More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_2557 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU1009  GTP-binding protein  84.74 
 
 		 555 aa  783    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2557  small GTP-binding protein domain-containing protein  100 
 
 		 516 aa  1029    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0804592  hitchhiker  0.00000575237 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0905  small GTP-binding protein  76.52 
 
 		 546 aa  707    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1395  GTP-binding proten HflX  72.16 
 
 		 557 aa  666    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0812347 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2815  GTP-binding proten HflX  72.55 
 
 		 557 aa  667    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2895  small GTP-binding protein  68.54 
 
 		 580 aa  592  1e-168  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2913  GTP-binding proten HflX  68.11 
 
 		 560 aa  561  1e-158  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2043  GTP-binding protein  62.89 
 
 		 547 aa  550  1e-155  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000980367  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3183  small GTP-binding protein  50.98 
 
 		 532 aa  468  9.999999999999999e-131  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0218  GTP-binding protein HSR1-related  54.67 
 
 		 599 aa  462  1e-129  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.116932  normal  0.0905188 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0216  GTP-binding proten HflX  52.93 
 
 		 607 aa  442  1e-123  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0227  GTP-binding proten HflX  52.93 
 
 		 607 aa  442  1e-123  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.160426  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0203  GTP-binding protein, HSR1-related  53.12 
 
 		 608 aa  441  9.999999999999999e-123  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0005  GTP-binding protein HSR1-related  48.64 
 
 		 565 aa  432  1e-120  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5344  GTP-binding proten HflX  49.41 
 
 		 563 aa  420  1e-116  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.394934  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0879  GTP-binding proten HflX  49.11 
 
 		 561 aa  417  9.999999999999999e-116  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2283  GTP-binding proten HflX  46.08 
 
 		 549 aa  411  1e-113  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0376  GTP-binding protein HflX  51.33 
 
 		 490 aa  411  1e-113  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3023  GTP-binding proten HflX  49.79 
 
 		 540 aa  407  1.0000000000000001e-112  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0152  small GTP-binding protein  53.17 
 
 		 547 aa  371  1e-101  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.352446 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1947  GTP-binding proten HflX  45.09 
 
 		 655 aa  361  2e-98  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2006  GTP-binding protein, HSR1-related  45.21 
 
 		 569 aa  355  8.999999999999999e-97  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1687  GTP-binding proten HflX  46.15 
 
 		 560 aa  331  2e-89  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.176029  normal  0.381169 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2258  GTP-binding proten HflX  43.22 
 
 		 555 aa  327  4.0000000000000003e-88  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.32021 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2081  small GTP-binding protein  43.93 
 
 		 582 aa  324  2e-87  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00812611  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0178  GTP-binding proten HflX  44.19 
 
 		 596 aa  325  2e-87  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.22171  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3241  GTP-binding proten HflX  39.89 
 
 		 553 aa  320  3e-86  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.300166  normal  0.108052 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1110  GTP-binding protein, HSR1-related  56.25 
 
 		 422 aa  320  3e-86  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.000000612987  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4208  GTP-binding protein, HSR1-related  42.97 
 
 		 574 aa  318  1e-85  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.552873 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1834  GTP-binding protein, HSR1-related  42.5 
 
 		 528 aa  318  2e-85  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.807644  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1906  GTP-binding proten HflX  42.4 
 
 		 583 aa  314  1.9999999999999998e-84  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0275  GTP-binding proten HflX  40.57 
 
 		 564 aa  314  2.9999999999999996e-84  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0275  GTP-binding proten HflX  40.57 
 
 		 564 aa  313  4.999999999999999e-84  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1441  small GTP-binding protein  49.86 
 
 		 413 aa  311  1e-83  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1259  GTP-binding protein, HSR1-related  53.42 
 
 		 421 aa  309  9e-83  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.027448  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3611  GTP-binding proten HflX  52.66 
 
 		 414 aa  305  2.0000000000000002e-81  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0108116  normal  0.379187 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1051  GTP-binding proten HflX  45.85 
 
 		 509 aa  301  1e-80  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.128813 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7080  GTP-binding proten HflX  45.48 
 
 		 502 aa  296  5e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.750227 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11140  small GTP-binding protein  53.2 
 
 		 395 aa  295  1e-78  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4630  putative GTPase HflX  46.44 
 
 		 426 aa  294  2e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.048412  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4723  putative GTPase HflX  46.44 
 
 		 426 aa  294  2e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4640  putative GTPase HflX  46.44 
 
 		 426 aa  294  2e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.208484  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4780  putative GTPase HflX  46.44 
 
 		 426 aa  294  2e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0452958  normal  0.331117 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3820  GTP-binding proten HflX  43.09 
 
 		 426 aa  294  3e-78  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0373648  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2262  GTP-binding proten HflX  44.04 
 
 		 435 aa  294  3e-78  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4759  putative GTPase HflX  46.44 
 
 		 426 aa  294  3e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2759  putative GTPase HflX  48 
 
 		 429 aa  293  4e-78  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.563886  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2448  GTP-binding protein HflX  43.12 
 
 		 535 aa  293  4e-78  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00382552 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1408  GTP-binding proten HflX  46.81 
 
 		 441 aa  293  4e-78  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04040  predicted GTPase  46.13 
 
 		 426 aa  291  1e-77  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.188583  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4415  putative GTPase HflX  46.13 
 
 		 426 aa  291  1e-77  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.446722  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5689  putative GTPase HflX  46.13 
 
