More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_0879 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_0879  GTP-binding proten HflX  100 
 
 		 561 aa  1115    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2283  GTP-binding proten HflX  58.92 
 
 		 549 aa  600  1e-170  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0376  GTP-binding protein HflX  65.64 
 
 		 490 aa  572  1.0000000000000001e-162  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3023  GTP-binding proten HflX  57.94 
 
 		 540 aa  561  1e-158  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0152  small GTP-binding protein  67.07 
 
 		 547 aa  549  1e-155  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.352446 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1947  GTP-binding proten HflX  53.15 
 
 		 655 aa  521  1e-146  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3183  small GTP-binding protein  51.91 
 
 		 532 aa  436  1e-121  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2043  GTP-binding protein  50.74 
 
 		 547 aa  430  1e-119  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000980367  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0005  GTP-binding protein HSR1-related  46.99 
 
 		 565 aa  422  1e-117  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0218  GTP-binding protein HSR1-related  49.34 
 
 		 599 aa  413  1e-114  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.116932  normal  0.0905188 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0216  GTP-binding proten HflX  49.72 
 
 		 607 aa  407  1.0000000000000001e-112  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0227  GTP-binding proten HflX  49.72 
 
 		 607 aa  407  1.0000000000000001e-112  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.160426  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0203  GTP-binding protein, HSR1-related  49.34 
 
 		 608 aa  405  1e-111  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5344  GTP-binding proten HflX  49.32 
 
 		 563 aa  404  1e-111  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.394934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0905  small GTP-binding protein  47.77 
 
 		 546 aa  400  9.999999999999999e-111  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2815  GTP-binding proten HflX  44.83 
 
 		 557 aa  379  1e-104  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1009  GTP-binding protein  46.85 
 
 		 555 aa  376  1e-103  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2557  small GTP-binding protein domain-containing protein  49.11 
 
 		 516 aa  379  1e-103  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0804592  hitchhiker  0.00000575237 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2895  small GTP-binding protein  46.64 
 
 		 580 aa  370  1e-101  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1395  GTP-binding proten HflX  44.83 
 
 		 557 aa  367  1e-100  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0812347 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2913  GTP-binding proten HflX  46.65 
 
 		 560 aa  357  2.9999999999999997e-97  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1687  GTP-binding proten HflX  43.04 
 
 		 560 aa  351  2e-95  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.176029  normal  0.381169 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2258  GTP-binding proten HflX  44.63 
 
 		 555 aa  350  3e-95  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.32021 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0275  GTP-binding proten HflX  42.21 
 
 		 564 aa  344  2e-93  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4208  GTP-binding protein, HSR1-related  41.4 
 
 		 574 aa  344  2e-93  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.552873 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0275  GTP-binding proten HflX  42.21 
 
 		 564 aa  344  2.9999999999999997e-93  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1906  GTP-binding proten HflX  40.39 
 
 		 583 aa  337  2.9999999999999997e-91  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2006  GTP-binding protein, HSR1-related  42.49 
 
 		 569 aa  337  3.9999999999999995e-91  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0178  GTP-binding proten HflX  39.38 
 
 		 596 aa  329  1.0000000000000001e-88  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.22171  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2081  small GTP-binding protein  40.86 
 
 		 582 aa  327  2.0000000000000001e-88  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00812611  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3241  GTP-binding proten HflX  39.18 
 
 		 553 aa  324  2e-87  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.300166  normal  0.108052 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1834  GTP-binding protein, HSR1-related  41.01 
 
 		 528 aa  310  4e-83  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.807644  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2436  GTP-binding proten HflX  52.68 
 
 		 493 aa  304  2.0000000000000002e-81  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.292704  normal  0.693712 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7080  GTP-binding proten HflX  49.71 
 
 		 502 aa  304  2.0000000000000002e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.750227 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2448  GTP-binding protein HflX  42.46 
 
 		 535 aa  303  5.000000000000001e-81  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00382552 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3611  GTP-binding proten HflX  48.48 
 
 		 414 aa  302  1e-80  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0108116  normal  0.379187 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1441  small GTP-binding protein  46.69 
 
 		 413 aa  301  3e-80  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11140  small GTP-binding protein  47.81 
 
 		 395 aa  300  4e-80  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1231  small GTP-binding protein  49.54 
 
 		 503 aa  300  6e-80  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.592117  normal  0.0200783 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1051  GTP-binding proten HflX  48.09 
 
 		 509 aa  296  6e-79  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.128813 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0820  small GTP-binding protein domain-containing protein  49.26 
 
 		 493 aa  296  7e-79  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10600  GTP-binding proten HflX  49.86 
 
 		 521 aa  295  1e-78  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.697427  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07300  small GTP-binding protein domain/GTP-binding conserved hypothetical protein TIGR00650  50.89 
 
 		 546 aa  292  1e-77  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3905  GTP-binding proten HflX  50.14 
 
 		 512 aa  291  2e-77  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.13556  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3097  GTP-binding proten HflX  49.14 
 
 		 461 aa  291  2e-77  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000356343  normal  0.400149 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1110  GTP-binding protein, HSR1-related  52.45 
 
 		 422 aa  288  2e-76  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.000000612987  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1800  GTP-binding proten HflX  49.38 
 
 		 479 aa  287  2.9999999999999996e-76  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1259  GTP-binding protein, HSR1-related  48.57 
 
 		 421 aa  287  4e-76  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.027448  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2215  GTP-binding proten HflX  48.54 
 
 		 484 aa  286  7e-76  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.166526  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0534  GTP-binding proten HflX  46.33 
 
 		 420 aa  286  9e-76  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000187355  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1468  GTP-binding proten HflX  48.53 
 
