More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_2232 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_2232  GTP-binding proten HflX  100 
 
 
450 aa  885    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1914  putative GTP-binding protein  52.02 
 
 
453 aa  426  1e-118  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.270348  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2456  putative GTP-binding protein HflX  51.45 
 
 
455 aa  405  1.0000000000000001e-112  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2390  GTP-binding protein, HSR1-related  47.99 
 
 
443 aa  392  1e-108  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.817457  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3241  GTP-binding proten HflX  51.1 
 
 
447 aa  391  1e-107  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2720  GTP-binding protein, HSR1-related  51.1 
 
 
468 aa  392  1e-107  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00930029 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1363  putative GTP-binding protein  50.32 
 
 
458 aa  377  1e-103  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0751  GTP-binding protein HflX  45.66 
 
 
443 aa  362  1e-98  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4350  GTP-binding proten HflX  44.84 
 
 
488 aa  334  2e-90  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.312302  normal  0.349671 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3269  GTP-binding proten HflX  42.19 
 
 
485 aa  274  2.0000000000000002e-72  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000617793  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2721  GTP-binding proten HflX  39.43 
 
 
442 aa  268  2e-70  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.43015  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1110  GTP-binding protein, HSR1-related  41.46 
 
 
422 aa  261  2e-68  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.000000612987  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11140  small GTP-binding protein  39.39 
 
 
395 aa  259  5.0000000000000005e-68  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1355  GTP-binding protein HflX  38.29 
 
 
435 aa  251  2e-65  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0820  small GTP-binding protein domain-containing protein  37.95 
 
 
493 aa  250  4e-65  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2263  GTP-binding family protein ; K03665 GTP-binding protein HflX  39.56 
 
 
494 aa  249  6e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0586252 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1174  GTP-binding protein HflX  37.26 
 
 
431 aa  249  7e-65  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.929711  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0772  GTP-binding proten HflX  37.69 
 
 
437 aa  246  4e-64  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.426006  normal  0.338027 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0970  GTP-binding proten HflX  36.69 
 
 
433 aa  246  4.9999999999999997e-64  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.602614 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1434  GTP-binding protein HSR1-related  34.96 
 
 
419 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1259  GTP-binding protein, HSR1-related  38.11 
 
 
421 aa  244  1.9999999999999999e-63  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.027448  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23070  GTP-binding proten HflX  39.09 
 
 
515 aa  244  1.9999999999999999e-63  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0748737 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1140  GTP-binding proten HflX  38.53 
 
 
501 aa  243  3.9999999999999997e-63  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.762868 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0394  small GTP-binding protein  38 
 
 
406 aa  243  5e-63  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000766043  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1737  GTP-binding protein, HSR1-related  37.47 
 
 
434 aa  243  5e-63  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.260139  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10790  GTP-binding proten HflX  38.18 
 
 
433 aa  243  6e-63  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000931239  unclonable  0.00000000274038 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3611  GTP-binding proten HflX  38.17 
 
 
414 aa  243  7e-63  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0108116  normal  0.379187 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1951  GTP-binding protein  34.81 
 
 
419 aa  243  7e-63  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.697887  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1835  GTP-binding protein  35.03 
 
 
419 aa  241  1e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1231  small GTP-binding protein  39.3 
 
 
503 aa  242  1e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.592117  normal  0.0200783 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1650  GTP-binding protein  35.03 
 
 
419 aa  241  2e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.101149  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1674  GTP-binding protein  34.59 
 
 
419 aa  240  2.9999999999999997e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.887073  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1872  GTP-binding protein  34.37 
 
 
419 aa  240  2.9999999999999997e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000726379 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27610  GTP-binding proten HflX  39.82 
 
 
482 aa  241  2.9999999999999997e-62  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1693  GTP-binding protein  35.03 
 
 
419 aa  240  4e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.78132  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0410  GTP-binding protein HflX  37.76 
 
 
420 aa  240  4e-62  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1828  GTP-binding protein  35.03 
 
 
419 aa  240  4e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.990495  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1689  GTP1/OBG protein  34.15 
 
 
419 aa  240  4e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1584  GTP-binding proten HflX  38.39 
 
 
434 aa  239  5.999999999999999e-62  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3981  GTP-binding proten HflX  38.82 
 
 
487 aa  239  1e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0693971  normal  0.0467716 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1232  hypothetical protein  36.64 
 
 
395 aa  238  1e-61  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.125901 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1713  GTP-binding proten HflX  37.61 
 
 
464 aa  237  3e-61  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.639031  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1503  small GTP-binding protein  38.67 
 
 
530 aa  236  4e-61  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0726763  normal  0.6234 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3511  small GTP-binding protein domain-containing protein  39.86 
 
 
486 aa  237  4e-61  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.67992  normal  0.0915245 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3508  GTP-binding protein  34.37 
 
 
419 aa  237  4e-61  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0684  GTP-binding proten HflX  37.99 
 
 
512 aa  236  7e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.518988  normal  0.674112 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7080  GTP-binding proten HflX  37.73 
 
 
502 aa  236  7e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.750227 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5672  GTP-binding proten HflX  39.06 
 
 
433 aa  236  9e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4111  GTP-binding proten HflX  38.3 
 
