More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_2006 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_2006  GTP-binding protein, HSR1-related  100 
 
 		 569 aa  1111    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1687  GTP-binding proten HflX  53.01 
 
 		 560 aa  505  9.999999999999999e-143  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.176029  normal  0.381169 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2258  GTP-binding proten HflX  53.39 
 
 		 555 aa  498  1e-139  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.32021 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0218  GTP-binding protein HSR1-related  50.46 
 
 		 599 aa  415  1e-114  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.116932  normal  0.0905188 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0216  GTP-binding proten HflX  49.37 
 
 		 607 aa  406  1.0000000000000001e-112  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0227  GTP-binding proten HflX  49.37 
 
 		 607 aa  406  1.0000000000000001e-112  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.160426  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0203  GTP-binding protein, HSR1-related  49.19 
 
 		 608 aa  403  1e-111  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3183  small GTP-binding protein  44.85 
 
 		 532 aa  369  1e-101  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5344  GTP-binding proten HflX  46.06 
 
 		 563 aa  368  1e-100  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.394934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0005  GTP-binding protein HSR1-related  42.23 
 
 		 565 aa  365  1e-99  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2283  GTP-binding proten HflX  43.19 
 
 		 549 aa  365  1e-99  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2043  GTP-binding protein  45.79 
 
 		 547 aa  362  8e-99  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000980367  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3023  GTP-binding proten HflX  45.56 
 
 		 540 aa  356  7.999999999999999e-97  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0275  GTP-binding proten HflX  38.95 
 
 		 564 aa  344  2e-93  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0275  GTP-binding proten HflX  38.95 
 
 		 564 aa  343  4e-93  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1009  GTP-binding protein  44.6 
 
 		 555 aa  335  1e-90  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0905  small GTP-binding protein  43.76 
 
 		 546 aa  333  4e-90  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2913  GTP-binding proten HflX  44.9 
 
 		 560 aa  333  7.000000000000001e-90  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0879  GTP-binding proten HflX  41.94 
 
 		 561 aa  330  6e-89  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2081  small GTP-binding protein  43.74 
 
 		 582 aa  325  9e-88  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00812611  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0178  GTP-binding proten HflX  41.29 
 
 		 596 aa  325  1e-87  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.22171  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4208  GTP-binding protein, HSR1-related  37.48 
 
 		 574 aa  324  2e-87  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.552873 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2815  GTP-binding proten HflX  43.2 
 
 		 557 aa  322  1.9999999999999998e-86  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1947  GTP-binding proten HflX  43.1 
 
 		 655 aa  320  6e-86  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1906  GTP-binding proten HflX  36.35 
 
 		 583 aa  313  3.9999999999999997e-84  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2895  small GTP-binding protein  42.27 
 
 		 580 aa  310  5.9999999999999995e-83  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1395  GTP-binding proten HflX  43.2 
 
 		 557 aa  308  1.0000000000000001e-82  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0812347 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2557  small GTP-binding protein domain-containing protein  44.58 
 
 		 516 aa  308  2.0000000000000002e-82  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0804592  hitchhiker  0.00000575237 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0376  GTP-binding protein HflX  42.28 
 
 		 490 aa  295  2e-78  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2448  GTP-binding protein HflX  40.59 
 
 		 535 aa  295  2e-78  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00382552 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1927  GTP binding protein  37.12 
 
 		 597 aa  292  9e-78  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2215  GTP binding protein  36.94 
 
 		 597 aa  290  4e-77  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.192025  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1834  GTP-binding protein, HSR1-related  37.19 
 
 		 528 aa  286  5e-76  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.807644  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3241  GTP-binding proten HflX  36.54 
 
 		 553 aa  281  3e-74  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.300166  normal  0.108052 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1110  GTP-binding protein, HSR1-related  47.99 
 
 		 422 aa  280  6e-74  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.000000612987  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2724  GTP-binding proten HflX  38.45 
 
 		 530 aa  277  3e-73  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3144  small GTP-binding protein  51.03 
 
 		 454 aa  276  5e-73  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000830464  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2979  GTP-binding protein, HSR1-related  44.19 
 
 		 384 aa  276  6e-73  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.908653  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2334  small GTP-binding protein  47.94 
 
 		 454 aa  275  1.0000000000000001e-72  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1693  GTP-binding protein  40.61 
 
 		 419 aa  272  1e-71  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.78132  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1828  GTP-binding protein  40.61 
 
 		 419 aa  272  1e-71  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.990495  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3097  GTP-binding proten HflX  48.16 
 
 		 461 aa  271  2e-71  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000356343  normal  0.400149 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1051  GTP-binding proten HflX  46.15 
 
 		 509 aa  270  4e-71  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.128813 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0667  GTP-binding protein, HSR1-related  42.89 
 
 		 403 aa  270  4e-71  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000065557  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1441  small GTP-binding protein  47.54 
 
 		 413 aa  270  7e-71  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1466  small GTP-binding protein  46.59 
 
 		 522 aa  268  1e-70  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00807526  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1650  GTP-binding protein  40.33 
 
 		 419 aa  267  2.9999999999999995e-70  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.101149  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1434  GTP-binding protein HSR1-related  40.93 
 
 		 419 aa  268  2.9999999999999995e-70  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002260  GTP-binding protein HflX  44.2 
 
 		 429 aa  267  4e-70  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1835  GTP-binding protein  40.06 
 
