32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan8802_3901 on replicon NC_013161
Organism: Cyanothece sp. PCC 8802



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_3901  GTP-binding protein HSR1-related  100 
 
 		 581 aa  1196    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0368648  normal  0.0698328 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3852  GTP-binding protein HSR1-related  96.04 
 
 		 1415 aa  1150    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2033  GTP-binding protein, HSR1-related  22.59 
 
 		 569 aa  70.9  0.00000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00291841 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2751  GTP-binding protein, HSR1-related  31.82 
 
 		 549 aa  62.8  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.859645  normal  0.205011 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3193  GTP-binding protein, HSR1-related  22.2 
 
 		 1211 aa  54.7  0.000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3531  dynamin family protein  27.92 
 
 		 585 aa  54.7  0.000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2392  Dynamin family protein  23.33 
 
 		 1249 aa  52.8  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0968  small GTP-binding protein  27.52 
 
 		 501 aa  51.6  0.00004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3902  GTP-binding protein HSR1-related  24.79 
 
 		 829 aa  51.2  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.12168  normal  0.150325 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1193  hypothetical protein  22.58 
 
 		 614 aa  49.3  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.108086  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0828  hypothetical protein  34.17 
 
 		 516 aa  48.1  0.0004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000529126  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0322  Dynamin family protein  24.71 
 
 		 585 aa  48.1  0.0005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2664  GTP-binding protein, HSR1-like  25.36 
 
 		 581 aa  47.8  0.0006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.760188 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1377  dynamin family protein  25.63 
 
 		 585 aa  47.8  0.0006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.682843  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0914  Dynamin family protein  24.09 
 
 		 548 aa  47.4  0.0008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.440355 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0192  GTP-binding protein EngA  25 
 
 		 445 aa  47.4  0.0008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1654  dynamin  29.29 
 
 		 686 aa  46.2  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0311974  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0813  hypothetical protein  31.67 
 
 		 516 aa  45.8  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10221  GTPase SAR1 and related small G protein  26.78 
 
 		 516 aa  45.4  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.524471  normal  0.183753 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2424  Dynamin family protein  29.66 
 
 		 666 aa  45.1  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1234  GTP-binding protein EngA  36.36 
 
 		 444 aa  45.4  0.003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3036  dynamin family protein  26.11 
 
 		 614 aa  44.7  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0241135  normal  0.688737 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2994  dynamin family protein  26.11 
 
 		 614 aa  44.7  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.214598  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0751  GTP-binding protein EngA  26.51 
 
 		 440 aa  44.7  0.005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2393  small GTP-binding protein  24.73 
 
 		 448 aa  44.7  0.005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2342  small GTP-binding protein  24.39 
 
 		 448 aa  43.9  0.007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15170  small GTP-binding protein domain/GTP-binding conserved hypothetical protein  29.13 
 
 		 527 aa  43.9  0.007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00982196  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1896  Dynamin family protein  22.27 
 
 		 1228 aa  43.9  0.008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00444431  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1306  dynamin family protein  23.44 
 
 		 1219 aa  43.9  0.008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.604786  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf303  GTP-binding protein EngA  25.78 
 
 		 434 aa  43.5  0.009  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.778638  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0728  small GTP-binding protein  25.5 
 
 		 441 aa  43.5  0.01  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.390352 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2380  GTP-binding protein, HSR1-related  30.59 
 
 		 635 aa  43.5  0.01  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>