More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_0905 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU1009  GTP-binding protein  73.9 
 
 		 555 aa  724    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1395  GTP-binding proten HflX  75.05 
 
 		 557 aa  722    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0812347 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2557  small GTP-binding protein domain-containing protein  76.52 
 
 		 516 aa  704    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0804592  hitchhiker  0.00000575237 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2815  GTP-binding proten HflX  75.42 
 
 		 557 aa  741    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0905  small GTP-binding protein  100 
 
 		 546 aa  1087    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2895  small GTP-binding protein  71.48 
 
 		 580 aa  657    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2913  GTP-binding proten HflX  68.38 
 
 		 560 aa  612  9.999999999999999e-175  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2043  GTP-binding protein  61.99 
 
 		 547 aa  590  1e-167  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000980367  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0218  GTP-binding protein HSR1-related  54.13 
 
 		 599 aa  491  1e-137  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.116932  normal  0.0905188 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3183  small GTP-binding protein  52.34 
 
 		 532 aa  485  1e-136  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0227  GTP-binding proten HflX  53.78 
 
 		 607 aa  474  1e-132  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.160426  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0216  GTP-binding proten HflX  53.78 
 
 		 607 aa  474  1e-132  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0203  GTP-binding protein, HSR1-related  53.78 
 
 		 608 aa  471  1.0000000000000001e-131  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3023  GTP-binding proten HflX  48.04 
 
 		 540 aa  444  1e-123  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0879  GTP-binding proten HflX  47.77 
 
 		 561 aa  444  1e-123  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0005  GTP-binding protein HSR1-related  46.97 
 
 		 565 aa  440  9.999999999999999e-123  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5344  GTP-binding proten HflX  48.42 
 
 		 563 aa  433  1e-120  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.394934  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2283  GTP-binding proten HflX  44.61 
 
 		 549 aa  431  1e-119  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1947  GTP-binding proten HflX  44.79 
 
 		 655 aa  401  9.999999999999999e-111  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0376  GTP-binding protein HflX  48.19 
 
 		 490 aa  401  9.999999999999999e-111  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2006  GTP-binding protein, HSR1-related  44.32 
 
 		 569 aa  383  1e-105  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0152  small GTP-binding protein  47.9 
 
 		 547 aa  367  1e-100  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.352446 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2258  GTP-binding proten HflX  43.65 
 
 		 555 aa  363  4e-99  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.32021 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1687  GTP-binding proten HflX  45.55 
 
 		 560 aa  359  8e-98  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.176029  normal  0.381169 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1906  GTP-binding proten HflX  40.56 
 
 		 583 aa  349  9e-95  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4208  GTP-binding protein, HSR1-related  41.12 
 
 		 574 aa  344  2e-93  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.552873 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0275  GTP-binding proten HflX  41.3 
 
 		 564 aa  340  5e-92  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0275  GTP-binding proten HflX  41.3 
 
 		 564 aa  338  9.999999999999999e-92  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1834  GTP-binding protein, HSR1-related  41.89 
 
 		 528 aa  333  6e-90  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.807644  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3241  GTP-binding proten HflX  39.14 
 
 		 553 aa  323  4e-87  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.300166  normal  0.108052 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2081  small GTP-binding protein  40.84 
 
 		 582 aa  322  9.999999999999999e-87  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00812611  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0178  GTP-binding proten HflX  40.72 
 
 		 596 aa  317  3e-85  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.22171  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1110  GTP-binding protein, HSR1-related  53.12 
 
 		 422 aa  310  4e-83  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.000000612987  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2215  GTP binding protein  37.93 
 
 		 597 aa  306  6e-82  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.192025  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1927  GTP binding protein  37.93 
 
 		 597 aa  306  6e-82  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1259  GTP-binding protein, HSR1-related  52.32 
 
 		 421 aa  303  7.000000000000001e-81  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.027448  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1441  small GTP-binding protein  48.21 
 
 		 413 aa  301  2e-80  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3611  GTP-binding proten HflX  51.43 
 
 		 414 aa  295  2e-78  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0108116  normal  0.379187 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1051  GTP-binding proten HflX  46 
 
 		 509 aa  295  2e-78  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.128813 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2448  GTP-binding protein HflX  41.97 
 
 		 535 aa  293  5e-78  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00382552 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11140  small GTP-binding protein  52.84 
 
 		 395 aa  292  8e-78  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2262  GTP-binding proten HflX  46.93 
 
 		 435 aa  292  9e-78  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1195  GTP-binding protein  43.51 
 
 		 412 aa  289  9e-77  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00118595  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7080  GTP-binding proten HflX  46.47 
 
 		 502 aa  288  2e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.750227 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2436  GTP-binding proten HflX  49.23 
 
 		 493 aa  284  3.0000000000000004e-75  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.292704  normal  0.693712 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2724  GTP-binding proten HflX  39.09 
 
 		 530 aa  281  2e-74  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10600  GTP-binding proten HflX  48.24 
 
 		 521 aa  281  2e-74  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.697427  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1212  GTP-binding protein HflX  44.67 
 
 		 412 aa  280  6e-74  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1800  GTP-binding proten HflX  44.72 
 
 		 479 aa  277  3e-73  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1408  GTP-binding proten HflX  47.65 
 
 		 441 aa  277  3e-73  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1231  small GTP-binding protein  46.72 
 
