More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_3531 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_1377  dynamin family protein  87.16 
 
 		 585 aa  980    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.682843  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3531  dynamin family protein  100 
 
 		 585 aa  1164    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2968  dynamin family protein  46.88 
 
 		 583 aa  537  1e-151  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2213  Dynamin family protein  46.17 
 
 		 587 aa  517  1.0000000000000001e-145  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0632  Dynamin family protein  44.67 
 
 		 589 aa  515  1.0000000000000001e-145  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0322  Dynamin family protein  39.83 
 
 		 585 aa  371  1e-101  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2106  dynamin  39.55 
 
 		 564 aa  337  5e-91  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.78205 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0914  Dynamin family protein  35.92 
 
 		 548 aa  290  4e-77  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.440355 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1439  Dynamin family protein  34.04 
 
 		 546 aa  262  1e-68  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.784928  normal  1 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_44250  predicted protein  39.62 
 
 		 632 aa  199  9e-50  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.755773  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6878  Dynamin family protein  28.35 
 
 		 620 aa  134  3.9999999999999996e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2910  dynamin family protein  33.47 
 
 		 605 aa  127  5e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.518789  normal  0.400566 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6880  Dynamin family protein  39.05 
 
 		 1164 aa  124  4e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2259  Dynamin family protein  28.06 
 
 		 444 aa  107  6e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000551632  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1193  hypothetical protein  31.15 
 
 		 614 aa  103  1e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.108086  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1510  GTP-binding protein HSR1-related  26.82 
 
 		 523 aa  102  2e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1095  dynamin  27.19 
 
 		 588 aa  99.4  2e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.845511  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2994  dynamin family protein  28.11 
 
 		 614 aa  98.6  3e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.214598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3036  dynamin family protein  28.11 
 
 		 614 aa  98.6  3e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0241135  normal  0.688737 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1273  Dynamin family protein  27.81 
 
 		 407 aa  96.7  1e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000146438  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2196  dynamin family protein  25.52 
 
 		 506 aa  92.4  2e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000046764 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1350  dynamin  24.46 
 
 		 693 aa  82.4  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0228271 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0398  Dynamin family protein  22.68 
 
 		 674 aa  79.7  0.0000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2424  Dynamin family protein  25.42 
 
 		 666 aa  76.3  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2209  GTP-binding protein  26.84 
 
 		 615 aa  75.5  0.000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0624  hypothetical protein  24.92 
 
 		 602 aa  73.9  0.000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.318926  normal  0.0782013 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0404  glucosamine fructose-6-phosphate aminotransferase (isomerizing)  23.78 
 
 		 610 aa  72.4  0.00000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0933  dynamin family protein  25.62 
 
 		 679 aa  72.4  0.00000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.807319  hitchhiker  0.00750508 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1654  dynamin  27.18 
 
 		 686 aa  72  0.00000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0311974  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0438  GTP-binding protein  22.73 
 
 		 599 aa  68.6  0.0000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0273  hypothetical protein  25.32 
 
 		 608 aa  67.4  0.0000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7362  hypothetical protein  27.34 
 
 		 564 aa  66.2  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0821059  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0556  GTP-binding protein HSR1-related  28.76 
 
 		 602 aa  66.2  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0329351  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1306  dynamin family protein  32.24 
 
 		 1219 aa  63.9  0.000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.604786  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0828  hypothetical protein  24.4 
 
 		 516 aa  63.9  0.000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000529126  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5314  hypothetical protein  26.1 
 
 		 952 aa  63.9  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0813  hypothetical protein  25.45 
 
 		 516 aa  63.9  0.000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1896  Dynamin family protein  29.1 
 
 		 1228 aa  63.2  0.00000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00444431  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0859  GTP-binding protein  24.21 
 
 		 692 aa  63.2  0.00000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.547864  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1494  dynamin family protein  27.43 
 
 		 1219 aa  63.2  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.248245  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39100  GTPase of unknown function  28.92 
 
 		 617 aa  62.8  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.0000974304  normal  0.356305 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1096  GTP-binding protein, HSR1-related  27.22 
 
 		 664 aa  62.4  0.00000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1630  hypothetical protein  25.85 
 
 		 1219 aa  61.2  0.00000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00254693  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1741  hypothetical protein  31.54 
 
 		 1219 aa  60.8  0.00000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000058782  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3715  hypothetical protein  30.57 
 
 		 1219 aa  60.8  0.00000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1479  hypothetical protein  31.54 
 
 		 1219 aa  60.5  0.00000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1451  GTP1/OBG family GTPase  31.54 
 
 		 1219 aa  60.8  0.00000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.472831  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1595  hypothetical protein  31.54 
 
 		 1219 aa  60.5  0.00000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1701  hypothetical protein  31.54 
 
 		 1219 aa  60.5  0.00000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1451  GTP1/OBG family GTPase  31.54 
 
 		 1219 aa  60.5  0.00000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1639  dynamin family protein  28.14 
 
