More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_0382 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_0382  putative GTP-binding protein, transporter associated  100 
 
 		 555 aa  1097    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.506856  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2311  putative GTP-binding protein, transporter associated  78.88 
 
 		 558 aa  818    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.303102 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02571  putative GTP-binding protein, transport associated  65.23 
 
 		 558 aa  687    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0275  GTP-binding proten HflX  42.42 
 
 		 564 aa  320  6e-86  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2448  GTP-binding protein HflX  43.59 
 
 		 535 aa  317  3e-85  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00382552 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0275  GTP-binding proten HflX  42.25 
 
 		 564 aa  317  4e-85  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3241  GTP-binding proten HflX  52.4 
 
 		 553 aa  311  2e-83  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.300166  normal  0.108052 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4208  GTP-binding protein, HSR1-related  39.18 
 
 		 574 aa  309  9e-83  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.552873 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1906  GTP-binding proten HflX  39.76 
 
 		 583 aa  298  1e-79  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1834  GTP-binding protein, HSR1-related  46.34 
 
 		 528 aa  291  2e-77  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.807644  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0898  GTP-binding proten HflX  47.28 
 
 		 417 aa  272  9e-72  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.105158  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1737  GTP-binding protein, HSR1-related  46.47 
 
 		 434 aa  270  5.9999999999999995e-71  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.260139  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1408  GTP-binding proten HflX  49.85 
 
 		 441 aa  266  7e-70  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0879  GTP-binding proten HflX  37.83 
 
 		 561 aa  264  2e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0970  GTP-binding proten HflX  45.81 
 
 		 433 aa  265  2e-69  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.602614 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1731  GTP-binding proten HflX  45.03 
 
 		 434 aa  264  3e-69  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1171  GTP-binding protein, HSR1-related  45.71 
 
 		 409 aa  263  6.999999999999999e-69  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1051  GTP-binding proten HflX  47.11 
 
 		 509 aa  262  1e-68  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.128813 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1231  small GTP-binding protein  43.76 
 
 		 503 aa  261  2e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.592117  normal  0.0200783 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3183  small GTP-binding protein  41.44 
 
 		 532 aa  260  4e-68  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2283  GTP-binding proten HflX  37.39 
 
 		 549 aa  259  8e-68  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1174  GTP-binding protein HflX  44.48 
 
 		 431 aa  258  1e-67  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.929711  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1441  small GTP-binding protein  45.98 
 
 		 413 aa  258  2e-67  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0477  GTP-binding proten HflX  44.71 
 
 		 401 aa  258  3e-67  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00918489  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1506  GTP-binding proten HflX  44.41 
 
 		 433 aa  255  1.0000000000000001e-66  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00115562  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1355  GTP-binding protein HflX  44.54 
 
 		 435 aa  254  2.0000000000000002e-66  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1259  GTP-binding protein, HSR1-related  48.28 
 
 		 421 aa  254  2.0000000000000002e-66  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.027448  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0010  hypothetical protein  43.75 
 
 		 414 aa  254  4.0000000000000004e-66  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04515  GTP-binding protein HflX  43.1 
 
 		 407 aa  254  4.0000000000000004e-66  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.546831  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2721  GTP-binding proten HflX  44.9 
 
 		 442 aa  253  8.000000000000001e-66  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.43015  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0010  hypothetical protein  43.72 
 
 		 414 aa  252  1e-65  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1584  GTP-binding proten HflX  45.13 
 
 		 434 aa  251  2e-65  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1835  GTP-binding protein  39.94 
 
 		 419 aa  251  2e-65  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0636  GTP-binding protein, HSR1-related  46.56 
 
 		 433 aa  251  2e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0477069 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1951  GTP-binding protein  39.94 
 
 		 419 aa  251  3e-65  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.697887  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1916  GTP-binding protein  39.94 
 
 		 401 aa  251  3e-65  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.328695  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0218  GTP-binding protein HSR1-related  40.89 
 
 		 599 aa  249  9e-65  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.116932  normal  0.0905188 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1693  GTP-binding protein  39.67 
 
 		 419 aa  249  1e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.78132  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1674  GTP-binding protein  39.39 
 
 		 419 aa  249  1e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.887073  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1872  GTP-binding protein  39.39 
 
 		 419 aa  249  1e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000726379 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1828  GTP-binding protein  39.67 
 
 		 419 aa  249  1e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.990495  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2215  GTP-binding proten HflX  42.89 
 
 		 484 aa  249  1e-64  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.166526  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1472  GTP-binding proten HflX  45.93 
 
 		 436 aa  248  1e-64  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1650  GTP-binding protein  39.39 
 
 		 419 aa  248  2e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.101149  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00093  putative GTPase HflX  44.69 
 
 		 429 aa  248  2e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23070  GTP-binding proten HflX  43.37 
 
 		 515 aa  248  2e-64  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0748737 
 
 
-
 
NC_002950  PG1886  GTP-binding protein HflX  42.11 
 
 		 406 aa  247  3e-64  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.968139 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002260  GTP-binding protein HflX  44.69 
 
 		 429 aa  248  3e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5672  GTP-binding proten HflX  46.07 
 
 		 433 aa  247  4e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1612  GTP-binding proten HflX  46.27 
 
 		 436 aa  246  6.999999999999999e-64  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000211402  unclonable  5.44053e-16 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65300  putative GTP-binding protein  45.79 
 