 		 503 aa  278  3e-73  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.592117  normal  0.0200783 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27610  GTP-binding proten HflX  43.73 
 
 		 482 aa  276  8e-73  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1255  GTP-binding proten HflX  47.43 
 
 		 515 aa  276  9e-73  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23070  GTP-binding proten HflX  45.74 
 
 		 515 aa  275  2.0000000000000002e-72  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0748737 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3237  GTP-binding protein, HSR1-related  45.05 
 
 		 430 aa  275  2.0000000000000002e-72  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0534  GTP-binding proten HflX  46.75 
 
 		 420 aa  274  3e-72  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000187355  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1612  GTP-binding proten HflX  44.23 
 
 		 436 aa  274  3e-72  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000211402  unclonable  5.44053e-16 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2768  GTP-binding protein, HSR1-related  46.35 
 
 		 432 aa  274  3e-72  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4780  putative GTPase HflX  43.57 
 
 		 426 aa  274  4.0000000000000004e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0452958  normal  0.331117 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4723  putative GTPase HflX  43.57 
 
 		 426 aa  274  4.0000000000000004e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3918  putative GTPase HflX  45.4 
 
 		 426 aa  274  4.0000000000000004e-72  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.240209  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4630  putative GTPase HflX  43.57 
 
 		 426 aa  274  4.0000000000000004e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.048412  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4640  putative GTPase HflX  43.57 
 
 		 426 aa  274  4.0000000000000004e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.208484  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4759  putative GTPase HflX  43.57 
 
 		 426 aa  273  5.000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04040  predicted GTPase  43.57 
 
 		 426 aa  273  6e-72  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.188583  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3820  GTP-binding proten HflX  43.57 
 
 		 426 aa  273  6e-72  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0373648  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002260  GTP-binding protein HflX  42.22 
 
 		 429 aa  273  6e-72  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3720  putative GTPase HflX  45.4 
 
 		 426 aa  273  6e-72  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00523075  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1503  small GTP-binding protein  44.73 
 
 		 530 aa  273  6e-72  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0726763  normal  0.6234 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4704  putative GTPase HflX  43.89 
 
 		 426 aa  273  6e-72  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5689  putative GTPase HflX  43.57 
 
 		 426 aa  273  6e-72  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0600434  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04002  hypothetical protein  43.57 
 
 		 426 aa  273  6e-72  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.170688  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4731  putative GTPase HflX  43.57 
 
 		 426 aa  273  6e-72  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4415  putative GTPase HflX  43.57 
 
 		 426 aa  273  6e-72  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.446722  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4644  putative GTPase HflX  43.57 
 
 		 426 aa  273  6e-72  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0602066 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3840  putative GTPase HflX  43.57 
 
 		 426 aa  273  6e-72  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.209609  hitchhiker  0.000000230034 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1140  GTP-binding proten HflX  46.22 
 
 		 501 aa  273  7e-72  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.762868 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2759  putative GTPase HflX  45.43 
 
 		 429 aa  272  1e-71  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.563886  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00093  putative GTPase HflX  44.2 
 
 		 429 aa  272  1e-71  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3734  GTP-binding protein  43.75 
 
 		 424 aa  271  2e-71  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2384  small GTP-binding protein  44.67 
 
 		 420 aa  271  2e-71  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.740042  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1466  small GTP-binding protein  46.46 
 
 		 522 aa  271  2e-71  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00807526  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0898  GTP-binding proten HflX  43.6 
 
 		 417 aa  271  2.9999999999999997e-71  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.105158  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2215  GTP-binding proten HflX  47.4 
 
 		 484 aa  271  2.9999999999999997e-71  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.166526  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07300  small GTP-binding protein domain/GTP-binding conserved hypothetical protein TIGR00650  48.9 
 
 		 546 aa  271  2.9999999999999997e-71  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3553  GTP-binding protein  45.51 
 
 		 354 aa  270  4e-71  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3452  GTP-binding protein (hflX)  48.03 
 
 		 425 aa  270  4e-71  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1499  GTP-binding protein  48.36 
 
 		 425 aa  270  4e-71  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0819317 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3097  GTP-binding proten HflX  48.05 
 
 		 461 aa  270  4e-71  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000356343  normal  0.400149 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3757  GTP-binding protein  48.03 
 
 		 425 aa  270  4e-71  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00868177  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3716  GTP-binding protein  48.03 
 
 		 425 aa  270  5e-71  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.1723499999999997e-21 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1731  GTP-binding proten HflX  47 
 
 		 434 aa  270  7e-71  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0536  putative GTPase HflX  43.26 
 
 		 426 aa  269  8.999999999999999e-71  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000302275  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0820  small GTP-binding protein domain-containing protein  49.38 
 
 		 493 aa  269  1e-70  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1468  GTP-binding proten HflX  46.46 
 
 		 553 aa  268  1e-70  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000115477 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3472  GTP1/OBG protein  43.75 
 
 		 423 aa  268  1e-70  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0294358  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3806  GTP-binding protein  48.03 
 
 		 425 aa  269  1e-70  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0326  GTP-binding protein HflX  44.51 
 
 		 428 aa  268  2e-70  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0010  hypothetical protein  45.25 
 
 		 414 aa  267  2.9999999999999995e-70  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0010  hypothetical protein  45.25 
 
 		 414 aa  267  2.9999999999999995e-70  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>