81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_2560 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_2560  AAA ATPase  100 
 
 		 687 aa  1354    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7362  hypothetical protein  65.6 
 
 		 564 aa  739    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0821059  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1324  hypothetical protein  52.42 
 
 		 569 aa  559  1e-158  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.577358  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2220  putative ABC transporter  45.77 
 
 		 619 aa  442  9.999999999999999e-123  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3430  putative ABC transporter  43.85 
 
 		 631 aa  432  1e-120  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.790282  normal  0.301569 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1353  putative ABC transporter  39.71 
 
 		 667 aa  342  1e-92  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00435841  hitchhiker  0.000139423 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8871  putative ABC transporter  41 
 
 		 629 aa  338  1.9999999999999998e-91  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.872872  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0079  putative ABC transporter  41.42 
 
 		 565 aa  332  2e-89  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.459634  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2260  putative ABC transporter  38.69 
 
 		 571 aa  327  4.0000000000000003e-88  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000139745 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3266  putative ABC transporter  38.97 
 
 		 571 aa  325  2e-87  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.025779  normal  0.223838 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1520  putative ABC transporter  39.31 
 
 		 576 aa  323  7e-87  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.703438  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1549  putative ABC transporter  39.31 
 
 		 586 aa  323  8e-87  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1572  putative ABC transporter  39.31 
 
 		 586 aa  323  8e-87  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2641  putative ABC transporter  40.33 
 
 		 669 aa  312  1e-83  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.374728  normal  0.779452 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08870  hypothetical protein  37.3 
 
 		 566 aa  310  6.999999999999999e-83  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0706838  normal  0.0205572 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2523  putative ABC transporter  37.78 
 
 		 571 aa  301  3e-80  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24700  hypothetical protein  38.35 
 
 		 784 aa  286  8e-76  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.303383  normal  0.0806263 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0932  hypothetical protein  34.61 
 
 		 650 aa  280  6e-74  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1366  putative ABC transporter  36.73 
 
 		 572 aa  276  8e-73  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08690  hypothetical protein  36.1 
 
 		 602 aa  275  2.0000000000000002e-72  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24320  hypothetical protein  35.48 
 
 		 584 aa  265  2e-69  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1090  hypothetical protein  34.4 
 
 		 737 aa  263  6.999999999999999e-69  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1349  hypothetical protein  39.41 
 
 		 566 aa  213  1e-53  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000440573 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1086  hypothetical protein  31.85 
 
 		 551 aa  209  1e-52  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  decreased coverage  0.00952601  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2645  putative transcriptional regulator, TetR family  36.1 
 
 		 526 aa  196  2e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0928  hypothetical protein  38.61 
 
 		 540 aa  192  2e-47  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24740  hypothetical protein  29.74 
 
 		 551 aa  183  9.000000000000001e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.043803  normal  0.105516 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1736  putative ABC transporter  30.69 
 
 		 556 aa  130  7.000000000000001e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1350  putative ABC transporter  34.38 
 
 		 524 aa  86.7  0.000000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.43815  hitchhiker  0.000106139 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1735  putative ABC transporter  33 
 
 		 552 aa  84  0.000000000000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.43735  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08880  predicted GTPase  29.92 
 
 		 564 aa  80.5  0.00000000000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.141009  normal  0.0562111 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1354  GTP-binding protein HSR1-related protein  39.06 
 
 		 542 aa  77.4  0.0000000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0428896  hitchhiker  0.0000949376 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1367  putative ABC transporter  32.09 
 
 		 555 aa  74.7  0.000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.621246  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24730  predicted GTPase  31.48 
 
 		 517 aa  73.9  0.00000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0664672  normal  0.0671171 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1087  putative ABC transporter  32.34 
 
 		 523 aa  73.2  0.00000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0151577  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08700  hypothetical protein  31.71 
 
 		 586 aa  69.7  0.0000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0929  hypothetical protein  29.32 
 
 		 518 aa  69.7  0.0000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1571  putative ABC transporter  30.49 
 
 		 525 aa  68.9  0.0000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1519  putative ABC transporter  30.49 
 
