More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_3121 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_3121  GTP-binding proten HflX  100 
 
 		 411 aa  837    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.653968 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6253  GTP-binding proten HflX  68.35 
 
 		 426 aa  575  1.0000000000000001e-163  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1232  hypothetical protein  58.57 
 
 		 395 aa  462  1e-129  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.125901 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4167  GTP-binding proten HflX  55.56 
 
 		 396 aa  443  1e-123  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000123151  unclonable  0.00000000000307153 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04515  GTP-binding protein HflX  56.66 
 
 		 407 aa  441  9.999999999999999e-123  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.546831  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0477  GTP-binding proten HflX  57.11 
 
 		 401 aa  436  1e-121  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00918489  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1886  GTP-binding protein HflX  55.3 
 
 		 406 aa  432  1e-120  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.968139 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3840  GTP1/OBG family GTP-binding protein  57.36 
 
 		 392 aa  432  1e-120  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1171  GTP-binding protein, HSR1-related  53.12 
 
 		 409 aa  422  1e-117  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0590  GTP-binding proten HflX  53.15 
 
 		 396 aa  404  1e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2721  GTP-binding proten HflX  51.99 
 
 		 442 aa  365  1e-100  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.43015  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0970  GTP-binding proten HflX  50.27 
 
 		 433 aa  344  2e-93  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.602614 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1731  GTP-binding proten HflX  50.67 
 
 		 434 aa  343  4e-93  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1174  GTP-binding protein HflX  53.92 
 
 		 431 aa  336  5e-91  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.929711  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1737  GTP-binding protein, HSR1-related  53.46 
 
 		 434 aa  327  2.0000000000000001e-88  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.260139  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1506  GTP-binding proten HflX  46.67 
 
 		 433 aa  325  8.000000000000001e-88  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00115562  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1355  GTP-binding protein HflX  53.05 
 
 		 435 aa  323  2e-87  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1408  GTP-binding proten HflX  46.83 
 
 		 441 aa  315  9.999999999999999e-85  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1584  GTP-binding proten HflX  48.79 
 
 		 434 aa  303  3.0000000000000004e-81  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2926  GTP1/OBG protein  43.86 
 
 		 444 aa  301  1e-80  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0180067  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10790  GTP-binding proten HflX  44.39 
 
 		 433 aa  293  5e-78  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000931239  unclonable  0.00000000274038 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00650  GTP-binding protein HflX  48.58 
 
 		 429 aa  289  8e-77  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.108619  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3097  GTP-binding proten HflX  45.72 
 
 		 461 aa  285  7e-76  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000356343  normal  0.400149 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2631  GTP-binding protein HSR1-related  43.08 
 
 		 429 aa  285  8e-76  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.315157  unclonable  0.00000000000608691 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00093  putative GTPase HflX  45.83 
 
 		 429 aa  283  3.0000000000000004e-75  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0567  GTP-binding protein, HSR1-related  42.55 
 
 		 432 aa  283  3.0000000000000004e-75  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.102684  normal  0.249219 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3979  GTP-binding protein, HSR1-related  40.8 
 
 		 432 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3310  GTP-binding protein, HSR1-related  46.36 
 
 		 435 aa  282  9e-75  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002260  GTP-binding protein HflX  46.22 
 
 		 429 aa  281  1e-74  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_1719  predicted protein  46.97 
 
 		 415 aa  281  1e-74  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2221  GTP-binding proten HflX  48.1 
 
 		 387 aa  281  1e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.997598  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1717  GTP-binding proten HflX  40.9 
 
 		 396 aa  281  2e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.658318  normal  0.277641 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1472  GTP-binding proten HflX  45.68 
 
 		 436 aa  281  2e-74  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1414  GTP-binding proten HflX  43.63 
 
 		 414 aa  280  2e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000434774 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5107  small GTP-binding protein  41.15 
 
 		 396 aa  281  2e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.245706  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2240  GTP-binding protein HflX  47.78 
 
 		 392 aa  281  2e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.224831  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1830  GTP-binding proten HflX  41.43 
 
 		 395 aa  281  2e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.497778 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3539  small GTP-binding protein  45.45 
 
 		 431 aa  281  2e-74  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0887499  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1806  small GTP-binding protein  41.43 
 
 		 395 aa  281  2e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3024  GTP-binding protein HflX  41.49 
 
 		 435 aa  281  2e-74  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000099061  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1469  GTP-binding proten HflX  41.4 
 
 		 396 aa  280  3e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.795442  normal  0.339069 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2183  GTP-binding proten HflX  47.78 
 
 		 387 aa  280  3e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2349  GTP-binding protein HflX  47.78 
 
 		 392 aa  280  4e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1744  small GTP-binding protein  40.9 
 
 		 396 aa  280  4e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3144  small GTP-binding protein  45.24 
 
 		 454 aa  280  4e-74  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000830464  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1828  GTP-binding protein HflX  47.78 
 
 		 387 aa  279  5e-74  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1100  GTP-binding protein HflX  47.78 
 
 		 387 aa  279  5e-74  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0068  GTP-binding protein HflX  47.78 
 
 		 387 aa  279  5e-74  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0515568  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2334  small GTP-binding protein  45.14 
 
 		 454 aa  279  6e-74  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2979  GTP-binding protein, HSR1-related  45.48 
 
