25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_8770 on replicon NC_011669
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011669  PHATRDRAFT_8770  predicted protein  100 
 
 
390 aa  801    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_30394  predicted protein  54.28 
 
 
559 aa  424  1e-117  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.382636  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1083  hypothetical protein  32.41 
 
 
494 aa  125  2e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_14787  predicted protein  32.85 
 
 
204 aa  113  6e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0914  Dynamin family protein  26.4 
 
 
548 aa  59.7  0.0000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.440355 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1377  dynamin family protein  28.16 
 
 
585 aa  58.9  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.682843  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1019  hypothetical protein  26.78 
 
 
556 aa  57.8  0.0000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.927192  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0632  Dynamin family protein  26.79 
 
 
589 aa  57.4  0.0000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3531  dynamin family protein  29.31 
 
 
585 aa  57.8  0.0000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6880  Dynamin family protein  25.48 
 
 
1164 aa  56.2  0.0000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2213  Dynamin family protein  27.98 
 
 
587 aa  55.8  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0896  hypothetical protein  27.36 
 
 
502 aa  54.3  0.000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.128039  normal  0.710649 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_87071  predicted protein  26.26 
 
 
445 aa  54.3  0.000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0177704  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2106  dynamin  27.71 
 
 
564 aa  53.1  0.000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.78205 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2968  dynamin family protein  29.09 
 
 
583 aa  51.2  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0774  hypothetical protein  28.02 
 
 
529 aa  49.7  0.00008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0344155  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1439  Dynamin family protein  23.73 
 
 
546 aa  49.7  0.00008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.784928  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1510  GTP-binding protein HSR1-related  23.08 
 
 
523 aa  47.8  0.0004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6878  Dynamin family protein  30.43 
 
 
620 aa  45.8  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2209  GTP-binding protein  26.52 
 
 
615 aa  46.2  0.001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2424  Dynamin family protein  23.08 
 
 
666 aa  44.3  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0398  Dynamin family protein  25.14 
 
 
674 aa  44.7  0.003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0438  GTP-binding protein  24.79 
 
 
599 aa  44.3  0.003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2259  Dynamin family protein  23.94 
 
 
444 aa  43.5  0.007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000551632  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3459  hypothetical protein  30.08 
 
 
568 aa  43.1  0.009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.825542 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>