More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_1731 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_1584  GTP-binding proten HflX  76.71 
 
 		 434 aa  654    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1355  GTP-binding protein HflX  77.36 
 
 		 435 aa  690    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1174  GTP-binding protein HflX  78.77 
 
 		 431 aa  706    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.929711  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1731  GTP-binding proten HflX  100 
 
 		 434 aa  889    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1737  GTP-binding protein, HSR1-related  79.63 
 
 		 434 aa  707    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.260139  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0970  GTP-binding proten HflX  69.01 
 
 		 433 aa  607  9.999999999999999e-173  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.602614 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1506  GTP-binding proten HflX  71.12 
 
 		 433 aa  599  1e-170  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00115562  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2721  GTP-binding proten HflX  54.39 
 
 		 442 aa  411  1e-113  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.43015  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4167  GTP-binding proten HflX  53.02 
 
 		 396 aa  379  1e-104  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000123151  unclonable  0.00000000000307153 
 
 
-
 
NC_002950  PG1886  GTP-binding protein HflX  49.51 
 
 		 406 aa  375  1e-103  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.968139 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0477  GTP-binding proten HflX  49.87 
 
 		 401 aa  363  5.0000000000000005e-99  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00918489  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1232  hypothetical protein  49.07 
 
 		 395 aa  356  3.9999999999999996e-97  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.125901 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1171  GTP-binding protein, HSR1-related  47.06 
 
 		 409 aa  352  7e-96  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3121  GTP-binding proten HflX  50.67 
 
 		 411 aa  343  4e-93  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.653968 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0590  GTP-binding proten HflX  51.98 
 
 		 396 aa  340  4e-92  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04515  GTP-binding protein HflX  54.97 
 
 		 407 aa  336  3.9999999999999995e-91  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.546831  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6253  GTP-binding proten HflX  52.53 
 
 		 426 aa  335  1e-90  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3840  GTP1/OBG family GTP-binding protein  47.66 
 
 		 392 aa  324  2e-87  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1713  GTP-binding proten HflX  46.37 
 
 		 464 aa  318  1e-85  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.639031  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4893  GTP-binding protein HflX  51.11 
 
 		 433 aa  317  2e-85  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4769  GTP-binding protein, HSR1-related  51.11 
 
 		 433 aa  317  2e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4945  GTP-binding proten HflX  51.11 
 
 		 433 aa  317  3e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.017296 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0636  GTP-binding protein, HSR1-related  50.28 
 
 		 433 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0477069 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65300  putative GTP-binding protein  47.41 
 
 		 433 aa  312  9e-84  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5672  GTP-binding proten HflX  47.16 
 
 		 433 aa  311  1e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2012  GTP-binding proten HflX  49.44 
 
 		 440 aa  308  9e-83  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1982  GTP-binding protein  46.61 
 
 		 433 aa  308  2.0000000000000002e-82  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.699413  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1434  GTP-binding protein HSR1-related  41.46 
 
 		 419 aa  308  2.0000000000000002e-82  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0396  GTP-binding protein, HSR1-related  44.39 
 
 		 489 aa  306  7e-82  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0355  GTP - binding protein, phage lambda cII repressor  44.13 
 
 		 489 aa  303  3.0000000000000004e-81  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2081  small GTP-binding protein  43.36 
 
 		 582 aa  302  9e-81  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00812611  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2631  GTP-binding protein HSR1-related  44.06 
 
 		 429 aa  301  1e-80  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.315157  unclonable  0.00000000000608691 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1259  GTP-binding protein, HSR1-related  46.48 
 
 		 421 aa  301  1e-80  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.027448  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0010  hypothetical protein  45.05 
 
 		 414 aa  301  2e-80  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0010  hypothetical protein  45.05 
 
 		 414 aa  301  2e-80  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1441  small GTP-binding protein  46.27 
 
 		 413 aa  301  2e-80  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1414  GTP-binding proten HflX  50.15 
 
 		 414 aa  301  2e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000434774 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1689  GTP1/OBG protein  40.24 
 
 		 419 aa  300  3e-80  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1110  GTP-binding protein, HSR1-related  44.94 
 
 		 422 aa  299  5e-80  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.000000612987  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0898  GTP-binding proten HflX  44.68 
 
 		 417 aa  299  6e-80  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.105158  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0574  GTP-binding protein, HSR1-related  45.65 
 
 		 421 aa  298  9e-80  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.227405  hitchhiker  0.000000000264606 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3097  GTP-binding proten HflX  47.28 
 
 		 461 aa  298  1e-79  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000356343  normal  0.400149 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1835  GTP-binding protein  40.49 
 
 		 419 aa  298  1e-79  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2240  GTP-binding protein HflX  48.59 
 
 		 392 aa  298  1e-79  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.224831  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2448  GTP-binding protein HflX  49.17 
 
 		 535 aa  297  2e-79  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00382552 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1693  GTP-binding protein  40.49 
 
 		 419 aa  297  3e-79  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.78132  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2349  GTP-binding protein HflX  48.59 
 
 		 392 aa  297  3e-79  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1100  GTP-binding protein HflX  48.59 
 
 		 387 aa  297  3e-79  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0068  GTP-binding protein HflX  48.59 
 
 		 387 aa  297  3e-79  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0515568  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1828  GTP-binding protein  40.49 
 
