652 aa  57.8  0.0000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.874173  normal  0.0118752 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0447  hypothetical protein  33.33 
 
 
619 aa  57.8  0.0000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.276019  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0457  hypothetical protein  33.33 
 
 
619 aa  57.8  0.0000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.374169  normal  0.488282 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1701  hypothetical protein  23.73 
 
 
1219 aa  57.4  0.0000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1665  hypothetical protein  23.73 
 
 
1219 aa  57.4  0.0000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1479  hypothetical protein  23.73 
 
 
1219 aa  57.4  0.0000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1451  GTP1/OBG family GTPase  23.73 
 
 
1219 aa  57.4  0.0000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1451  GTP1/OBG family GTPase  23.73 
 
 
1219 aa  57.4  0.0000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.472831  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39100  GTPase of unknown function  26.35 
 
 
617 aa  57.4  0.0000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.0000974304  normal  0.356305 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1595  hypothetical protein  23.73 
 
 
1219 aa  57.4  0.0000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1741  hypothetical protein  23.73 
 
 
1219 aa  57.4  0.0000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000058782  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3715  hypothetical protein  23.73 
 
 
1219 aa  57.4  0.0000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0080  GTP-binding protein Era  27.63 
 
 
300 aa  57  0.0000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000115632  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0460  GTP-binding protein  26.09 
 
 
728 aa  57.4  0.0000008  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.839985  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1630  hypothetical protein  23.73 
 
 
1219 aa  57  0.0000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00254693  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5313  hypothetical protein  25.55 
 
 
743 aa  57.4  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1247  GTP-binding protein Era  29.79 
 
 
300 aa  56.6  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.734456  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1323  GTP-binding protein Era  28.77 
 
 
298 aa  56.6  0.000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0411499  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1344  GTP-binding protein Era  25.83 
 
 
302 aa  56.6  0.000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000010527  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0435  GTP-binding protein  25.3 
 
 
728 aa  56.6  0.000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1546  GTP-binding protein  24.7 
 
 
728 aa  56.6  0.000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3787  GTP-binding protein Era  26.59 
 
 
468 aa  56.6  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.574606  normal  0.0434052 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0886  tRNA modification GTPase TrmE  30 
 
 
478 aa  56.6  0.000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00940326 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1494  dynamin family protein  23.6 
 
 
1219 aa  56.2  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.248245  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2751  GTP-binding protein, HSR1-related  25.9 
 
 
549 aa  56.2  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.859645  normal  0.205011 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3725  hypothetical protein  35.95 
 
 
649 aa  56.2  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.24696 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2365  tRNA modification GTPase TrmE  24.12 
 
 
459 aa  55.1  0.000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10348  isoniazid inductible gene protein iniC  28.8 
 
 
493 aa  55.5  0.000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2756  hypothetical protein  33.11 
 
 
659 aa  55.1  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1306  dynamin family protein  24.22 
 
 
1219 aa  55.5  0.000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.604786  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>