 		 419 aa  266  7e-70  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1468  GTP-binding proten HflX  46.02 
 
 		 553 aa  266  8.999999999999999e-70  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000115477 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1872  GTP-binding protein  40.06 
 
 		 419 aa  266  8.999999999999999e-70  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000726379 
 
 
-
 
NC_002936  DET0737  GTP-binding protein, putative  49.21 
 
 		 380 aa  266  1e-69  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.085807  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1259  GTP-binding protein, HSR1-related  48.17 
 
 		 421 aa  265  1e-69  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.027448  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1674  GTP-binding protein  40.06 
 
 		 419 aa  265  1e-69  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.887073  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5672  GTP-binding proten HflX  44.54 
 
 		 433 aa  265  1e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23070  GTP-binding proten HflX  46.59 
 
 		 515 aa  265  2e-69  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0748737 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00093  putative GTPase HflX  43.94 
 
 		 429 aa  265  2e-69  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0636  GTP-binding protein, HSR1-related  45.08 
 
 		 433 aa  265  2e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0477069 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65300  putative GTP-binding protein  45.08 
 
 		 433 aa  265  2e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1951  GTP-binding protein  40.06 
 
 		 419 aa  265  2e-69  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.697887  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3508  GTP-binding protein  40.33 
 
 		 419 aa  265  2e-69  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1731  GTP-binding proten HflX  44.03 
 
 		 434 aa  264  3e-69  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0811  GTP-binding proten HflX  37.86 
 
 		 509 aa  264  3e-69  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000455725  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0152  small GTP-binding protein  41.73 
 
 		 547 aa  264  3e-69  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.352446 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1916  GTP-binding protein  40.06 
 
 		 401 aa  263  4e-69  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.328695  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3611  GTP-binding proten HflX  47.98 
 
 		 414 aa  263  6.999999999999999e-69  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0108116  normal  0.379187 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2100  small GTP-binding protein domain-containing protein  45.82 
 
 		 411 aa  263  8e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.621356  normal  0.0850913 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1255  GTP-binding proten HflX  46.53 
 
 		 515 aa  262  1e-68  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1174  GTP-binding protein HflX  41.98 
 
 		 431 aa  261  2e-68  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.929711  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2436  GTP-binding proten HflX  47.71 
 
 		 493 aa  261  2e-68  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.292704  normal  0.693712 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_643  GTP-binding protein  47.27 
 
 		 403 aa  260  4e-68  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.13619  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2012  GTP-binding proten HflX  42.58 
 
 		 440 aa  259  7e-68  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2759  putative GTPase HflX  42.86 
 
 		 429 aa  259  9e-68  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.563886  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1689  GTP1/OBG protein  39.56 
 
 		 419 aa  259  9e-68  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2926  GTP1/OBG protein  45.87 
 
 		 444 aa  258  1e-67  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0180067  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2721  GTP-binding proten HflX  45.65 
 
 		 442 aa  259  1e-67  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.43015  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0534  GTP-binding proten HflX  45.03 
 
 		 420 aa  259  1e-67  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000187355  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1087  small GTP-binding protein domain-containing protein  42.33 
 
 		 436 aa  257  3e-67  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.824642  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3979  GTP-binding protein, HSR1-related  43.09 
 
 		 432 aa  257  3e-67  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0010  hypothetical protein  42.94 
 
 		 414 aa  257  4e-67  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0010  hypothetical protein  42.94 
 
 		 414 aa  257  4e-67  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7080  GTP-binding proten HflX  44.08 
 
 		 502 aa  257  4e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.750227 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1408  GTP-binding proten HflX  48.19 
 
 		 441 aa  257  4e-67  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2384  small GTP-binding protein  44.29 
 
 		 420 aa  256  6e-67  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.740042  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2080  small GTP-binding protein domain-containing protein  45.23 
 
 		 414 aa  256  7e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.455149  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10790  GTP-binding proten HflX  44.44 
 
 		 433 aa  255  1.0000000000000001e-66  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000931239  unclonable  0.00000000274038 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10600  GTP-binding proten HflX  46.55 
 
 		 521 aa  254  2.0000000000000002e-66  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.697427  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1048  GTP-binding protein  44.51 
 
 		 454 aa  254  2.0000000000000002e-66  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_1719  predicted protein  41.49 
 
 		 415 aa  255  2.0000000000000002e-66  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0567  GTP-binding protein, HSR1-related  44.96 
 
 		 432 aa  255  2.0000000000000002e-66  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.102684  normal  0.249219 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2666  putative GTP-binding protein  43.36 
 
 		 441 aa  255  2.0000000000000002e-66  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1278  GTP-binding protein, HSR1-related  43.9 
 
 		 439 aa  254  3e-66  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.424036  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0940  GTP-binding proten HflX  44.51 
 
 		 454 aa  254  3e-66  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2768  GTP-binding protein, HSR1-related  43.36 
 
 		 432 aa  253  5.000000000000001e-66  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4893  GTP-binding protein HflX  43.44 
 
 		 433 aa  252  1e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4769  GTP-binding protein, HSR1-related  43.44 
 
 		 433 aa  252  1e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4167  GTP-binding proten HflX  44.29 
 
 		 396 aa  252  1e-65  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000123151  unclonable  0.00000000000307153 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4945  GTP-binding proten HflX  43.44 
 
 		 433 aa  252  1e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.017296 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2262  GTP-binding proten HflX  40.57 
 
 		 435 aa  252  1e-65  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>