More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_0152 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_0376  GTP-binding protein HflX  71.75 
 
 		 490 aa  657    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1947  GTP-binding proten HflX  66.89 
 
 		 655 aa  642    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0152  small GTP-binding protein  100 
 
 		 547 aa  1091    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.352446 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0879  GTP-binding proten HflX  67.07 
 
 		 561 aa  625  1e-178  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2283  GTP-binding proten HflX  64.02 
 
 		 549 aa  600  1e-170  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3023  GTP-binding proten HflX  62.16 
 
 		 540 aa  550  1e-155  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3183  small GTP-binding protein  50.41 
 
 		 532 aa  445  1e-123  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0218  GTP-binding protein HSR1-related  51.71 
 
 		 599 aa  405  1.0000000000000001e-112  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.116932  normal  0.0905188 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2043  GTP-binding protein  51.1 
 
 		 547 aa  402  1e-111  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000980367  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5344  GTP-binding proten HflX  50.41 
 
 		 563 aa  400  9.999999999999999e-111  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.394934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0005  GTP-binding protein HSR1-related  48.9 
 
 		 565 aa  401  9.999999999999999e-111  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0227  GTP-binding proten HflX  51.86 
 
 		 607 aa  391  1e-107  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.160426  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0216  GTP-binding proten HflX  51.86 
 
 		 607 aa  391  1e-107  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2557  small GTP-binding protein domain-containing protein  53.17 
 
 		 516 aa  386  1e-106  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0804592  hitchhiker  0.00000575237 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0203  GTP-binding protein, HSR1-related  51.45 
 
 		 608 aa  388  1e-106  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1395  GTP-binding proten HflX  52.4 
 
 		 557 aa  377  1e-103  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0812347 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2815  GTP-binding proten HflX  52.4 
 
 		 557 aa  377  1e-103  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0905  small GTP-binding protein  47.9 
 
 		 546 aa  373  1e-102  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1009  GTP-binding protein  47.34 
 
 		 555 aa  365  1e-99  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2895  small GTP-binding protein  51.32 
 
 		 580 aa  338  1.9999999999999998e-91  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1687  GTP-binding proten HflX  44.49 
 
 		 560 aa  336  7e-91  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.176029  normal  0.381169 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2258  GTP-binding proten HflX  45.22 
 
 		 555 aa  331  3e-89  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.32021 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2081  small GTP-binding protein  42.22 
 
 		 582 aa  330  5.0000000000000004e-89  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00812611  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4208  GTP-binding protein, HSR1-related  42.37 
 
 		 574 aa  327  4.0000000000000003e-88  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.552873 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0275  GTP-binding proten HflX  43.78 
 
 		 564 aa  327  4.0000000000000003e-88  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2006  GTP-binding protein, HSR1-related  43.42 
 
 		 569 aa  326  7e-88  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0275  GTP-binding proten HflX  43.78 
 
 		 564 aa  326  7e-88  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1906  GTP-binding proten HflX  42.15 
 
 		 583 aa  325  2e-87  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2913  GTP-binding proten HflX  50.33 
 
 		 560 aa  323  4e-87  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1834  GTP-binding protein, HSR1-related  42.38 
 
 		 528 aa  323  6e-87  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.807644  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3241  GTP-binding proten HflX  41.2 
 
 		 553 aa  322  9.999999999999999e-87  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.300166  normal  0.108052 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11140  small GTP-binding protein  51.65 
 
 		 395 aa  315  1.9999999999999998e-84  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3611  GTP-binding proten HflX  52.05 
 
 		 414 aa  314  2.9999999999999996e-84  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0108116  normal  0.379187 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1441  small GTP-binding protein  46.31 
 
 		 413 aa  310  2.9999999999999997e-83  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2448  GTP-binding protein HflX  42.27 
 
 		 535 aa  303  6.000000000000001e-81  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00382552 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1259  GTP-binding protein, HSR1-related  50.43 
 
 		 421 aa  302  9e-81  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.027448  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0178  GTP-binding proten HflX  39.24 
 
 		 596 aa  301  2e-80  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.22171  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10790  GTP-binding proten HflX  50 
 
 		 433 aa  301  2e-80  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000931239  unclonable  0.00000000274038 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1110  GTP-binding protein, HSR1-related  52.47 
 
 		 422 aa  300  3e-80  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.000000612987  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1051  GTP-binding proten HflX  50.48 
 
 		 509 aa  297  4e-79  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.128813 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7080  GTP-binding proten HflX  48.51 
 
 		 502 aa  293  5e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.750227 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1612  GTP-binding proten HflX  48.81 
 
 		 436 aa  292  1e-77  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000211402  unclonable  5.44053e-16 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0534  GTP-binding proten HflX  50 
 
 		 420 aa  291  1e-77  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000187355  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1231  small GTP-binding protein  49.85 
 
 		 503 aa  291  2e-77  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.592117  normal  0.0200783 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2436  GTP-binding proten HflX  49.7 
 
 		 493 aa  291  2e-77  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.292704  normal  0.693712 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0410  GTP-binding protein HflX  47.11 
 
 		 420 aa  290  3e-77  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10600  GTP-binding proten HflX  49.71 
 
 		 521 aa  290  5.0000000000000004e-77  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.697427  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2262  GTP-binding proten HflX  44.72 
 
 		 435 aa  288  2e-76  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2012  GTP-binding proten HflX  45.02 
 
