More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_2913 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_2913  GTP-binding proten HflX  100 
 
 
560 aa  1099    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2895  small GTP-binding protein  65.22 
 
 
580 aa  631  1e-180  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0905  small GTP-binding protein  68.2 
 
 
546 aa  629  1e-179  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1009  GTP-binding protein  68.68 
 
 
555 aa  620  1e-176  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2815  GTP-binding proten HflX  63.47 
 
 
557 aa  594  1e-168  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1395  GTP-binding proten HflX  64.05 
 
 
557 aa  577  1.0000000000000001e-163  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0812347 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2557  small GTP-binding protein domain-containing protein  67.76 
 
 
516 aa  577  1.0000000000000001e-163  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0804592  hitchhiker  0.00000575237 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2043  GTP-binding protein  60.44 
 
 
547 aa  551  1e-155  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000980367  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0218  GTP-binding protein HSR1-related  53.48 
 
 
599 aa  476  1e-133  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.116932  normal  0.0905188 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0227  GTP-binding proten HflX  54.17 
 
 
607 aa  472  1e-132  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.160426  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0216  GTP-binding proten HflX  54.17 
 
 
607 aa  472  1e-132  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0203  GTP-binding protein, HSR1-related  54.95 
 
 
608 aa  469  1.0000000000000001e-131  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3183  small GTP-binding protein  52.65 
 
 
532 aa  460  9.999999999999999e-129  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0005  GTP-binding protein HSR1-related  49.11 
 
 
565 aa  456  1e-127  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5344  GTP-binding proten HflX  50.17 
 
 
563 aa  451  1e-125  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.394934  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3023  GTP-binding proten HflX  48.35 
 
 
540 aa  422  1e-116  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0879  GTP-binding proten HflX  46.56 
 
 
561 aa  413  1e-114  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2283  GTP-binding proten HflX  43.53 
 
 
549 aa  393  1e-108  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2006  GTP-binding protein, HSR1-related  45.44 
 
 
569 aa  390  1e-107  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1906  GTP-binding proten HflX  43.65 
 
 
583 aa  365  1e-100  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4208  GTP-binding protein, HSR1-related  43.52 
 
 
574 aa  367  1e-100  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.552873 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0376  GTP-binding protein HflX  49.01 
 
 
490 aa  362  1e-98  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0275  GTP-binding proten HflX  42.91 
 
 
564 aa  354  2e-96  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0275  GTP-binding proten HflX  42.91 
 
 
564 aa  352  8e-96  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1687  GTP-binding proten HflX  44.46 
 
 
560 aa  352  1e-95  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.176029  normal  0.381169 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2258  GTP-binding proten HflX  44.48 
 
 
555 aa  348  1e-94  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.32021 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0178  GTP-binding proten HflX  41.82 
 
 
596 aa  342  2e-92  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.22171  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1834  GTP-binding protein, HSR1-related  43.62 
 
 
528 aa  330  3e-89  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.807644  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2081  small GTP-binding protein  41.28 
 
 
582 aa  327  4.0000000000000003e-88  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00812611  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0152  small GTP-binding protein  49.89 
 
 
547 aa  326  7e-88  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.352446 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3241  GTP-binding proten HflX  38.95 
 
 
553 aa  325  9e-88  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.300166  normal  0.108052 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1259  GTP-binding protein, HSR1-related  53.73 
 
 
421 aa  316  6e-85  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.027448  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2448  GTP-binding protein HflX  42.91 
 
 
535 aa  316  7e-85  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00382552 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1110  GTP-binding protein, HSR1-related  56.04 
 
 
422 aa  312  9e-84  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.000000612987  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2215  GTP binding protein  39.1 
 
 
597 aa  311  1e-83  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.192025  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1927  GTP binding protein  39.1 
 
 
597 aa  311  1e-83  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1051  GTP-binding proten HflX  50.77 
 
 
509 aa  305  1.0000000000000001e-81  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.128813 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1441  small GTP-binding protein  47.49 
 
 
413 aa  302  9e-81  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3611  GTP-binding proten HflX  47.79 
 
 
414 aa  299  1e-79  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0108116  normal  0.379187 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11140  small GTP-binding protein  54.52 
 
 
395 aa  299  1e-79  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1408  GTP-binding proten HflX  48.43 
 
 
441 aa  293  8e-78  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23070  GTP-binding proten HflX  48.5 
 
 
515 aa  292  9e-78  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0748737 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2436  GTP-binding proten HflX  50 
 
 
493 aa  292  1e-77  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.292704  normal  0.693712 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2724  GTP-binding proten HflX  38.67 
 
 
530 aa  291  2e-77  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10600  GTP-binding proten HflX  49.85 
 
 
521 aa  290  5.0000000000000004e-77  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.697427  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1231  small GTP-binding protein  47.88 
 
 
503 aa  289  1e-76  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.592117  normal  0.0200783 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1731  GTP-binding proten HflX  48 
 
 
434 aa  289  1e-76  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1174  GTP-binding protein HflX  47.16 
 
 
431 aa  287  2.9999999999999996e-76  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.929711  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1195  GTP-binding protein  46.98 
 
 
412 aa  287  2.9999999999999996e-76  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00118595  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7080  GTP-binding proten HflX  48.43 
 
 
502 aa  287  2.9999999999999996e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.750227 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1140  GTP-binding proten HflX  47.59 
 
