More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_2258 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_1687  GTP-binding proten HflX  77.01 
 
 
560 aa  816    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.176029  normal  0.381169 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2258  GTP-binding proten HflX  100 
 
 
555 aa  1093    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.32021 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2006  GTP-binding protein, HSR1-related  54.31 
 
 
569 aa  508  1e-143  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0218  GTP-binding protein HSR1-related  50 
 
 
599 aa  400  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.116932  normal  0.0905188 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0227  GTP-binding proten HflX  48.08 
 
 
607 aa  386  1e-106  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.160426  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0216  GTP-binding proten HflX  48.08 
 
 
607 aa  387  1e-106  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0203  GTP-binding protein, HSR1-related  48.68 
 
 
608 aa  382  1e-105  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5344  GTP-binding proten HflX  46.13 
 
 
563 aa  369  1e-101  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.394934  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2283  GTP-binding proten HflX  45.77 
 
 
549 aa  369  1e-101  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3023  GTP-binding proten HflX  44.75 
 
 
540 aa  354  2e-96  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0879  GTP-binding proten HflX  44.3 
 
 
561 aa  353  5.9999999999999994e-96  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0005  GTP-binding protein HSR1-related  43.01 
 
 
565 aa  348  2e-94  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3183  small GTP-binding protein  45.03 
 
 
532 aa  345  1e-93  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2043  GTP-binding protein  46.07 
 
 
547 aa  343  4e-93  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000980367  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1947  GTP-binding proten HflX  42.86 
 
 
655 aa  327  4.0000000000000003e-88  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2081  small GTP-binding protein  42.61 
 
 
582 aa  321  1.9999999999999998e-86  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00812611  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0905  small GTP-binding protein  43.65 
 
 
546 aa  319  1e-85  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2815  GTP-binding proten HflX  44.03 
 
 
557 aa  318  1e-85  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0275  GTP-binding proten HflX  40.46 
 
 
564 aa  312  1e-83  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0275  GTP-binding proten HflX  40.46 
 
 
564 aa  311  2e-83  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0178  GTP-binding proten HflX  41.74 
 
 
596 aa  311  2e-83  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.22171  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1906  GTP-binding proten HflX  37.52 
 
 
583 aa  310  5.9999999999999995e-83  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2913  GTP-binding proten HflX  44.48 
 
 
560 aa  305  1.0000000000000001e-81  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1395  GTP-binding proten HflX  43.44 
 
 
557 aa  304  3.0000000000000004e-81  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0812347 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1009  GTP-binding protein  42.8 
 
 
555 aa  301  3e-80  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0376  GTP-binding protein HflX  45.71 
 
 
490 aa  298  1e-79  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3241  GTP-binding proten HflX  40.26 
 
 
553 aa  298  2e-79  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.300166  normal  0.108052 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4208  GTP-binding protein, HSR1-related  37.23 
 
 
574 aa  295  1e-78  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.552873 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2557  small GTP-binding protein domain-containing protein  42.83 
 
 
516 aa  293  6e-78  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0804592  hitchhiker  0.00000575237 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1927  GTP binding protein  37.32 
 
 
597 aa  293  7e-78  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2215  GTP binding protein  37.32 
 
 
597 aa  293  8e-78  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.192025  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2895  small GTP-binding protein  42.21 
 
 
580 aa  291  3e-77  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1110  GTP-binding protein, HSR1-related  52.82 
 
 
422 aa  288  2e-76  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.000000612987  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3611  GTP-binding proten HflX  50.97 
 
 
414 aa  282  1e-74  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0108116  normal  0.379187 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0152  small GTP-binding protein  45.22 
 
 
547 aa  282  1e-74  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.352446 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2724  GTP-binding proten HflX  40.86 
 
 
530 aa  279  1e-73  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2448  GTP-binding protein HflX  40.64 
 
 
535 aa  269  1e-70  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00382552 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1834  GTP-binding protein, HSR1-related  38.16 
 
 
528 aa  267  4e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.807644  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11140  small GTP-binding protein  48.97 
 
 
395 aa  265  1e-69  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1051  GTP-binding proten HflX  44.41 
 
 
509 aa  264  3e-69  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.128813 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2759  putative GTPase HflX  44.04 
 
 
429 aa  263  4e-69  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.563886  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2012  GTP-binding proten HflX  46.43 
 
 
440 aa  263  6e-69  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3979  GTP-binding protein, HSR1-related  43.65 
 
 
432 aa  263  6e-69  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2666  putative GTP-binding protein  45.15 
 
 
441 aa  263  6.999999999999999e-69  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10600  GTP-binding proten HflX  47.65 
 
 
521 aa  263  8e-69  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.697427  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1212  GTP-binding protein HflX  42.02 
 
 
412 aa  262  1e-68  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002260  GTP-binding protein HflX  43.49 
 
 
429 aa  262  2e-68  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1231  small GTP-binding protein  47.21 
 
 
503 aa  261  2e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.592117  normal  0.0200783 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2215  GTP-binding proten HflX  45.15 
 
 
484 aa  261  3e-68  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.166526  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0164  GTPase  46.2 
 
 
501 aa  261  3e-68  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1259  GTP-binding protein, HSR1-related  47.24 
 