 		 553 aa  286  1.0000000000000001e-75  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000115477 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23070  GTP-binding proten HflX  46.65 
 
 		 515 aa  285  1.0000000000000001e-75  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0748737 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2215  GTP binding protein  34.47 
 
 		 597 aa  285  2.0000000000000002e-75  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.192025  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1927  GTP binding protein  34.47 
 
 		 597 aa  285  2.0000000000000002e-75  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10790  GTP-binding proten HflX  44.85 
 
 		 433 aa  283  4.0000000000000003e-75  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000931239  unclonable  0.00000000274038 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1466  small GTP-binding protein  47.94 
 
 		 522 aa  284  4.0000000000000003e-75  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00807526  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0684  GTP-binding proten HflX  47.71 
 
 		 512 aa  283  6.000000000000001e-75  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.518988  normal  0.674112 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17490  GTP-binding proten HflX  47.15 
 
 		 517 aa  281  2e-74  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.106124  normal  0.236778 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1140  GTP-binding proten HflX  50.44 
 
 		 501 aa  280  3e-74  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.762868 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0583  GTP-binding protein HflX  46.33 
 
 		 512 aa  281  3e-74  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.622699 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1255  GTP-binding proten HflX  50.45 
 
 		 515 aa  279  8e-74  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27610  GTP-binding proten HflX  48.28 
 
 		 482 aa  278  1e-73  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2262  GTP-binding proten HflX  44.15 
 
 		 435 aa  276  6e-73  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1503  small GTP-binding protein  46.74 
 
 		 530 aa  276  7e-73  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0726763  normal  0.6234 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0164  GTPase  41.45 
 
 		 501 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1408  GTP-binding proten HflX  45.45 
 
 		 441 aa  275  1.0000000000000001e-72  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0811  GTP-binding proten HflX  37.85 
 
 		 509 aa  275  2.0000000000000002e-72  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000455725  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3269  GTP-binding proten HflX  49.27 
 
 		 485 aa  274  3e-72  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000617793  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3837  GTP-binding protein, HSR1-related  47.81 
 
 		 493 aa  273  6e-72  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1174  GTP-binding protein HflX  45.35 
 
 		 431 aa  272  1e-71  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.929711  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_1719  predicted protein  43.66 
 
 		 415 aa  272  1e-71  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2012  GTP-binding proten HflX  45.53 
 
 		 440 aa  271  2e-71  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2151  GTP-binding protein, HSR1-related  47.8 
 
 		 483 aa  271  2e-71  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.464276  normal  0.0136453 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3511  small GTP-binding protein domain-containing protein  46.06 
 
 		 486 aa  271  2e-71  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.67992  normal  0.0915245 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2164  GTP-binding protein, HSR1-related  47.8 
 
 		 483 aa  271  2e-71  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.951338  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2210  GTP-binding protein, HSR1-related  47.8 
 
 		 483 aa  271  2e-71  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.60775  normal  0.0439435 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3918  putative GTPase HflX  45 
 
 		 426 aa  271  2.9999999999999997e-71  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.240209  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2589  GTP-binding protein, HSR1-related  47.72 
 
 		 382 aa  271  2.9999999999999997e-71  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0427105  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2263  GTP-binding family protein ; K03665 GTP-binding protein HflX  46.7 
 
 		 494 aa  271  2.9999999999999997e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0586252 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3452  GTP-binding protein (hflX)  47.35 
 
 		 425 aa  270  5e-71  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3716  GTP-binding protein  47.35 
 
 		 425 aa  270  5e-71  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.1723499999999997e-21 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4340  GTP-binding protein, HSR1-related  49.85 
 
 		 451 aa  270  5.9999999999999995e-71  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.436695  normal  0.136604 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3720  putative GTPase HflX  43.7 
 
 		 426 aa  270  7e-71  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00523075  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3553  GTP-binding protein  47.35 
 
 		 354 aa  270  7e-71  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1612  GTP-binding proten HflX  44.72 
 
 		 436 aa  269  8e-71  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000211402  unclonable  5.44053e-16 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3734  GTP-binding protein  47.35 
 
 		 424 aa  270  8e-71  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3806  GTP-binding protein  47.35 
 
 		 425 aa  269  8.999999999999999e-71  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3981  GTP-binding proten HflX  47.35 
 
 		 487 aa  269  1e-70  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0693971  normal  0.0467716 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1499  GTP-binding protein  47.35 
 
 		 425 aa  268  1e-70  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0819317 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3144  small GTP-binding protein  44.27 
 
 		 454 aa  269  1e-70  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000830464  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3757  GTP-binding protein  47.35 
 
 		 425 aa  268  1e-70  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00868177  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0658  GTP-binding proten HflX  52.53 
 
 		 425 aa  268  2e-70  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2436  GTP-binding protein, HSR1-related  49.22 
 
 		 482 aa  268  2e-70  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.445847  normal  0.220236 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3960  GTP-binding protein, HSR1-related  48.62 
 
 		 482 aa  268  2e-70  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.342247  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1407  small GTP-binding protein  48.55 
 
 		 515 aa  268  2.9999999999999995e-70  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000155427 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2759  putative GTPase HflX  44.96 
 
 		 429 aa  267  4e-70  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.563886  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0898  GTP-binding proten HflX  45.13 
 
 		 417 aa  267  4e-70  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.105158  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3472  GTP1/OBG protein  47.35 
 
 		 423 aa  267  4e-70  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0294358  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2724  GTP-binding proten HflX  37.06 
 
 		 530 aa  267  4e-70  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3465  GTP-binding protein  47.35 
 
 		 425 aa  267  5e-70  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>