More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_3611 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013216  Dtox_3611  GTP-binding proten HflX  100 
 
 
414 aa  835    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0108116  normal  0.379187 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1259  GTP-binding protein, HSR1-related  60.93 
 
 
421 aa  464  1e-129  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.027448  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1110  GTP-binding protein, HSR1-related  58.98 
 
 
422 aa  441  9.999999999999999e-123  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.000000612987  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1408  GTP-binding proten HflX  53.22 
 
 
441 aa  369  1e-101  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3144  small GTP-binding protein  50.12 
 
 
454 aa  364  1e-99  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000830464  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3097  GTP-binding proten HflX  51.1 
 
 
461 aa  362  8e-99  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000356343  normal  0.400149 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2262  GTP-binding proten HflX  52.31 
 
 
435 aa  359  6e-98  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2334  small GTP-binding protein  49.88 
 
 
454 aa  356  3.9999999999999996e-97  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1231  small GTP-binding protein  48.28 
 
 
503 aa  352  8.999999999999999e-96  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.592117  normal  0.0200783 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11140  small GTP-binding protein  52.96 
 
 
395 aa  351  2e-95  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10600  GTP-binding proten HflX  49.76 
 
 
521 aa  350  2e-95  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.697427  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2215  GTP-binding proten HflX  45.71 
 
 
484 aa  350  3e-95  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.166526  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1051  GTP-binding proten HflX  47.65 
 
 
509 aa  349  5e-95  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.128813 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2081  small GTP-binding protein  50.25 
 
 
582 aa  349  6e-95  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00812611  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10790  GTP-binding proten HflX  47.45 
 
 
433 aa  348  8e-95  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000931239  unclonable  0.00000000274038 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0178  GTP-binding proten HflX  50.49 
 
 
596 aa  347  2e-94  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.22171  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1441  small GTP-binding protein  50.98 
 
 
413 aa  345  1e-93  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7080  GTP-binding proten HflX  48.25 
 
 
502 aa  344  2e-93  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.750227 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2926  GTP1/OBG protein  47.63 
 
 
444 aa  343  2.9999999999999997e-93  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0180067  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3905  GTP-binding proten HflX  46.81 
 
 
512 aa  338  9.999999999999999e-92  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.13556  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3511  small GTP-binding protein domain-containing protein  48.03 
 
 
486 aa  338  9.999999999999999e-92  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.67992  normal  0.0915245 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0820  small GTP-binding protein domain-containing protein  47.76 
 
 
493 aa  337  1.9999999999999998e-91  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2436  GTP-binding proten HflX  47.55 
 
 
493 aa  334  2e-90  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.292704  normal  0.693712 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27610  GTP-binding proten HflX  47.22 
 
 
482 aa  333  3e-90  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1140  GTP-binding proten HflX  49 
 
 
501 aa  333  4e-90  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.762868 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1503  small GTP-binding protein  46.99 
 
 
530 aa  333  4e-90  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0726763  normal  0.6234 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0010  hypothetical protein  49.75 
 
 
414 aa  331  2e-89  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0010  hypothetical protein  49.75 
 
 
414 aa  331  2e-89  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3269  GTP-binding proten HflX  47.43 
 
 
485 aa  331  2e-89  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000617793  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0684  GTP-binding proten HflX  45.56 
 
 
512 aa  329  7e-89  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.518988  normal  0.674112 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1612  GTP-binding proten HflX  47.15 
 
 
436 aa  328  8e-89  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000211402  unclonable  5.44053e-16 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3734  GTP-binding protein  57.36 
 
 
424 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3452  GTP-binding protein (hflX)  52.8 
 
 
425 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3716  GTP-binding protein  52.8 
 
 
425 aa  327  2.0000000000000001e-88  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.1723499999999997e-21 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3553  GTP-binding protein  58.57 
 
 
354 aa  327  3e-88  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3806  GTP-binding protein  57.36 
 
 
425 aa  327  3e-88  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3757  GTP-binding protein  52.53 
 
 
425 aa  326  4.0000000000000003e-88  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00868177  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07300  small GTP-binding protein domain/GTP-binding conserved hypothetical protein TIGR00650  47.78 
 
 
546 aa  326  6e-88  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2768  GTP-binding protein, HSR1-related  47.12 
 
 
432 aa  325  6e-88  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1800  GTP-binding proten HflX  45.26 
 
 
479 aa  325  8.000000000000001e-88  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3981  GTP-binding proten HflX  47.17 
 
 
487 aa  325  9e-88  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0693971  normal  0.0467716 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23070  GTP-binding proten HflX  47.26 
 
 
515 aa  325  1e-87  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0748737 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1499  GTP-binding protein  52.27 
 
 
425 aa  325  1e-87  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0819317 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3472  GTP1/OBG protein  56.46 
 
 
423 aa  324  2e-87  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0294358  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2263  GTP-binding family protein ; K03665 GTP-binding protein HflX  47.88 
 
 
494 aa  324  2e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0586252 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3539  small GTP-binding protein  48.22 
 
 
431 aa  323  3e-87  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0887499  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1255  GTP-binding proten HflX  47.12 
 
 
515 aa  323  3e-87  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0164  GTPase  45.76 
 
 
501 aa  323  4e-87  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1466  small GTP-binding protein  46.53 
 
 
522 aa  323  4e-87  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00807526  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0493  putative GTPase HflX  47.84 
 
 
433 aa  322  5e-87  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0353897  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1468  GTP-binding proten HflX  45.97 
 
