53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_1298 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012791  Vapar_4340  hypothetical protein  62.8 
 
 
655 aa  818    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0246276  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0900  hypothetical protein  65.72 
 
 
660 aa  861    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.347456  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0904  hypothetical protein  78.15 
 
 
658 aa  1027    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3605  hypothetical protein  65.16 
 
 
653 aa  859    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.169107  normal  0.037636 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5428  hypothetical protein  61.5 
 
 
672 aa  794    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.832093 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1655  hypothetical protein  72.81 
 
 
659 aa  938    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.92413  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0829  hypothetical protein  65.88 
 
 
660 aa  863    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0612198  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1298  hypothetical protein  100 
 
 
659 aa  1335    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.594857  normal  0.225568 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3234  hypothetical protein  51.75 
 
 
675 aa  620  1e-176  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.220852  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3493  hypothetical protein  48.17 
 
 
709 aa  567  1e-160  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000901673 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3725  hypothetical protein  43.7 
 
 
649 aa  508  9.999999999999999e-143  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.24696 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0294  hypothetical protein  42.61 
 
 
672 aa  498  1e-139  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0400  hypothetical protein  41.04 
 
 
662 aa  491  1e-137  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0733804  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0347  hypothetical protein  40.43 
 
 
651 aa  490  1e-137  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.512067  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0282  hypothetical protein  40.57 
 
 
648 aa  486  1e-136  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0700  hypothetical protein  39.72 
 
 
652 aa  477  1e-133  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.471001  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0255  hypothetical protein  40.57 
 
 
648 aa  478  1e-133  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.142183  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3622  hypothetical protein  40.84 
 
 
654 aa  464  1e-129  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.300251  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0382  hypothetical protein  40.16 
 
 
652 aa  452  1.0000000000000001e-126  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.874173  normal  0.0118752 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2415  hypothetical protein  37.19 
 
 
648 aa  379  1e-103  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0829723  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0490  hypothetical protein  35.1 
 
 
655 aa  319  1e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05110  hypothetical protein  34.93 
 
 
655 aa  316  8e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4154  GTPase (dynamin-related)-like protein  33.68 
 
 
660 aa  313  6.999999999999999e-84  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.67903 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0533  GTPase (dynamin-related)  34.02 
 
 
654 aa  309  1.0000000000000001e-82  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2756  hypothetical protein  29.95 
 
 
659 aa  277  5e-73  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2377  hypothetical protein  29.95 
 
 
659 aa  277  5e-73  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0503347 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1193  hypothetical protein  27.88 
 
 
614 aa  87.4  7e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.108086  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3036  dynamin family protein  27.62 
 
 
614 aa  72.4  0.00000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0241135  normal  0.688737 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2994  dynamin family protein  27.62 
 
 
614 aa  72.4  0.00000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.214598  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2910  dynamin family protein  26.91 
 
 
605 aa  71.6  0.00000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.518789  normal  0.400566 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2196  dynamin family protein  26.35 
 
 
506 aa  61.6  0.00000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000046764 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1095  dynamin  28.3 
 
 
588 aa  57.4  0.0000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.845511  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2259  Dynamin family protein  23.12 
 
 
444 aa  57  0.000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000551632  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0787  dynamin family protein  23.41 
 
 
655 aa  54.7  0.000005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0394271  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0322  Dynamin family protein  33.57 
 
 
585 aa  53.5  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3531  dynamin family protein  33.08 
 
 
585 aa  53.1  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0624  hypothetical protein  27.98 
 
 
602 aa  51.6  0.00005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.318926  normal  0.0782013 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2424  Dynamin family protein  28.03 
 
 
666 aa  51.6  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0914  Dynamin family protein  29.47 
 
 
548 aa  50.4  0.00009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.440355 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0859  GTP-binding protein  21.67 
 
 
692 aa  50.1  0.0001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.547864  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0251  hypothetical protein  32.14 
 
 
819 aa  50.4  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0811563  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6878  Dynamin family protein  29.01 
 
 
620 aa  48.5  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1350  dynamin  21.76 
 
 
693 aa  48.5  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0228271 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1654  dynamin  25.29 
 
 
686 aa  47.8  0.0006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0311974  normal 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_44250  predicted protein  26.84 
 
 
632 aa  47.4  0.0008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.755773  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1377  dynamin family protein  33.08 
 
 
585 aa  47  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.682843  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2209  GTP-binding protein  20.81 
 
 
615 aa  47  0.001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0556  GTP-binding protein HSR1-related  33.11 
 
 
602 aa  45.8  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0329351  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0398  Dynamin family protein  25.58 
 
 
674 aa  45.8  0.003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4018  hypothetical protein  33.72 
 
 
814 aa  45.1  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.505763 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36820  hypothetical protein  23.88 
 
 
624 aa  44.3  0.008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.19264 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2968  dynamin family protein  32.14 
 
 
583 aa  43.9  0.009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0273  hypothetical protein  26.47 
 
 
608 aa  43.9  0.009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>