More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_1140 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_1140  GTP-binding proten HflX  100 
 
 
501 aa  992    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.762868 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2263  GTP-binding family protein ; K03665 GTP-binding protein HflX  83.19 
 
 
494 aa  719    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0586252 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0820  small GTP-binding protein domain-containing protein  75.94 
 
 
493 aa  649    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3269  GTP-binding proten HflX  78.4 
 
 
485 aa  632  1e-180  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000617793  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7080  GTP-binding proten HflX  69.38 
 
 
502 aa  622  1e-177  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.750227 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1051  GTP-binding proten HflX  70.44 
 
 
509 aa  615  1e-175  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.128813 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17490  GTP-binding proten HflX  67.83 
 
 
517 aa  608  1e-173  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.106124  normal  0.236778 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3837  GTP-binding protein, HSR1-related  72.79 
 
 
493 aa  605  9.999999999999999e-173  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2436  GTP-binding proten HflX  74.83 
 
 
493 aa  600  1e-170  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.292704  normal  0.693712 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1562  GTP-binding proten HflX  70.39 
 
 
505 aa  596  1e-169  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.410019  hitchhiker  0.00407104 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10600  GTP-binding proten HflX  68.81 
 
 
521 aa  597  1e-169  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.697427  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1231  small GTP-binding protein  68.63 
 
 
503 aa  592  1e-168  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.592117  normal  0.0200783 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23070  GTP-binding proten HflX  69.42 
 
 
515 aa  591  1e-168  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0748737 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1468  GTP-binding proten HflX  66.46 
 
 
553 aa  593  1e-168  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000115477 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0684  GTP-binding proten HflX  70.19 
 
 
512 aa  592  1e-168  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.518988  normal  0.674112 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27610  GTP-binding proten HflX  69.84 
 
 
482 aa  589  1e-167  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1466  small GTP-binding protein  69.58 
 
 
522 aa  590  1e-167  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00807526  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3511  small GTP-binding protein domain-containing protein  67.72 
 
 
486 aa  585  1e-166  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.67992  normal  0.0915245 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3981  GTP-binding proten HflX  68.5 
 
 
487 aa  576  1.0000000000000001e-163  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0693971  normal  0.0467716 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1503  small GTP-binding protein  72.35 
 
 
530 aa  569  1e-161  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0726763  normal  0.6234 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1255  GTP-binding proten HflX  67.61 
 
 
515 aa  565  1e-160  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1800  GTP-binding proten HflX  68.24 
 
 
479 aa  564  1.0000000000000001e-159  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3905  GTP-binding proten HflX  69 
 
 
512 aa  563  1.0000000000000001e-159  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.13556  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07300  small GTP-binding protein domain/GTP-binding conserved hypothetical protein TIGR00650  69.98 
 
 
546 aa  560  1e-158  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1482  small GTP-binding protein  67.65 
 
 
524 aa  558  1e-158  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.578947  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1449  GTP-binding protein, HSR1-related  67.53 
 
 
494 aa  552  1e-156  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.062201  normal  0.276789 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1407  small GTP-binding protein  64.99 
 
 
515 aa  555  1e-156  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000155427 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2215  GTP-binding proten HflX  64.24 
 
 
484 aa  542  1e-153  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.166526  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1436  GTP-binding proten HflX  67.17 
 
 
480 aa  530  1e-149  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3960  GTP-binding protein, HSR1-related  64.61 
 
 
482 aa  521  1e-146  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.342247  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4564  GTP-binding proten HflX  66.45 
 
 
466 aa  514  1e-144  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.631716  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2151  GTP-binding protein, HSR1-related  63.6 
 
 
483 aa  511  1e-143  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.464276  normal  0.0136453 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12738  GTP-binding protein hflX  64.02 
 
 
495 aa  508  1e-143  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.324868 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2164  GTP-binding protein, HSR1-related  63.38 
 
 
483 aa  510  1e-143  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.951338  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2210  GTP-binding protein, HSR1-related  63.38 
 
 
483 aa  510  1e-143  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.60775  normal  0.0439435 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0583  GTP-binding protein HflX  59.66 
 
 
512 aa  507  9.999999999999999e-143  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.622699 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0164  GTPase  62.06 
 
 
501 aa  506  9.999999999999999e-143  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2436  GTP-binding protein, HSR1-related  63.36 
 
 
482 aa  506  9.999999999999999e-143  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.445847  normal  0.220236 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1259  GTP-binding protein, HSR1-related  50.74 
 
 
421 aa  352  1e-95  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.027448  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1612  GTP-binding proten HflX  48.64 
 
 
436 aa  350  4e-95  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000211402  unclonable  5.44053e-16 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0528  GTP-binding proten HflX  61.67 
 
 
384 aa  348  2e-94  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.270654  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10790  GTP-binding proten HflX  47.73 
 
 
433 aa  345  2e-93  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000931239  unclonable  0.00000000274038 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1110  GTP-binding protein, HSR1-related  52.13 
 
 
422 aa  343  4e-93  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.000000612987  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3611  GTP-binding proten HflX  48.13 
 
 
414 aa  335  1e-90  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0108116  normal  0.379187 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2081  small GTP-binding protein  48.18 
 
 
582 aa  333  4e-90  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00812611  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1408  GTP-binding proten HflX  45.41 
 
 
441 aa  332  1e-89  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1441  small GTP-binding protein  45.5 
 
 
413 aa  323  3e-87  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11140  small GTP-binding protein  46.98 
 