 
553 aa  322  6e-87  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000115477 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3465  GTP-binding protein  52 
 
 
425 aa  322  9.999999999999999e-87  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5672  GTP-binding proten HflX  48.18 
 
 
433 aa  321  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2384  small GTP-binding protein  51.45 
 
 
420 aa  321  1.9999999999999998e-86  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.740042  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4340  GTP-binding protein, HSR1-related  52.76 
 
 
451 aa  321  1.9999999999999998e-86  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.436695  normal  0.136604 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65300  putative GTP-binding protein  47.93 
 
 
433 aa  320  3.9999999999999996e-86  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3837  GTP-binding protein, HSR1-related  48.13 
 
 
493 aa  320  3.9999999999999996e-86  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0536  putative GTPase HflX  46.4 
 
 
426 aa  320  3.9999999999999996e-86  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000302275  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0665  GTP-binding protein, HSR1-related  47.5 
 
 
445 aa  319  5e-86  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0655164  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2666  putative GTP-binding protein  46.62 
 
 
441 aa  319  6e-86  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0898  GTP-binding proten HflX  48.31 
 
 
417 aa  318  1e-85  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.105158  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3979  GTP-binding protein, HSR1-related  46.82 
 
 
432 aa  318  1e-85  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1232  GTP-binding proten HflX  51.14 
 
 
415 aa  318  1e-85  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000402227  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2114  GTP-binding proten HflX  52.55 
 
 
415 aa  317  2e-85  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3918  putative GTPase HflX  47.22 
 
 
426 aa  317  2e-85  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.240209  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00650  GTP-binding protein HflX  47.84 
 
 
429 aa  317  2e-85  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.108619  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3720  putative GTPase HflX  46.97 
 
 
426 aa  317  3e-85  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00523075  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04040  predicted GTPase  46.06 
 
 
426 aa  316  4e-85  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.188583  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3840  putative GTPase HflX  46.06 
 
 
426 aa  316  4e-85  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.209609  hitchhiker  0.000000230034 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4644  putative GTPase HflX  46.06 
 
 
426 aa  316  4e-85  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0602066 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04002  hypothetical protein  46.06 
 
 
426 aa  316  4e-85  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.170688  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4731  putative GTPase HflX  46.06 
 
 
426 aa  316  4e-85  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5689  putative GTPase HflX  46.06 
 
 
426 aa  316  4e-85  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0600434  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4415  putative GTPase HflX  46.06 
 
 
426 aa  316  4e-85  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.446722  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4704  putative GTPase HflX  46.06 
 
 
426 aa  316  5e-85  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0218  GTP-binding protein HSR1-related  53.85 
 
 
599 aa  316  5e-85  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.116932  normal  0.0905188 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3183  small GTP-binding protein  56.33 
 
 
532 aa  316  5e-85  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0583  GTP-binding protein HflX  45.16 
 
 
512 aa  315  6e-85  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.622699 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0636  GTP-binding protein, HSR1-related  49.24 
 
 
433 aa  316  6e-85  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0477069 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4759  putative GTPase HflX  46.06 
 
 
426 aa  315  8e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4723  putative GTPase HflX  46.06 
 
 
426 aa  315  9e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4780  putative GTPase HflX  46.06 
 
 
426 aa  315  9e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0452958  normal  0.331117 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4630  putative GTPase HflX  46.06 
 
 
426 aa  315  9e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.048412  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4640  putative GTPase HflX  46.06 
 
 
426 aa  315  9e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.208484  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3820  GTP-binding proten HflX  46.06 
 
 
426 aa  314  1.9999999999999998e-84  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0373648  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2721  GTP-binding proten HflX  45.85 
 
 
442 aa  314  1.9999999999999998e-84  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.43015  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2631  GTP-binding protein HSR1-related  47.84 
 
 
429 aa  314  1.9999999999999998e-84  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.315157  unclonable  0.00000000000608691 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1562  GTP-binding proten HflX  46.72 
 
 
505 aa  313  2.9999999999999996e-84  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.410019  hitchhiker  0.00407104 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_1719  predicted protein  44.28 
 
 
415 aa  313  3.9999999999999997e-84  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3797  putative GTPase HflX  45.7 
 
 
428 aa  313  3.9999999999999997e-84  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0756965  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1835  GTP-binding protein  43.41 
 
 
419 aa  313  3.9999999999999997e-84  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3204  GTP-binding protein, HSR1-related  46.33 
 
 
435 aa  313  3.9999999999999997e-84  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.266449  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3652  putative GTPase HflX  45.66 
 
 
428 aa  313  3.9999999999999997e-84  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0698  putative GTPase HflX  45.7 
 
 
428 aa  313  3.9999999999999997e-84  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4167  GTP-binding proten HflX  47.21 
 
 
396 aa  313  4.999999999999999e-84  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000123151  unclonable  0.00000000000307153 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0432  putative GTPase HflX  45.66 
 
 
426 aa  313  4.999999999999999e-84  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000150209  unclonable  0.0000000363353 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17490  GTP-binding proten HflX  45.79 
 
 
517 aa  313  4.999999999999999e-84  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.106124  normal  0.236778 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1731  GTP-binding proten HflX  44.25 
 
 
434 aa  312  4.999999999999999e-84  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1407  small GTP-binding protein  46.62 
 
 
515 aa  312  7.999999999999999e-84  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000155427 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0658  GTP-binding proten HflX  47.04 
 
 
425 aa  312  9e-84  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>