More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_2334 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_2334  small GTP-binding protein  100 
 
 		 454 aa  910    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3144  small GTP-binding protein  93.83 
 
 		 454 aa  830    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000830464  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3097  GTP-binding proten HflX  65 
 
 		 461 aa  573  1.0000000000000001e-162  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000356343  normal  0.400149 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2926  GTP1/OBG protein  60.37 
 
 		 444 aa  524  1e-147  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0180067  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1408  GTP-binding proten HflX  54.71 
 
 		 441 aa  444  1e-123  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_1719  predicted protein  45.54 
 
 		 415 aa  365  1e-100  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1259  GTP-binding protein, HSR1-related  49.03 
 
 		 421 aa  360  4e-98  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.027448  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10790  GTP-binding proten HflX  47.09 
 
 		 433 aa  357  1.9999999999999998e-97  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000931239  unclonable  0.00000000274038 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1051  GTP-binding proten HflX  47.37 
 
 		 509 aa  347  3e-94  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.128813 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0772  GTP-binding proten HflX  45.01 
 
 		 437 aa  346  6e-94  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.426006  normal  0.338027 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3611  GTP-binding proten HflX  49.17 
 
 		 414 aa  345  8e-94  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0108116  normal  0.379187 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_643  GTP-binding protein  51.92 
 
 		 403 aa  342  8e-93  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.13619  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1612  GTP-binding proten HflX  46.62 
 
 		 436 aa  342  1e-92  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000211402  unclonable  5.44053e-16 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0667  GTP-binding protein, HSR1-related  51.23 
 
 		 403 aa  340  4e-92  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000065557  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0737  GTP-binding protein, putative  50.55 
 
 		 380 aa  335  1e-90  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.085807  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2721  GTP-binding proten HflX  46.19 
 
 		 442 aa  334  2e-90  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.43015  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2262  GTP-binding proten HflX  45.06 
 
 		 435 aa  327  3e-88  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1441  small GTP-binding protein  44.65 
 
 		 413 aa  326  5e-88  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1110  GTP-binding protein, HSR1-related  48.92 
 
 		 422 aa  325  1e-87  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.000000612987  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0355  GTP - binding protein, phage lambda cII repressor  44.55 
 
 		 489 aa  318  2e-85  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32115  predicted protein  40.29 
 
 		 519 aa  318  2e-85  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0250041 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0396  GTP-binding protein, HSR1-related  44.31 
 
 		 489 aa  317  4e-85  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0534  GTP-binding proten HflX  44.47 
 
 		 420 aa  315  8e-85  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000187355  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10600  GTP-binding proten HflX  46.76 
 
 		 521 aa  314  1.9999999999999998e-84  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.697427  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4945  GTP-binding proten HflX  46.08 
 
 		 433 aa  313  3.9999999999999997e-84  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.017296 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4893  GTP-binding protein HflX  46.08 
 
 		 433 aa  313  4.999999999999999e-84  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0820  small GTP-binding protein domain-containing protein  45.93 
 
 		 493 aa  313  4.999999999999999e-84  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4769  GTP-binding protein, HSR1-related  46.08 
 
 		 433 aa  313  4.999999999999999e-84  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00154  GTP-binding protein  46 
 
 		 428 aa  312  5.999999999999999e-84  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7080  GTP-binding proten HflX  43.63 
 
 		 502 aa  312  9e-84  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.750227 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6253  GTP-binding proten HflX  47.43 
 
 		 426 aa  311  1e-83  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11140  small GTP-binding protein  43.77 
 
 		 395 aa  311  2e-83  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1355  GTP-binding protein HflX  48.5 
 
 		 435 aa  311  2e-83  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4167  GTP-binding proten HflX  49.11 
 
 		 396 aa  311  2e-83  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000123151  unclonable  0.00000000000307153 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0574  GTP-binding protein, HSR1-related  46.27 
 
 		 421 aa  311  2e-83  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.227405  hitchhiker  0.000000000264606 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4111  GTP-binding proten HflX  44.81 
 
 		 425 aa  310  2.9999999999999997e-83  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2012  GTP-binding proten HflX  44.96 
 
 		 440 aa  310  4e-83  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1886  GTP-binding protein HflX  45.48 
 
 		 406 aa  308  1.0000000000000001e-82  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.968139 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2081  small GTP-binding protein  44.42 
 
 		 582 aa  308  1.0000000000000001e-82  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00812611  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1472  GTP-binding proten HflX  45 
 
 		 436 aa  308  1.0000000000000001e-82  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0636  GTP-binding protein, HSR1-related  44.89 
 
 		 433 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0477069 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2666  putative GTP-binding protein  44.15 
 
 		 441 aa  307  2.0000000000000002e-82  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2215  GTP-binding proten HflX  43.26 
 
 		 484 aa  307  2.0000000000000002e-82  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.166526  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0477  GTP-binding proten HflX  43.43 
 
 		 401 aa  306  3e-82  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00918489  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00650  GTP-binding protein HflX  43.13 
 
 		 429 aa  307  3e-82  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.108619  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0898  GTP-binding proten HflX  45.2 
 
 		 417 aa  307  3e-82  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.105158  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27610  GTP-binding proten HflX  45.97 
 
 		 482 aa  305  8.000000000000001e-82  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1800  GTP-binding proten HflX  45.33 
 
 		 479 aa  305  9.000000000000001e-82  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0010  hypothetical protein  47.98 
 
 		 414 aa  305  1.0000000000000001e-81  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0010  hypothetical protein  47.98 
 