 		 440 aa  288  2e-76  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0820  small GTP-binding protein domain-containing protein  48.22 
 
 		 493 aa  285  2.0000000000000002e-75  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5672  GTP-binding proten HflX  48.86 
 
 		 433 aa  285  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1503  small GTP-binding protein  47.14 
 
 		 530 aa  285  2.0000000000000002e-75  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0726763  normal  0.6234 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07300  small GTP-binding protein domain/GTP-binding conserved hypothetical protein TIGR00650  49.13 
 
 		 546 aa  284  3.0000000000000004e-75  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1800  GTP-binding proten HflX  48.92 
 
 		 479 aa  283  4.0000000000000003e-75  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3097  GTP-binding proten HflX  51.45 
 
 		 461 aa  283  5.000000000000001e-75  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000356343  normal  0.400149 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_1719  predicted protein  46.96 
 
 		 415 aa  283  6.000000000000001e-75  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65300  putative GTP-binding protein  48.86 
 
 		 433 aa  283  7.000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0394  small GTP-binding protein  47.21 
 
 		 406 aa  281  2e-74  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000766043  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4340  GTP-binding protein, HSR1-related  49.44 
 
 		 451 aa  280  4e-74  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.436695  normal  0.136604 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0356  putative GTPase HflX  50 
 
 		 426 aa  280  6e-74  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.152366  hitchhiker  0.00466267 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1408  GTP-binding proten HflX  49.69 
 
 		 441 aa  279  8e-74  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2666  putative GTP-binding protein  50.32 
 
 		 441 aa  278  2e-73  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04040  predicted GTPase  49.36 
 
 		 426 aa  277  3e-73  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.188583  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4415  putative GTPase HflX  49.36 
 
 		 426 aa  277  3e-73  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.446722  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3840  putative GTPase HflX  49.36 
 
 		 426 aa  277  3e-73  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.209609  hitchhiker  0.000000230034 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5689  putative GTPase HflX  49.36 
 
 		 426 aa  277  3e-73  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0600434  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4644  putative GTPase HflX  49.36 
 
 		 426 aa  277  3e-73  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0602066 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4731  putative GTPase HflX  49.36 
 
 		 426 aa  277  3e-73  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3918  putative GTPase HflX  49.83 
 
 		 426 aa  277  3e-73  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.240209  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4704  putative GTPase HflX  49.36 
 
 		 426 aa  278  3e-73  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04002  hypothetical protein  49.36 
 
 		 426 aa  277  3e-73  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.170688  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3720  putative GTPase HflX  50.17 
 
 		 426 aa  277  3e-73  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00523075  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3820  GTP-binding proten HflX  49.36 
 
 		 426 aa  277  4e-73  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0373648  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4630  putative GTPase HflX  48.73 
 
 		 426 aa  276  5e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.048412  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4640  putative GTPase HflX  48.73 
 
 		 426 aa  276  5e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.208484  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4780  putative GTPase HflX  48.73 
 
 		 426 aa  276  5e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0452958  normal  0.331117 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4723  putative GTPase HflX  48.73 
 
 		 426 aa  276  5e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4759  putative GTPase HflX  48.73 
 
 		 426 aa  276  6e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0636  GTP-binding protein, HSR1-related  47.47 
 
 		 433 aa  276  7e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0477069 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1087  small GTP-binding protein domain-containing protein  43.5 
 
 		 436 aa  276  9e-73  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.824642  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4893  GTP-binding protein HflX  49.25 
 
 		 433 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002260  GTP-binding protein HflX  44.82 
 
 		 429 aa  274  2.0000000000000002e-72  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1468  GTP-binding proten HflX  46.51 
 
 		 553 aa  275  2.0000000000000002e-72  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000115477 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4945  GTP-binding proten HflX  49.25 
 
 		 433 aa  275  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.017296 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4769  GTP-binding protein, HSR1-related  49.25 
 
 		 433 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27610  GTP-binding proten HflX  47.7 
 
 		 482 aa  274  3e-72  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1499  GTP-binding protein  51.53 
 
 		 425 aa  274  3e-72  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0819317 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1171  GTP-binding protein, HSR1-related  40 
 
 		 409 aa  274  3e-72  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2721  GTP-binding proten HflX  45.29 
 
 		 442 aa  273  4.0000000000000004e-72  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.43015  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3539  small GTP-binding protein  48.44 
 
 		 431 aa  273  5.000000000000001e-72  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0887499  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3259  GTP-binding proten HflX  49.85 
 
 		 450 aa  273  6e-72  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0957781 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0898  GTP-binding proten HflX  46.09 
 
 		 417 aa  273  6e-72  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.105158  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3452  GTP-binding protein (hflX)  46.15 
 
 		 425 aa  273  7e-72  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3716  GTP-binding protein  46.15 
 
 		 425 aa  273  7e-72  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.1723499999999997e-21 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3905  GTP-binding proten HflX  47.21 
 
 		 512 aa  273  8.000000000000001e-72  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.13556  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3553  GTP-binding protein  50.85 
 
 		 354 aa  272  9e-72  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2589  GTP-binding protein, HSR1-related  45.18 
 
 		 382 aa  272  1e-71  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0427105  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0432  putative GTPase HflX  48.11 
 
 		 426 aa  272  1e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000150209  unclonable  0.0000000363353 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3806  GTP-binding protein  46.15 
 
 		 425 aa  272  1e-71  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2759  putative GTPase HflX  44.66 
 
 		 429 aa  272  1e-71  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.563886  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>