 		 426 aa  291  1e-77  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0600434  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4644  putative GTPase HflX  46.13 
 
 		 426 aa  291  1e-77  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0602066 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04002  hypothetical protein  46.13 
 
 		 426 aa  291  1e-77  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.170688  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3840  putative GTPase HflX  46.13 
 
 		 426 aa  291  1e-77  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.209609  hitchhiker  0.000000230034 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4731  putative GTPase HflX  46.13 
 
 		 426 aa  291  1e-77  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4704  putative GTPase HflX  46.13 
 
 		 426 aa  291  2e-77  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0534  GTP-binding proten HflX  48.62 
 
 		 420 aa  290  4e-77  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000187355  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00093  putative GTPase HflX  48.3 
 
 		 429 aa  290  4e-77  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3237  GTP-binding protein, HSR1-related  46.98 
 
 		 430 aa  289  1e-76  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002260  GTP-binding protein HflX  47.68 
 
 		 429 aa  288  2e-76  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1731  GTP-binding proten HflX  45.45 
 
 		 434 aa  286  8e-76  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3918  putative GTPase HflX  46.56 
 
 		 426 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.240209  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1195  GTP-binding protein  45.37 
 
 		 412 aa  285  1.0000000000000001e-75  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00118595  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2436  GTP-binding proten HflX  44.73 
 
 		 493 aa  285  1.0000000000000001e-75  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.292704  normal  0.693712 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1231  small GTP-binding protein  46.53 
 
 		 503 aa  284  2.0000000000000002e-75  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.592117  normal  0.0200783 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0432  putative GTPase HflX  46.56 
 
 		 426 aa  285  2.0000000000000002e-75  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000150209  unclonable  0.0000000363353 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3720  putative GTPase HflX  46.56 
 
 		 426 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00523075  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0698  putative GTPase HflX  45.31 
 
 		 428 aa  283  4.0000000000000003e-75  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3797  putative GTPase HflX  45.31 
 
 		 428 aa  283  4.0000000000000003e-75  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0756965  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3652  putative GTPase HflX  45.31 
 
 		 428 aa  283  4.0000000000000003e-75  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00650  GTP-binding protein HflX  45.51 
 
 		 429 aa  283  5.000000000000001e-75  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.108619  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0898  GTP-binding proten HflX  44.29 
 
 		 417 aa  283  8.000000000000001e-75  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.105158  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1800  GTP-binding proten HflX  44.58 
 
 		 479 aa  282  9e-75  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3539  small GTP-binding protein  46.42 
 
 		 431 aa  282  1e-74  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0887499  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3144  small GTP-binding protein  44.17 
 
 		 454 aa  281  2e-74  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000830464  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0356  putative GTPase HflX  44.89 
 
 		 426 aa  281  3e-74  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.152366  hitchhiker  0.00466267 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1174  GTP-binding protein HflX  45.98 
 
 		 431 aa  280  4e-74  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.929711  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10600  GTP-binding proten HflX  48.55 
 
 		 521 aa  280  4e-74  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.697427  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0811  GTP-binding proten HflX  40.22 
 
 		 509 aa  280  5e-74  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000455725  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23070  GTP-binding proten HflX  44.68 
 
 		 515 aa  280  6e-74  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0748737 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0536  putative GTPase HflX  44.27 
 
 		 426 aa  280  6e-74  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000302275  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0497  GTP-binding proten HflX  46.86 
 
 		 441 aa  279  9e-74  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.135524  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2721  GTP-binding proten HflX  49.07 
 
 		 442 aa  279  1e-73  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.43015  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2926  GTP1/OBG protein  48.78 
 
 		 444 aa  278  2e-73  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0180067  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0010  hypothetical protein  45.89 
 
 		 414 aa  278  2e-73  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0010  hypothetical protein  45.89 
 
 		 414 aa  278  2e-73  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2776  putative GTPase HflX  47.02 
 
 		 439 aa  278  2e-73  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.114582  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2768  GTP-binding protein, HSR1-related  46.84 
 
 		 432 aa  278  2e-73  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0820  small GTP-binding protein domain-containing protein  46.58 
 
 		 493 aa  277  3e-73  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0598  GTP-binding protein, HSR1-related  45.62 
 
 		 435 aa  277  3e-73  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.472321  hitchhiker  0.00000215533 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27610  GTP-binding proten HflX  44.47 
 
 		 482 aa  277  4e-73  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3097  GTP-binding proten HflX  48.38 
 
 		 461 aa  276  5e-73  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000356343  normal  0.400149 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3979  GTP-binding protein, HSR1-related  46.67 
 
 		 432 aa  276  6e-73  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0599  GTP-binding protein, HSR1-related  45.62 
 
 		 435 aa  276  6e-73  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00843062  hitchhiker  0.00021975 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3431  GTP-binding protein, HSR1-related  45.62 
 
 		 435 aa  276  6e-73  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.253406  normal  0.0436905 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0326  GTP-binding protein HflX  45.2 
 
 		 428 aa  275  1.0000000000000001e-72  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0493  putative GTPase HflX  45.31 
 
 		 433 aa  275  1.0000000000000001e-72  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0353897  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1212  GTP-binding protein HflX  43.43 
 
 		 412 aa  275  2.0000000000000002e-72  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0604  GTP-binding protein HflX  45.31 
 
 		 435 aa  275  2.0000000000000002e-72  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>