 		 605 aa  60.5  0.00000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.143429  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1665  hypothetical protein  31.54 
 
 		 1219 aa  60.5  0.00000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2377  hypothetical protein  30.91 
 
 		 659 aa  59.7  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0503347 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2756  hypothetical protein  30.91 
 
 		 659 aa  59.7  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1654  dynamin family protein  25.38 
 
 		 603 aa  60.1  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.964955 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0434  hypothetical protein  24.76 
 
 		 619 aa  59.3  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.827508  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0447  hypothetical protein  24.76 
 
 		 619 aa  59.3  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.276019  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2560  AAA ATPase  25.93 
 
 		 687 aa  59.3  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0457  hypothetical protein  24.76 
 
 		 619 aa  59.3  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.374169  normal  0.488282 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3234  hypothetical protein  33.94 
 
 		 675 aa  58.5  0.0000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.220852  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3622  hypothetical protein  32.66 
 
 		 654 aa  58.5  0.0000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.300251  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7004  GTP-binding protein HSR1-related  30.32 
 
 		 610 aa  58.5  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.793634  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0700  hypothetical protein  34.72 
 
 		 652 aa  58.9  0.0000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.471001  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3084  hypothetical protein  25.61 
 
 		 627 aa  58.2  0.0000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0860  GTP-binding protein  20.88 
 
 		 601 aa  58.2  0.0000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0692  GTP-binding protein EngA  33.97 
 
 		 470 aa  58.2  0.0000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1545  GTP-binding protein  25.29 
 
 		 569 aa  58.2  0.0000005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.712051  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0436  GTP-binding protein  25.39 
 
 		 569 aa  57.8  0.0000005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_8770  predicted protein  29.31 
 
 		 390 aa  57.8  0.0000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0165  small GTP-binding protein  32.74 
 
 		 427 aa  57.4  0.0000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24320  hypothetical protein  27.78 
 
 		 584 aa  57  0.0000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1387  GTP-binding protein Era  32.14 
 
 		 308 aa  57  0.0000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.263237  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0403  dynamin family protein  23.47 
 
 		 693 aa  57  0.0000009  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2751  GTP-binding protein, HSR1-related  31.65 
 
 		 549 aa  56.2  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.859645  normal  0.205011 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2392  Dynamin family protein  26.71 
 
 		 1249 aa  56.2  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1349  hypothetical protein  28.57 
 
 		 566 aa  55.8  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000440573 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0382  hypothetical protein  34.23 
 
 		 652 aa  55.8  0.000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.874173  normal  0.0118752 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0928  hypothetical protein  32.33 
 
 		 540 aa  55.8  0.000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0787  dynamin family protein  36.59 
 
 		 655 aa  55.1  0.000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0394271  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2547  dynamin  25.94 
 
 		 551 aa  55.5  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.164219 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08870  hypothetical protein  27.33 
 
 		 566 aa  55.1  0.000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0706838  normal  0.0205572 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0461  GTP-binding protein  24.9 
 
 		 569 aa  54.7  0.000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0612543  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3901  GTP-binding protein HSR1-related  27.92 
 
 		 581 aa  54.7  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0368648  normal  0.0698328 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_30394  predicted protein  26.67 
 
 		 559 aa  54.3  0.000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.382636  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3240  hypothetical protein  29.05 
 
 		 537 aa  53.9  0.000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.41085  normal  0.440891 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0969  Dynamin family protein  33.96 
 
 		 648 aa  53.9  0.000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3729  hypothetical protein  25.86 
 
 		 626 aa  53.9  0.000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.731679  normal  0.057897 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1735  putative ABC transporter  36.36 
 
 		 552 aa  54.3  0.000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.43735  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1530  hypothetical protein  29.55 
 
 		 1146 aa  53.9  0.000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.532706  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3302  GTP-binding protein EngA  29.41 
 
 		 474 aa  53.9  0.000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.316901  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1501  hypothetical protein  29.55 
 
 		 1146 aa  53.9  0.000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0923  hypothetical protein  25.12 
 
 		 309 aa  53.5  0.000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00169029 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2033  GTP-binding protein, HSR1-related  27 
 
 		 569 aa  53.9  0.000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00291841 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0759  putative GTPase  28.26 
 
 		 291 aa  53.5  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0830  hypothetical protein  22.13 
 
 		 712 aa  53.1  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00896739  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2220  putative ABC transporter  25.76 
 
 		 619 aa  53.5  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3381  GTP-binding protein EngA  27.72 
 
 		 441 aa  53.1  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000285965  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1653  GTP-binding protein, HSR1-related  24.82 
 
 		 524 aa  53.5  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0754256  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1086  hypothetical protein  29.3 
 
 		 551 aa  53.1  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  decreased coverage  0.00952601  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1298  hypothetical protein  33.08 
 
 		 659 aa  53.1  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.594857  normal  0.225568 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>