 
421 aa  260  5.0000000000000005e-68  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.027448  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1174  GTP-binding protein HflX  45.94 
 
 
431 aa  260  5.0000000000000005e-68  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.929711  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2262  GTP-binding proten HflX  44.29 
 
 
435 aa  259  8e-68  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1195  GTP-binding protein  45.74 
 
 
412 aa  259  8e-68  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00118595  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00093  putative GTPase HflX  43.21 
 
 
429 aa  259  9e-68  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0010  hypothetical protein  44.07 
 
 
414 aa  259  1e-67  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0010  hypothetical protein  44.07 
 
 
414 aa  259  1e-67  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5672  GTP-binding proten HflX  45.66 
 
 
433 aa  258  1e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65300  putative GTP-binding protein  45.94 
 
 
433 aa  258  2e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0811  GTP-binding proten HflX  36.22 
 
 
509 aa  258  3e-67  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000455725  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23070  GTP-binding proten HflX  47.43 
 
 
515 aa  257  4e-67  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0748737 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1441  small GTP-binding protein  52.08 
 
 
413 aa  256  5e-67  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0698  putative GTPase HflX  42.7 
 
 
428 aa  256  6e-67  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3797  putative GTPase HflX  42.7 
 
 
428 aa  256  6e-67  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0756965  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3539  small GTP-binding protein  45.4 
 
 
431 aa  256  8e-67  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0887499  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0355  GTP - binding protein, phage lambda cII repressor  47.92 
 
 
489 aa  255  1.0000000000000001e-66  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0396  GTP-binding protein, HSR1-related  47.92 
 
 
489 aa  255  1.0000000000000001e-66  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3652  putative GTPase HflX  42.7 
 
 
428 aa  255  1.0000000000000001e-66  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2768  GTP-binding protein, HSR1-related  44.38 
 
 
432 aa  255  1.0000000000000001e-66  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0326  GTP-binding protein HflX  46.35 
 
 
428 aa  255  2.0000000000000002e-66  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2436  GTP-binding proten HflX  46.43 
 
 
493 aa  255  2.0000000000000002e-66  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.292704  normal  0.693712 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1800  GTP-binding proten HflX  46.07 
 
 
479 aa  254  2.0000000000000002e-66  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3237  GTP-binding protein, HSR1-related  41.96 
 
 
430 aa  254  3e-66  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0536  putative GTPase HflX  42.98 
 
 
426 aa  253  5.000000000000001e-66  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000302275  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3905  GTP-binding proten HflX  48.2 
 
 
512 aa  253  6e-66  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.13556  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0432  putative GTPase HflX  43.26 
 
 
426 aa  253  7e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000150209  unclonable  0.0000000363353 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3981  GTP-binding proten HflX  46.96 
 
 
487 aa  253  7e-66  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0693971  normal  0.0467716 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2776  putative GTPase HflX  43.21 
 
 
439 aa  253  8.000000000000001e-66  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.114582  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27610  GTP-binding proten HflX  46.3 
 
 
482 aa  252  1e-65  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3310  GTP-binding protein, HSR1-related  45.4 
 
 
435 aa  252  1e-65  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3720  putative GTPase HflX  43.26 
 
 
426 aa  251  2e-65  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00523075  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0493  putative GTPase HflX  43.77 
 
 
433 aa  251  2e-65  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0353897  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2721  GTP-binding proten HflX  46.09 
 
 
442 aa  251  2e-65  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.43015  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3918  putative GTPase HflX  42.98 
 
 
426 aa  251  3e-65  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.240209  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7080  GTP-binding proten HflX  45.03 
 
 
502 aa  251  3e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.750227 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4945  GTP-binding proten HflX  45.4 
 
 
433 aa  251  3e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.017296 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4893  GTP-binding protein HflX  45.4 
 
 
433 aa  251  4e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4769  GTP-binding protein, HSR1-related  45.4 
 
 
433 aa  251  4e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0658  GTP-binding proten HflX  52.38 
 
 
425 aa  250  4e-65  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1087  small GTP-binding protein domain-containing protein  45.86 
 
 
436 aa  250  5e-65  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.824642  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0820  small GTP-binding protein domain-containing protein  40.49 
 
 
493 aa  249  7e-65  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1355  GTP-binding protein HflX  46.05 
 
 
435 aa  249  9e-65  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0583  GTP-binding protein HflX  44.17 
 
 
512 aa  249  1e-64  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.622699 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3204  GTP-binding protein, HSR1-related  45.08 
 
 
435 aa  248  1e-64  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.266449  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0636  GTP-binding protein, HSR1-related  44.48 
 
 
433 aa  248  2e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0477069 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1693  GTP-binding protein  39.17 
 
 
419 aa  248  2e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.78132  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1731  GTP-binding proten HflX  44.54 
 
 
434 aa  248  2e-64  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1828  GTP-binding protein  39.17 
 
 
419 aa  248  2e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.990495  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0567  GTP-binding protein, HSR1-related  46.35 
 
 
432 aa  248  2e-64  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.102684  normal  0.249219 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3279  GTP-binding protein, HSR1-related  46.67 
 
 
435 aa  248  2e-64  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00360977  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>