 		 414 aa  305  1.0000000000000001e-81  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1231  small GTP-binding protein  43.4 
 
 		 503 aa  305  1.0000000000000001e-81  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.592117  normal  0.0200783 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65300  putative GTP-binding protein  45.54 
 
 		 433 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5672  GTP-binding proten HflX  45.54 
 
 		 433 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23070  GTP-binding proten HflX  45.41 
 
 		 515 aa  304  2.0000000000000002e-81  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0748737 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1731  GTP-binding proten HflX  46.93 
 
 		 434 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0665  GTP-binding protein, HSR1-related  45.35 
 
 		 445 aa  303  3.0000000000000004e-81  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0655164  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0567  GTP-binding protein, HSR1-related  43.19 
 
 		 432 aa  303  3.0000000000000004e-81  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.102684  normal  0.249219 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3539  small GTP-binding protein  43 
 
 		 431 aa  303  4.0000000000000003e-81  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0887499  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3310  GTP-binding protein, HSR1-related  42.62 
 
 		 435 aa  303  4.0000000000000003e-81  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3024  GTP-binding protein HflX  43.37 
 
 		 435 aa  303  4.0000000000000003e-81  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000099061  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002260  GTP-binding protein HflX  43.07 
 
 		 429 aa  303  5.000000000000001e-81  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3204  GTP-binding protein, HSR1-related  42.3 
 
 		 435 aa  303  5.000000000000001e-81  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.266449  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0497  GTP-binding proten HflX  45.5 
 
 		 441 aa  302  7.000000000000001e-81  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.135524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00093  putative GTPase HflX  42.82 
 
 		 429 aa  302  8.000000000000001e-81  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1693  GTP-binding protein  40.94 
 
 		 419 aa  302  9e-81  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.78132  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1828  GTP-binding protein  40.94 
 
 		 419 aa  302  9e-81  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.990495  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3237  GTP-binding protein, HSR1-related  44.64 
 
 		 430 aa  302  9e-81  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1982  GTP-binding protein  47.24 
 
 		 433 aa  301  1e-80  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.699413  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1140  GTP-binding proten HflX  44.06 
 
 		 501 aa  301  1e-80  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.762868 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0536  putative GTPase HflX  42.07 
 
 		 426 aa  302  1e-80  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000302275  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3981  GTP-binding proten HflX  44.24 
 
 		 487 aa  302  1e-80  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0693971  normal  0.0467716 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2759  putative GTPase HflX  43.31 
 
 		 429 aa  301  1e-80  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.563886  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2263  GTP-binding family protein ; K03665 GTP-binding protein HflX  44.29 
 
 		 494 aa  301  1e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0586252 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0940  GTP-binding proten HflX  44.12 
 
 		 454 aa  300  2e-80  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1048  GTP-binding protein  44.12 
 
 		 454 aa  301  2e-80  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1868  GTP-binding protein, HSR1-related  41.71 
 
 		 481 aa  301  2e-80  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0249572  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1174  GTP-binding protein HflX  46.4 
 
 		 431 aa  300  3e-80  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.929711  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0599  GTP-binding protein, HSR1-related  44.25 
 
 		 435 aa  300  3e-80  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00843062  hitchhiker  0.00021975 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3431  GTP-binding protein, HSR1-related  44.25 
 
 		 435 aa  300  3e-80  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.253406  normal  0.0436905 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1434  GTP-binding protein HSR1-related  39.81 
 
 		 419 aa  300  4e-80  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3979  GTP-binding protein, HSR1-related  43.41 
 
 		 432 aa  300  5e-80  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3279  GTP-binding protein, HSR1-related  44.15 
 
 		 435 aa  300  5e-80  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00360977  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1737  GTP-binding protein, HSR1-related  50.31 
 
 		 434 aa  299  6e-80  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.260139  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1872  GTP-binding protein  40.87 
 
 		 419 aa  299  9e-80  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000726379 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0598  GTP-binding protein, HSR1-related  44.15 
 
 		 435 aa  299  9e-80  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.472321  hitchhiker  0.00000215533 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3720  putative GTPase HflX  42.31 
 
 		 426 aa  298  1e-79  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00523075  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1674  GTP-binding protein  40.57 
 
 		 419 aa  298  1e-79  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.887073  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1689  GTP1/OBG protein  39.81 
 
 		 419 aa  298  1e-79  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3918  putative GTPase HflX  42.31 
 
 		 426 aa  298  2e-79  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.240209  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0604  GTP-binding protein HflX  43.9 
 
 		 435 aa  297  2e-79  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1650  GTP-binding protein  40.57 
 
 		 419 aa  298  2e-79  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.101149  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1087  small GTP-binding protein domain-containing protein  41.86 
 
 		 436 aa  297  2e-79  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.824642  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1171  GTP-binding protein, HSR1-related  43.73 
 
 		 409 aa  297  2e-79  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2631  GTP-binding protein HSR1-related  41.56 
 
 		 429 aa  297  2e-79  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.315157  unclonable  0.00000000000608691 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0164  GTPase  45.45 
 
 		 501 aa  297  3e-79  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0559  GTP-binding protein, HSR1-related  43.66 
 
 		 435 aa  296  4e-79  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00128459  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3766  GTP-binding protein HSR1-related  43.66 
 
 		 435 aa  296  4e-79  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000736905  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1951  GTP-binding protein  40.57 
 
 		 419 aa  296  4e-79  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.697887  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1835  GTP-binding protein  40.33 
 
 		 419 aa  296  4e-79  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3892  GTP-binding proten HflX  43.66 
 
 		 435 aa  296  6e-79  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.030857  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>