More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_23070 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_1562  GTP-binding proten HflX  82.12 
 
 		 505 aa  714    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.410019  hitchhiker  0.00407104 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23070  GTP-binding proten HflX  100 
 
 		 515 aa  1009    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0748737 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1051  GTP-binding proten HflX  78.6 
 
 		 509 aa  748    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.128813 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1255  GTP-binding proten HflX  79.47 
 
 		 515 aa  719    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2436  GTP-binding proten HflX  75.53 
 
 		 493 aa  645    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.292704  normal  0.693712 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1468  GTP-binding proten HflX  69.29 
 
 		 553 aa  641    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000115477 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1466  small GTP-binding protein  71.81 
 
 		 522 aa  633  1e-180  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00807526  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10600  GTP-binding proten HflX  69.81 
 
 		 521 aa  630  1e-179  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.697427  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7080  GTP-binding proten HflX  69.98 
 
 		 502 aa  612  9.999999999999999e-175  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.750227 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17490  GTP-binding proten HflX  70.24 
 
 		 517 aa  597  1e-169  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.106124  normal  0.236778 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1140  GTP-binding proten HflX  68.7 
 
 		 501 aa  594  1e-168  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.762868 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3837  GTP-binding protein, HSR1-related  68.74 
 
 		 493 aa  583  1.0000000000000001e-165  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2263  GTP-binding family protein ; K03665 GTP-binding protein HflX  68.29 
 
 		 494 aa  581  1e-164  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0586252 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1503  small GTP-binding protein  71 
 
 		 530 aa  578  1e-164  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0726763  normal  0.6234 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3269  GTP-binding proten HflX  71.36 
 
 		 485 aa  577  1.0000000000000001e-163  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000617793  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07300  small GTP-binding protein domain/GTP-binding conserved hypothetical protein TIGR00650  63.08 
 
 		 546 aa  571  1e-161  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1231  small GTP-binding protein  65.88 
 
 		 503 aa  567  1e-160  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.592117  normal  0.0200783 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27610  GTP-binding proten HflX  67.1 
 
 		 482 aa  563  1.0000000000000001e-159  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3905  GTP-binding proten HflX  68.69 
 
 		 512 aa  544  1e-153  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.13556  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0820  small GTP-binding protein domain-containing protein  65.62 
 
 		 493 aa  542  1e-153  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3511  small GTP-binding protein domain-containing protein  67.18 
 
 		 486 aa  537  1e-151  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.67992  normal  0.0915245 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0684  GTP-binding proten HflX  65.34 
 
 		 512 aa  537  1e-151  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.518988  normal  0.674112 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3981  GTP-binding proten HflX  64.85 
 
 		 487 aa  526  1e-148  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0693971  normal  0.0467716 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1800  GTP-binding proten HflX  64.67 
 
 		 479 aa  522  1e-147  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1482  small GTP-binding protein  63.98 
 
 		 524 aa  522  1e-147  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.578947  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1436  GTP-binding proten HflX  67.76 
 
 		 480 aa  517  1.0000000000000001e-145  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2215  GTP-binding proten HflX  62.5 
 
 		 484 aa  516  1.0000000000000001e-145  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.166526  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0164  GTPase  60.86 
 
 		 501 aa  515  1.0000000000000001e-145  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1407  small GTP-binding protein  65.86 
 
 		 515 aa  513  1e-144  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000155427 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0583  GTP-binding protein HflX  59.48 
 
 		 512 aa  508  1e-143  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.622699 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4564  GTP-binding proten HflX  67.25 
 
 		 466 aa  506  9.999999999999999e-143  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.631716  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1449  GTP-binding protein, HSR1-related  65.56 
 
 		 494 aa  506  9.999999999999999e-143  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.062201  normal  0.276789 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2151  GTP-binding protein, HSR1-related  65.43 
 
 		 483 aa  497  1e-139  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.464276  normal  0.0136453 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2164  GTP-binding protein, HSR1-related  65.21 
 
 		 483 aa  496  1e-139  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.951338  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2210  GTP-binding protein, HSR1-related  65.21 
 
 		 483 aa  496  1e-139  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.60775  normal  0.0439435 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3960  GTP-binding protein, HSR1-related  63.77 
 
 		 482 aa  486  1e-136  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.342247  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2436  GTP-binding protein, HSR1-related  65.42 
 
 		 482 aa  488  1e-136  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.445847  normal  0.220236 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12738  GTP-binding protein hflX  63.46 
 
 		 495 aa  483  1e-135  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.324868 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1259  GTP-binding protein, HSR1-related  47.85 
 
 		 421 aa  352  7e-96  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.027448  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10790  GTP-binding proten HflX  47.42 
 
 		 433 aa  337  1.9999999999999998e-91  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000931239  unclonable  0.00000000274038 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1408  GTP-binding proten HflX  45.06 
 
 		 441 aa  327  3e-88  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1110  GTP-binding protein, HSR1-related  49.75 
 
 		 422 aa  326  7e-88  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.000000612987  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11140  small GTP-binding protein  45.84 
 
 		 395 aa  325  1e-87  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3611  GTP-binding proten HflX  46.06 
 
 		 414 aa  322  8e-87  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0108116  normal  0.379187 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1612  GTP-binding proten HflX  46.23 
 
 		 436 aa  322  9.999999999999999e-87  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000211402  unclonable  5.44053e-16 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0528  GTP-binding proten HflX  61.3 
 
 		 384 aa  320  6e-86  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.270654  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1434  GTP-binding protein HSR1-related  40.59 
 
 		 419 aa  316  6e-85  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1951  GTP-binding protein  41.08 
 