 
501 aa  285  1.0000000000000001e-75  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.762868 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1468  GTP-binding proten HflX  46.41 
 
 
553 aa  285  2.0000000000000002e-75  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000115477 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2384  small GTP-binding protein  49.38 
 
 
420 aa  285  2.0000000000000002e-75  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.740042  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1466  small GTP-binding protein  46.13 
 
 
522 aa  284  3.0000000000000004e-75  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00807526  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1800  GTP-binding proten HflX  47.04 
 
 
479 aa  283  4.0000000000000003e-75  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1737  GTP-binding protein, HSR1-related  47.55 
 
 
434 aa  282  1e-74  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.260139  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2215  GTP-binding proten HflX  45.53 
 
 
484 aa  281  2e-74  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.166526  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0820  small GTP-binding protein domain-containing protein  50.78 
 
 
493 aa  281  2e-74  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1255  GTP-binding proten HflX  52.3 
 
 
515 aa  281  3e-74  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2721  GTP-binding proten HflX  48.44 
 
 
442 aa  281  3e-74  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.43015  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1212  GTP-binding protein HflX  44.44 
 
 
412 aa  280  4e-74  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0382  putative GTP-binding protein, transporter associated  40.82 
 
 
555 aa  280  5e-74  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.506856  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27610  GTP-binding proten HflX  45.6 
 
 
482 aa  280  6e-74  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1947  GTP-binding proten HflX  51.85 
 
 
655 aa  280  6e-74  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3734  GTP-binding protein  47.8 
 
 
424 aa  278  1e-73  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02571  putative GTP-binding protein, transport associated  39.16 
 
 
558 aa  278  1e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0534  GTP-binding proten HflX  49.37 
 
 
420 aa  279  1e-73  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000187355  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3553  GTP-binding protein  46 
 
 
354 aa  278  2e-73  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3716  GTP-binding protein  47.8 
 
 
425 aa  278  2e-73  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.1723499999999997e-21 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00093  putative GTPase HflX  46.88 
 
 
429 aa  278  2e-73  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2262  GTP-binding proten HflX  45.91 
 
 
435 aa  278  2e-73  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002260  GTP-binding protein HflX  46.56 
 
 
429 aa  278  2e-73  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3452  GTP-binding protein (hflX)  47.8 
 
 
425 aa  278  3e-73  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07300  small GTP-binding protein domain/GTP-binding conserved hypothetical protein TIGR00650  49.53 
 
 
546 aa  278  3e-73  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1612  GTP-binding proten HflX  42.97 
 
 
436 aa  277  3e-73  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000211402  unclonable  5.44053e-16 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2759  putative GTPase HflX  47.32 
 
 
429 aa  277  4e-73  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.563886  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1499  GTP-binding protein  48.11 
 
 
425 aa  277  5e-73  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0819317 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0636  GTP-binding protein, HSR1-related  47.55 
 
 
433 aa  276  5e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0477069 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1171  GTP-binding protein, HSR1-related  44.44 
 
 
409 aa  276  6e-73  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3806  GTP-binding protein  47.8 
 
 
425 aa  276  7e-73  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0477  GTP-binding proten HflX  46.54 
 
 
401 aa  276  1.0000000000000001e-72  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00918489  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3757  GTP-binding protein  47.48 
 
 
425 aa  276  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00868177  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_1719  predicted protein  44.06 
 
 
415 aa  275  2.0000000000000002e-72  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1503  small GTP-binding protein  44.3 
 
 
530 aa  275  2.0000000000000002e-72  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0726763  normal  0.6234 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3720  putative GTPase HflX  46.08 
 
 
426 aa  275  2.0000000000000002e-72  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00523075  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3472  GTP1/OBG protein  49.83 
 
 
423 aa  275  2.0000000000000002e-72  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0294358  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0497  GTP-binding proten HflX  46.37 
 
 
441 aa  275  2.0000000000000002e-72  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.135524  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0898  GTP-binding proten HflX  44.22 
 
 
417 aa  274  3e-72  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.105158  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3269  GTP-binding proten HflX  48.73 
 
 
485 aa  273  5.000000000000001e-72  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000617793  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3465  GTP-binding protein  47.48 
 
 
425 aa  273  5.000000000000001e-72  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3905  GTP-binding proten HflX  49.85 
 
 
512 aa  273  6e-72  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.13556  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3918  putative GTPase HflX  45.77 
 
 
426 aa  273  6e-72  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.240209  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1562  GTP-binding proten HflX  47.31 
 
 
505 aa  273  6e-72  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.410019  hitchhiker  0.00407104 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1951  GTP-binding protein  40.73 
 
 
419 aa  273  8.000000000000001e-72  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.697887  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1922  GTPase  47.71 
 
 
375 aa  273  8.000000000000001e-72  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.321489  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2926  GTP1/OBG protein  47.11 
 
 
444 aa  272  1e-71  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0180067  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3511  small GTP-binding protein domain-containing protein  47.45 
 
 
486 aa  272  1e-71  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.67992  normal  0.0915245 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1916  GTP-binding protein  40.73 
 
 
401 aa  271  2e-71  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.328695  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04515  GTP-binding protein HflX  46.75 
 
 
407 aa  271  2e-71  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.546831  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2263  GTP-binding family protein ; K03665 GTP-binding protein HflX  49.38 
 
 
494 aa  271  2e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0586252 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>