 		 525 aa  68.6  0.0000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3429  hypothetical protein  28.85 
 
 		 802 aa  68.6  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.224896 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1548  putative ABC transporter  30.49 
 
 		 525 aa  68.9  0.0000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24310  hypothetical protein  39.1 
 
 		 568 aa  68.2  0.0000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3997  hypothetical protein  26.73 
 
 		 642 aa  68.2  0.0000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2522  putative ABC transporter  31.25 
 
 		 539 aa  67.8  0.0000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.504723  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0933  hypothetical protein  30 
 
 		 578 aa  66.6  0.000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8870  putative ABC transporter  28.05 
 
 		 590 aa  66.2  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0939636  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1326  hypothetical protein  30.1 
 
 		 568 aa  66.2  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6775  putative ABC transporter  29.92 
 
 		 589 aa  66.2  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.122043  normal  0.131288 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24690  GTPase of unknown function  33.56 
 
 		 539 aa  65.5  0.000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.6041  normal  0.0378138 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3265  putative ABC transporter  30.68 
 
 		 532 aa  64.7  0.000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.169453  normal  0.30236 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0080  GTP-binding protein HSR1-related protein  30.93 
 
 		 532 aa  63.5  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.170633  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1394  hypothetical protein  31.82 
 
 		 543 aa  63.2  0.00000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2640  GTP-binding protein HSR1-related protein  34.07 
 
 		 550 aa  62.4  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.133942  normal  0.721182 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2968  dynamin family protein  26.47 
 
 		 583 aa  62.8  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2259  GTP-binding protein HSR1-related  32.18 
 
 		 537 aa  62.8  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000117964 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7361  putative ABC transporter  33.33 
 
 		 547 aa  62  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.901699  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2559  putative ABC transporter  33.82 
 
 		 542 aa  61.6  0.00000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3738  hypothetical protein  30.72 
 
 		 618 aa  61.6  0.00000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1439  Dynamin family protein  25.77 
 
 		 546 aa  61.6  0.00000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.784928  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1091  putative ABC transporter  34.3 
 
 		 585 aa  59.3  0.0000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.631509  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2219  GTPase  28.28 
 
 		 673 aa  57.8  0.0000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0914  Dynamin family protein  24.5 
 
 		 548 aa  57.4  0.0000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.440355 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1377  dynamin family protein  25.99 
 
 		 585 aa  55.8  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.682843  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3531  dynamin family protein  25.42 
 
 		 585 aa  55.8  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2213  Dynamin family protein  27.03 
 
 		 587 aa  54.3  0.000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2106  dynamin  28.48 
 
 		 564 aa  52.4  0.00003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.78205 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0632  Dynamin family protein  26.35 
 
 		 589 aa  52  0.00003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6880  Dynamin family protein  26.88 
 
 		 1164 aa  50.4  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2644  ATP-binding membrane protein  28.1 
 
 		 453 aa  49.7  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.908609 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0322  Dynamin family protein  29.6 
 
 		 585 aa  48.5  0.0004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2994  dynamin family protein  23.89 
 
 		 614 aa  48.5  0.0004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.214598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3036  dynamin family protein  23.89 
 
 		 614 aa  48.5  0.0004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0241135  normal  0.688737 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0860  GTP-binding protein  27.57 
 
 		 601 aa  47.4  0.0009  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1530  hypothetical protein  21.35 
 
 		 1146 aa  46.2  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.532706  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1501  hypothetical protein  21.35 
 
 		 1146 aa  46.2  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1510  GTP-binding protein HSR1-related  25.68 
 
 		 523 aa  46.6  0.002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_44250  predicted protein  20.81 
 
 		 632 aa  45.4  0.004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.755773  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1630  hypothetical protein  21.15 
 
 		 1219 aa  45.1  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00254693  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0670  GTP-binding protein  23.84 
 
 		 355 aa  44.7  0.006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.417298  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0403  dynamin family protein  24.28 
 
 		 693 aa  44.7  0.007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1083  hypothetical protein  26.97 
 
 		 494 aa  44.3  0.008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>