 		 419 aa  313  3.9999999999999997e-84  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.697887  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2334  small GTP-binding protein  45.45 
 
 		 454 aa  313  6.999999999999999e-84  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1689  GTP1/OBG protein  40.79 
 
 		 419 aa  312  9e-84  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1674  GTP-binding protein  40.59 
 
 		 419 aa  311  2e-83  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.887073  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3144  small GTP-binding protein  45.65 
 
 		 454 aa  310  2.9999999999999997e-83  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000830464  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1650  GTP-binding protein  40.59 
 
 		 419 aa  310  2.9999999999999997e-83  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.101149  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1835  GTP-binding protein  40.59 
 
 		 419 aa  310  2.9999999999999997e-83  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3508  GTP-binding protein  40.83 
 
 		 419 aa  310  4e-83  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1872  GTP-binding protein  40.54 
 
 		 419 aa  310  4e-83  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000726379 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1916  GTP-binding protein  42.27 
 
 		 401 aa  309  6.999999999999999e-83  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.328695  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0658  GTP-binding proten HflX  49.15 
 
 		 425 aa  309  8e-83  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1441  small GTP-binding protein  43.6 
 
 		 413 aa  309  9e-83  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1693  GTP-binding protein  40.59 
 
 		 419 aa  308  1.0000000000000001e-82  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.78132  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1828  GTP-binding protein  40.59 
 
 		 419 aa  308  1.0000000000000001e-82  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.990495  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0772  GTP-binding proten HflX  42.38 
 
 		 437 aa  307  3e-82  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.426006  normal  0.338027 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2081  small GTP-binding protein  43.95 
 
 		 582 aa  306  5.0000000000000004e-82  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00812611  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0534  GTP-binding proten HflX  43.61 
 
 		 420 aa  304  3.0000000000000004e-81  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000187355  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3097  GTP-binding proten HflX  43.96 
 
 		 461 aa  303  5.000000000000001e-81  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000356343  normal  0.400149 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2926  GTP1/OBG protein  44.88 
 
 		 444 aa  303  6.000000000000001e-81  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0180067  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_1719  predicted protein  41.2 
 
 		 415 aa  303  7.000000000000001e-81  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2012  GTP-binding proten HflX  46.31 
 
 		 440 aa  301  1e-80  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0178  GTP-binding proten HflX  44.73 
 
 		 596 aa  299  1e-79  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.22171  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0574  GTP-binding protein, HSR1-related  46.95 
 
 		 421 aa  294  3e-78  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.227405  hitchhiker  0.000000000264606 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0275  GTP-binding proten HflX  47.33 
 
 		 564 aa  292  9e-78  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0275  GTP-binding proten HflX  47.33 
 
 		 564 aa  292  1e-77  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0898  GTP-binding proten HflX  47.22 
 
 		 417 aa  291  2e-77  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.105158  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2262  GTP-binding proten HflX  42.75 
 
 		 435 aa  291  2e-77  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1093  GTP-binding proten HflX  41 
 
 		 438 aa  290  3e-77  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000358907  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1737  GTP-binding protein, HSR1-related  46.56 
 
 		 434 aa  290  3e-77  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.260139  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0477  GTP-binding proten HflX  45.88 
 
 		 401 aa  290  4e-77  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00918489  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0010  hypothetical protein  44.77 
 
 		 414 aa  287  2e-76  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00154  GTP-binding protein  47.33 
 
 		 428 aa  288  2e-76  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0394  small GTP-binding protein  44.12 
 
 		 406 aa  287  2.9999999999999996e-76  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000766043  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0010  hypothetical protein  44.77 
 
 		 414 aa  286  4e-76  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3237  GTP-binding protein, HSR1-related  42.86 
 
 		 430 aa  286  5e-76  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2721  GTP-binding proten HflX  44.62 
 
 		 442 aa  285  1.0000000000000001e-75  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.43015  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3241  GTP-binding proten HflX  44.33 
 
 		 553 aa  284  3.0000000000000004e-75  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.300166  normal  0.108052 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1355  GTP-binding protein HflX  46.56 
 
 		 435 aa  283  4.0000000000000003e-75  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0410  GTP-binding protein HflX  43.05 
 
 		 420 aa  282  1e-74  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1731  GTP-binding proten HflX  41.4 
 
 		 434 aa  282  1e-74  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1212  GTP-binding protein HflX  44.92 
 
 		 412 aa  281  2e-74  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1081  GTP-binding proten HflX  46.09 
 
 		 405 aa  281  2e-74  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0783851  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00093  putative GTPase HflX  44.2 
 
 		 429 aa  281  2e-74  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1628  GTP-binding protein, HSR1-related  40.24 
 
 		 425 aa  281  2e-74  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3259  GTP-binding proten HflX  50 
 
 		 450 aa  281  2e-74  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0957781 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1584  GTP-binding proten HflX  44.28 
 
 		 434 aa  281  2e-74  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3720  putative GTPase HflX  43.81 
 
 		 426 aa  281  2e-74  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00523075  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0879  GTP-binding proten HflX  45.88 
 
 		 561 aa  281  2e-74  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1171  GTP-binding protein, HSR1-related  39.8 
 
 		 409 aa  280  4e-74  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1087  small GTP-binding protein domain-containing protein  41.71 
 
 		 436 aa  280  4e-74  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.824642  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3918  putative GTPase HflX  43.81 
 
 		 426 aa  280  4e-74  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.240209  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4111  GTP-binding proten HflX  42.39 
 
 		 425 aa  280  4e-74  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0057  GTP-binding proten HflX  45.33 
 
 		 450 aa  280  5e-74  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.583436  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>