 		 419 aa  297  3e-79  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.990495  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1868  GTP-binding protein, HSR1-related  42.23 
 
 		 481 aa  297  3e-79  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0249572  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1828  GTP-binding protein HflX  48.59 
 
 		 387 aa  297  3e-79  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2183  GTP-binding proten HflX  48.59 
 
 		 387 aa  297  3e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2768  GTP-binding protein, HSR1-related  45.14 
 
 		 432 aa  296  4e-79  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1650  GTP-binding protein  40.29 
 
 		 419 aa  296  5e-79  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.101149  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1469  GTP-binding proten HflX  48.31 
 
 		 396 aa  296  6e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.795442  normal  0.339069 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2221  GTP-binding proten HflX  48.59 
 
 		 387 aa  296  6e-79  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.997598  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1674  GTP-binding protein  40.29 
 
 		 419 aa  296  7e-79  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.887073  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1872  GTP-binding protein  40.45 
 
 		 419 aa  296  7e-79  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000726379 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1951  GTP-binding protein  40.54 
 
 		 419 aa  296  7e-79  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.697887  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1339  GTP-binding protein HflX  48.31 
 
 		 387 aa  295  1e-78  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.519508  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0567  GTP-binding protein, HSR1-related  45.3 
 
 		 432 aa  295  1e-78  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.102684  normal  0.249219 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1600  small GTP-binding protein  50.45 
 
 		 404 aa  294  2e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0793347  normal  0.128476 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3144  small GTP-binding protein  47.45 
 
 		 454 aa  294  2e-78  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000830464  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3539  small GTP-binding protein  45.3 
 
 		 431 aa  293  3e-78  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0887499  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2535  GTP-binding proten HflX  50.45 
 
 		 404 aa  293  3e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0955087  hitchhiker  0.0000726108 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2334  small GTP-binding protein  46.93 
 
 		 454 aa  294  3e-78  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1087  small GTP-binding protein domain-containing protein  40.33 
 
 		 436 aa  293  4e-78  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.824642  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3918  putative GTPase HflX  43.68 
 
 		 426 aa  293  4e-78  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.240209  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3720  putative GTPase HflX  43.68 
 
 		 426 aa  293  5e-78  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00523075  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5107  small GTP-binding protein  48.02 
 
 		 396 aa  292  9e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.245706  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1408  GTP-binding proten HflX  42.93 
 
 		 441 aa  291  1e-77  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1830  GTP-binding proten HflX  48.02 
 
 		 395 aa  292  1e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.497778 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2979  GTP-binding protein, HSR1-related  47.49 
 
 		 384 aa  291  1e-77  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.908653  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1717  GTP-binding proten HflX  47.74 
 
 		 396 aa  291  1e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.658318  normal  0.277641 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3508  GTP-binding protein  39.27 
 
 		 419 aa  291  1e-77  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1278  GTP-binding protein, HSR1-related  44.42 
 
 		 439 aa  292  1e-77  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.424036  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1806  small GTP-binding protein  48.02 
 
 		 395 aa  292  1e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10790  GTP-binding proten HflX  41.46 
 
 		 433 aa  291  2e-77  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000931239  unclonable  0.00000000274038 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00093  putative GTPase HflX  42.53 
 
 		 429 aa  290  2e-77  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2666  putative GTP-binding protein  44.64 
 
 		 441 aa  291  2e-77  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1744  small GTP-binding protein  48.02 
 
 		 396 aa  291  2e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3820  GTP-binding proten HflX  43.49 
 
 		 426 aa  290  4e-77  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0373648  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00650  GTP-binding protein HflX  43.6 
 
 		 429 aa  289  5.0000000000000004e-77  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.108619  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4941  GTP-binding protein HflX  47.16 
 
 		 433 aa  289  6e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002260  GTP-binding protein HflX  42.27 
 
 		 429 aa  289  6e-77  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4759  putative GTPase HflX  43.23 
 
 		 426 aa  289  6e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1916  GTP-binding protein  43.16 
 
 		 401 aa  289  8e-77  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.328695  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3611  GTP-binding proten HflX  44.64 
 
 		 414 aa  289  8e-77  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0108116  normal  0.379187 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0573  GTP-binding protein, HSR1-related  47.16 
 
 		 433 aa  289  9e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.884333 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2759  putative GTPase HflX  43.3 
 
 		 429 aa  289  9e-77  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.563886  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04040  predicted GTPase  43.49 
 
 		 426 aa  288  1e-76  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.188583  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4415  putative GTPase HflX  43.49 
 
 		 426 aa  288  1e-76  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.446722  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4704  putative GTPase HflX  43.49 
 
 		 426 aa  288  1e-76  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3840  putative GTPase HflX  43.49 
 
 		 426 aa  288  1e-76  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.209609  hitchhiker  0.000000230034 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04002  hypothetical protein  43.49 
 
 		 426 aa  288  1e-76  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.170688  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4111  GTP-binding proten HflX  41.19 
 
 		 425 aa  288  1e-76  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5689  putative GTPase HflX  43.49 
 
 		 426 aa  288  1e-76  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0600434  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4644  putative GTPase HflX  43.49 
 
 		 426 aa  288  1e-76  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0602066 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4731  putative GTPase HflX  43.49 
 
 		 426 aa  288  1e-76  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>