 
395 aa  323  3e-87  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1951  GTP-binding protein  41.65 
 
 
419 aa  318  1e-85  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.697887  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3144  small GTP-binding protein  45.22 
 
 
454 aa  317  2e-85  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000830464  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2926  GTP1/OBG protein  45.78 
 
 
444 aa  318  2e-85  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0180067  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1674  GTP-binding protein  41.18 
 
 
419 aa  317  3e-85  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.887073  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1650  GTP-binding protein  41.18 
 
 
419 aa  316  6e-85  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.101149  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1872  GTP-binding protein  40.71 
 
 
419 aa  314  1.9999999999999998e-84  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000726379 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1693  GTP-binding protein  41.18 
 
 
419 aa  314  1.9999999999999998e-84  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.78132  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1835  GTP-binding protein  41.13 
 
 
419 aa  314  1.9999999999999998e-84  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1828  GTP-binding protein  41.18 
 
 
419 aa  314  1.9999999999999998e-84  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.990495  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1689  GTP1/OBG protein  40.71 
 
 
419 aa  315  1.9999999999999998e-84  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3508  GTP-binding protein  41.18 
 
 
419 aa  315  1.9999999999999998e-84  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0658  GTP-binding proten HflX  51.15 
 
 
425 aa  314  1.9999999999999998e-84  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2334  small GTP-binding protein  44.99 
 
 
454 aa  314  2.9999999999999996e-84  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0772  GTP-binding proten HflX  42.55 
 
 
437 aa  311  1e-83  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.426006  normal  0.338027 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1434  GTP-binding protein HSR1-related  40 
 
 
419 aa  311  2e-83  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2012  GTP-binding proten HflX  46.19 
 
 
440 aa  306  5.0000000000000004e-82  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0178  GTP-binding proten HflX  46.84 
 
 
596 aa  303  6.000000000000001e-81  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.22171  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1916  GTP-binding protein  42.53 
 
 
401 aa  300  3e-80  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.328695  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3097  GTP-binding proten HflX  43.28 
 
 
461 aa  298  1e-79  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000356343  normal  0.400149 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2262  GTP-binding proten HflX  42.27 
 
 
435 aa  296  4e-79  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3237  GTP-binding protein, HSR1-related  45.69 
 
 
430 aa  297  4e-79  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1731  GTP-binding proten HflX  42.79 
 
 
434 aa  296  8e-79  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0574  GTP-binding protein, HSR1-related  47.06 
 
 
421 aa  295  2e-78  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.227405  hitchhiker  0.000000000264606 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_1719  predicted protein  42.37 
 
 
415 aa  293  4e-78  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1737  GTP-binding protein, HSR1-related  42.43 
 
 
434 aa  293  5e-78  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.260139  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1093  GTP-binding proten HflX  38.75 
 
 
438 aa  292  8e-78  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000358907  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00154  GTP-binding protein  45.32 
 
 
428 aa  291  1e-77  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5672  GTP-binding proten HflX  44.44 
 
 
433 aa  291  2e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1355  GTP-binding protein HflX  48.15 
 
 
435 aa  291  2e-77  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0898  GTP-binding proten HflX  44.42 
 
 
417 aa  290  3e-77  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.105158  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0396  GTP-binding protein, HSR1-related  45.72 
 
 
489 aa  290  3e-77  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0477  GTP-binding proten HflX  48.34 
 
 
401 aa  290  4e-77  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00918489  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65300  putative GTP-binding protein  43.98 
 
 
433 aa  290  4e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0355  GTP - binding protein, phage lambda cII repressor  45.72 
 
 
489 aa  290  5.0000000000000004e-77  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3539  small GTP-binding protein  44.84 
 
 
431 aa  290  6e-77  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0887499  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1174  GTP-binding protein HflX  43.81 
 
 
431 aa  289  8e-77  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.929711  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2721  GTP-binding proten HflX  44.47 
 
 
442 aa  289  8e-77  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.43015  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3720  putative GTPase HflX  45.1 
 
 
426 aa  288  1e-76  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00523075  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0010  hypothetical protein  46.96 
 
 
414 aa  289  1e-76  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0536  putative GTPase HflX  44.85 
 
 
426 aa  288  2e-76  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000302275  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0010  hypothetical protein  46.96 
 
 
414 aa  288  2e-76  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0698  putative GTPase HflX  44.33 
 
 
428 aa  288  2e-76  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3797  putative GTPase HflX  44.33 
 
 
428 aa  288  2e-76  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0756965  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3918  putative GTPase HflX  45.1 
 
 
426 aa  288  2e-76  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.240209  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2747  GTP-binding proten HflX  37.92 
 
 
419 aa  288  2e-76  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000303435  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1868  GTP-binding protein, HSR1-related  46.43 
 
 
481 aa  287  2.9999999999999996e-76  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0249572  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3652  putative GTPase HflX  44.33 
 
 
428 aa  287  4e-76  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0534  GTP-binding proten HflX  42.48 
 
 
420 aa  285  2.0000000000000002e-75  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000187355  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002260  GTP-binding protein HflX  45.36 
 
 
429 aa  284  2.0000000000000002e-75  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3024  GTP-binding protein HflX  41.81 
 
 
435 aa  285  2.0000000000000002e-75  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000099061  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1472  GTP-binding proten HflX  44.02 
 
 
436 aa  283  4.0000000000000003e-75  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0879  GTP-binding proten HflX  49.56 
 
 
561 aa  283  4.0000000000000003e-75  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>