 
425 aa  236  9e-61  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1612  GTP-binding proten HflX  38.1 
 
 
436 aa  235  1.0000000000000001e-60  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000211402  unclonable  5.44053e-16 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65300  putative GTP-binding protein  39.06 
 
 
433 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1408  GTP-binding proten HflX  35.73 
 
 
441 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32115  predicted protein  38.57 
 
 
519 aa  234  2.0000000000000002e-60  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0250041 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2436  GTP-binding proten HflX  39.86 
 
 
493 aa  234  2.0000000000000002e-60  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.292704  normal  0.693712 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00650  GTP-binding protein HflX  36.69 
 
 
429 aa  234  3e-60  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.108619  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1731  GTP-binding proten HflX  35.25 
 
 
434 aa  234  3e-60  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2262  GTP-binding proten HflX  35.2 
 
 
435 aa  233  4.0000000000000004e-60  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3905  GTP-binding proten HflX  38.26 
 
 
512 aa  233  4.0000000000000004e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.13556  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10600  GTP-binding proten HflX  38.69 
 
 
521 aa  233  8.000000000000001e-60  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.697427  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1468  GTP-binding proten HflX  37.32 
 
 
553 aa  232  9e-60  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000115477 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1916  GTP-binding protein  36.1 
 
 
401 aa  231  1e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.328695  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1506  GTP-binding proten HflX  36.26 
 
 
433 aa  231  2e-59  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00115562  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3204  GTP-binding protein, HSR1-related  36.49 
 
 
435 aa  231  2e-59  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.266449  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0583  GTP-binding protein HflX  36.44 
 
 
512 aa  231  2e-59  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.622699 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3837  GTP-binding protein, HSR1-related  37.61 
 
 
493 aa  231  2e-59  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1441  small GTP-binding protein  36.36 
 
 
413 aa  231  2e-59  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1800  GTP-binding proten HflX  39.03 
 
 
479 aa  231  3e-59  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1051  GTP-binding proten HflX  38.02 
 
 
509 aa  230  5e-59  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.128813 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17490  GTP-binding proten HflX  38.06 
 
 
517 aa  229  1e-58  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.106124  normal  0.236778 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1278  GTP-binding protein, HSR1-related  44.58 
 
 
439 aa  228  1e-58  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.424036  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1562  GTP-binding proten HflX  37.81 
 
 
505 aa  228  1e-58  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.410019  hitchhiker  0.00407104 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1255  GTP-binding proten HflX  37.1 
 
 
515 aa  229  1e-58  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0497  GTP-binding proten HflX  36.7 
 
 
441 aa  228  2e-58  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.135524  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1466  small GTP-binding protein  36.84 
 
 
522 aa  228  2e-58  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00807526  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2081  small GTP-binding protein  36.16 
 
 
582 aa  227  3e-58  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00812611  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3720  putative GTPase HflX  36.02 
 
 
426 aa  227  3e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00523075  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3918  putative GTPase HflX  36.04 
 
 
426 aa  227  3e-58  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.240209  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3024  GTP-binding protein HflX  36.51 
 
 
435 aa  227  3e-58  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000099061  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0898  GTP-binding proten HflX  38.35 
 
 
417 aa  227  4e-58  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.105158  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0636  GTP-binding protein, HSR1-related  39.63 
 
 
433 aa  226  7e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0477069 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3820  GTP-binding proten HflX  39.22 
 
 
426 aa  225  1e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0373648  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002260  GTP-binding protein HflX  38.85 
 
 
429 aa  224  2e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2183  GTP-binding proten HflX  41.34 
 
 
387 aa  224  2e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1100  GTP-binding protein HflX  41.34 
 
 
387 aa  224  2e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1828  GTP-binding protein HflX  41.34 
 
 
387 aa  224  2e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0068  GTP-binding protein HflX  41.34 
 
 
387 aa  224  2e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0515568  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2349  GTP-binding protein HflX  41.34 
 
 
392 aa  224  3e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1469  GTP-binding proten HflX  41.86 
 
 
396 aa  224  3e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.795442  normal  0.339069 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1857  GTPase  36.14 
 
 
433 aa  224  3e-57  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.622907  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0057  GTP-binding proten HflX  36.12 
 
 
450 aa  223  4e-57  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.583436  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2240  GTP-binding protein HflX  41.09 
 
 
392 aa  223  4e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.224831  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0122  GTP-binding protein HSR1-related  37.04 
 
 
421 aa  223  4e-57  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000776229  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1407  small GTP-binding protein  38.29 
 
 
515 aa  223  4.9999999999999996e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000155427 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1339  GTP-binding protein HflX  41.34 
 
 
387 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.519508  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3539  small GTP-binding protein  36.49 
 
 
431 aa  223  4.9999999999999996e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0887499  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2747  GTP-binding proten HflX  32.97 
 
 
419 aa  223  4.9999999999999996e-57  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000303435  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2221  GTP-binding proten HflX  41.09 
 
 
387 aa  223  6e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.997598  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2215  GTP-binding proten HflX  35.94 
 
 
484 aa  223  6e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.166526  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0164  GTPase  37.79 
 
 
501 aa  223  7e-57  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3121  GTP-binding proten HflX  35.78 
 
 
411 aa  223  7e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.653968 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>