17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_2664 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_2664  GTP-binding protein, HSR1-like  100 
 
 		 581 aa  1177    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.760188 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2033  GTP-binding protein, HSR1-related  49.37 
 
 		 569 aa  560  1e-158  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00291841 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1683  labile enterotoxin output A  31.67 
 
 		 568 aa  224  4.9999999999999996e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.281657  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4758  labile enterotoxin output A  28.25 
 
 		 567 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0415565  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1654  dynamin  34.69 
 
 		 686 aa  53.9  0.000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0311974  normal  1 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_44250  predicted protein  26.71 
 
 		 632 aa  51.6  0.00004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.755773  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1439  Dynamin family protein  24.24 
 
 		 546 aa  51.6  0.00004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.784928  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3852  GTP-binding protein HSR1-related  26.09 
 
 		 1415 aa  49.3  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2232  GTP-binding proten HflX  29.38 
 
 		 450 aa  48.1  0.0005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1326  small GTP-binding protein  29.52 
 
 		 529 aa  48.1  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3901  GTP-binding protein HSR1-related  25.36 
 
 		 581 aa  47.8  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0368648  normal  0.0698328 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09441  GTPase SAR1 and related small G protein  26.04 
 
 		 499 aa  47  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09451  GTPase SAR1  27.72 
 
 		 499 aa  46.2  0.002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0884  small GTP-binding protein domain-containing protein  25.57 
 
 		 499 aa  46.2  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.102699  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4121  GTP-binding protein Era  25.23 
 
 		 305 aa  45.1  0.004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.383616  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1616  small GTP-binding protein  25.51 
 
 		 453 aa  44.3  0.006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00206677 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0813  hypothetical protein  30.09 
 
 		 516 aa  43.5  0.01  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>