 		 384 aa  279  7e-74  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.908653  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1600  small GTP-binding protein  43.09 
 
 		 404 aa  278  1e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0793347  normal  0.128476 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1339  GTP-binding protein HflX  47.47 
 
 		 387 aa  277  2e-73  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.519508  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0898  GTP-binding proten HflX  44.29 
 
 		 417 aa  278  2e-73  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.105158  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2535  GTP-binding proten HflX  43.09 
 
 		 404 aa  278  2e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0955087  hitchhiker  0.0000726108 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3204  GTP-binding protein, HSR1-related  42.02 
 
 		 435 aa  277  2e-73  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.266449  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1689  GTP1/OBG protein  47.85 
 
 		 419 aa  278  2e-73  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1693  GTP-binding protein  47.08 
 
 		 419 aa  277  3e-73  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.78132  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1828  GTP-binding protein  47.08 
 
 		 419 aa  277  3e-73  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.990495  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1278  GTP-binding protein, HSR1-related  42.89 
 
 		 439 aa  276  4e-73  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.424036  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1951  GTP-binding protein  47.08 
 
 		 419 aa  276  4e-73  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.697887  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1612  GTP-binding proten HflX  42.74 
 
 		 436 aa  276  5e-73  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000211402  unclonable  5.44053e-16 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1872  GTP-binding protein  46.77 
 
 		 419 aa  276  5e-73  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000726379 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1674  GTP-binding protein  46.77 
 
 		 419 aa  276  6e-73  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.887073  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1650  GTP-binding protein  46.77 
 
 		 419 aa  276  6e-73  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.101149  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4169  GTP-binding proten HflX  41.75 
 
 		 432 aa  276  6e-73  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00885496  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1916  GTP-binding protein  47.08 
 
 		 401 aa  275  7e-73  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.328695  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5672  GTP-binding proten HflX  40.26 
 
 		 433 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1835  GTP-binding protein  46.77 
 
 		 419 aa  273  3e-72  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2768  GTP-binding protein, HSR1-related  45.18 
 
 		 432 aa  274  3e-72  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3237  GTP-binding protein, HSR1-related  46.06 
 
 		 430 aa  273  3e-72  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00154  GTP-binding protein  40.22 
 
 		 428 aa  273  4.0000000000000004e-72  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2759  putative GTPase HflX  42.46 
 
 		 429 aa  273  4.0000000000000004e-72  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.563886  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3508  GTP-binding protein  46.46 
 
 		 419 aa  273  5.000000000000001e-72  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65300  putative GTP-binding protein  40 
 
 		 433 aa  272  8.000000000000001e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0536  putative GTPase HflX  44.41 
 
 		 426 aa  271  2e-71  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000302275  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1982  GTP-binding protein  41.62 
 
 		 433 aa  270  4e-71  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.699413  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4704  putative GTPase HflX  40.75 
 
 		 426 aa  269  5e-71  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0798  GTP-binding protein, HSR1-related  40.99 
 
 		 432 aa  269  5.9999999999999995e-71  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00968624 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4723  putative GTPase HflX  40.75 
 
 		 426 aa  269  8e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4893  GTP-binding protein HflX  44.51 
 
 		 433 aa  269  8e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4769  GTP-binding protein, HSR1-related  44.51 
 
 		 433 aa  269  8e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4780  putative GTPase HflX  40.75 
 
 		 426 aa  269  8e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0452958  normal  0.331117 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4945  GTP-binding proten HflX  44.51 
 
 		 433 aa  269  8e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.017296 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4759  putative GTPase HflX  40.75 
 
 		 426 aa  269  8e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4630  putative GTPase HflX  40.75 
 
 		 426 aa  269  8e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.048412  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4640  putative GTPase HflX  40.75 
 
 		 426 aa  269  8e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.208484  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04040  predicted GTPase  40.48 
 
 		 426 aa  268  1e-70  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.188583  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3820  GTP-binding proten HflX  40.48 
 
 		 426 aa  268  1e-70  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0373648  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04002  hypothetical protein  40.48 
 
 		 426 aa  268  1e-70  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.170688  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4644  putative GTPase HflX  40.48 
 
 		 426 aa  268  1e-70  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0602066 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5689  putative GTPase HflX  40.48 
 
 		 426 aa  268  1e-70  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0600434  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3840  putative GTPase HflX  40.48 
 
 		 426 aa  268  1e-70  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.209609  hitchhiker  0.000000230034 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0599  GTP-binding protein, HSR1-related  41.27 
 
 		 435 aa  268  1e-70  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00843062  hitchhiker  0.00021975 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3431  GTP-binding protein, HSR1-related  41.27 
 
 		 435 aa  268  1e-70  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.253406  normal  0.0436905 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4731  putative GTPase HflX  40.48 
 
 		 426 aa  268  1e-70  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2776  putative GTPase HflX  42.9 
 
 		 439 aa  268  1e-70  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.114582  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4415  putative GTPase HflX  40.48 
 
 		 426 aa  268  1e-70  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.446722  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0636  GTP-binding protein, HSR1-related  40.84 
 
 		 433 aa  267  2e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0477069 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0356  putative GTPase HflX  43.5 
 
 		 426 aa  267  2e-70  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.152366  hitchhiker  0.00466267 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2666  putative GTP-binding protein  45.77 
 
 		 441 aa  268  2e-70  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>