 		 433 aa  246  8e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3611  GTP-binding proten HflX  47.49 
 
 		 414 aa  246  9e-64  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0108116  normal  0.379187 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3508  GTP-binding protein  39.39 
 
 		 419 aa  246  9e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3023  GTP-binding proten HflX  38.07 
 
 		 540 aa  246  9.999999999999999e-64  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3204  GTP-binding protein, HSR1-related  45.43 
 
 		 435 aa  245  1.9999999999999999e-63  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.266449  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00650  GTP-binding protein HflX  42.94 
 
 		 429 aa  244  3.9999999999999997e-63  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.108619  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00154  GTP-binding protein  45.06 
 
 		 428 aa  243  5e-63  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3511  small GTP-binding protein domain-containing protein  45.72 
 
 		 486 aa  243  6e-63  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.67992  normal  0.0915245 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2081  small GTP-binding protein  45.83 
 
 		 582 aa  243  7e-63  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00812611  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1081  GTP-binding proten HflX  45.67 
 
 		 405 aa  243  7.999999999999999e-63  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0783851  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3806  GTP-binding protein  50.87 
 
 		 425 aa  243  9e-63  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1434  GTP-binding protein HSR1-related  37.92 
 
 		 419 aa  242  1e-62  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1689  GTP1/OBG protein  38.74 
 
 		 419 aa  242  1e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0497  GTP-binding proten HflX  42.66 
 
 		 441 aa  242  1e-62  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.135524  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2666  putative GTP-binding protein  45.06 
 
 		 441 aa  241  2e-62  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0574  GTP-binding protein, HSR1-related  45.99 
 
 		 421 aa  241  2e-62  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.227405  hitchhiker  0.000000000264606 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1922  GTPase  46.81 
 
 		 375 aa  241  2e-62  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.321489  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3472  GTP1/OBG protein  44.83 
 
 		 423 aa  240  4e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0294358  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0394  small GTP-binding protein  42.58 
 
 		 406 aa  240  4e-62  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000766043  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2759  putative GTPase HflX  43.14 
 
 		 429 aa  240  5e-62  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.563886  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0599  GTP-binding protein, HSR1-related  46.77 
 
 		 435 aa  240  5.999999999999999e-62  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00843062  hitchhiker  0.00021975 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3431  GTP-binding protein, HSR1-related  46.77 
 
 		 435 aa  240  5.999999999999999e-62  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.253406  normal  0.0436905 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0598  GTP-binding protein, HSR1-related  46.77 
 
 		 435 aa  240  5.999999999999999e-62  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.472321  hitchhiker  0.00000215533 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7080  GTP-binding proten HflX  43.02 
 
 		 502 aa  240  5.999999999999999e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.750227 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0227  GTP-binding proten HflX  40.25 
 
 		 607 aa  239  6.999999999999999e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.160426  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3720  putative GTPase HflX  43.79 
 
 		 426 aa  239  6.999999999999999e-62  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00523075  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0216  GTP-binding proten HflX  40.22 
 
 		 607 aa  239  6.999999999999999e-62  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1104  GTP-binding protein HflX  41.57 
 
 		 458 aa  239  6.999999999999999e-62  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3452  GTP-binding protein (hflX)  50.52 
 
 		 425 aa  239  8e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3734  GTP-binding protein  50.52 
 
 		 424 aa  239  9e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1232  GTP-binding proten HflX  47.34 
 
 		 415 aa  239  9e-62  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000402227  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2240  GTP-binding protein HflX  44.76 
 
 		 392 aa  239  9e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.224831  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1110  GTP-binding protein, HSR1-related  51.13 
 
 		 422 aa  239  9e-62  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.000000612987  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07300  small GTP-binding protein domain/GTP-binding conserved hypothetical protein TIGR00650  43.81 
 
 		 546 aa  239  9e-62  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3553  GTP-binding protein  50.52 
 
 		 354 aa  239  1e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3918  putative GTPase HflX  43.79 
 
 		 426 aa  239  1e-61  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.240209  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2589  GTP-binding protein, HSR1-related  42.74 
 
 		 382 aa  239  1e-61  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0427105  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3716  GTP-binding protein  50.52 
 
 		 425 aa  239  1e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.1723499999999997e-21 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10600  GTP-binding proten HflX  46.17 
 
 		 521 aa  239  1e-61  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.697427  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4167  GTP-binding proten HflX  44.31 
 
 		 396 aa  239  1e-61  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000123151  unclonable  0.00000000000307153 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1499  GTP-binding protein  49.83 
 
 		 425 aa  239  1e-61  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0819317 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0410  GTP-binding protein HflX  42.58 
 
 		 420 aa  239  1e-61  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3820  GTP-binding proten HflX  44.74 
 
 		 426 aa  238  2e-61  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0373648  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11140  small GTP-binding protein  45.48 
 
 		 395 aa  238  2e-61  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3310  GTP-binding protein, HSR1-related  44 
 
 		 435 aa  238  2e-61  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3757  GTP-binding protein  50.17 
 
 		 425 aa  238  2e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00868177  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27610  GTP-binding proten HflX  44.54 
 
 		 482 aa  238  2e-61  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2183  GTP-binding proten HflX  44.76 
 
 		 387 aa  238  3e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2384  small GTP-binding protein  46.06 
 
 		 420 aa  238  3e-61  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.740042  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2006  GTP-binding protein, HSR1-related  38.28 
 
 		 569 aa  237  3e-61  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>