More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_1081 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011661  Dtur_1081  GTP-binding proten HflX  100 
 
 
405 aa  797    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0783851  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1259  GTP-binding protein, HSR1-related  48.38 
 
 
421 aa  329  7e-89  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.027448  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11140  small GTP-binding protein  50.79 
 
 
395 aa  324  2e-87  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1110  GTP-binding protein, HSR1-related  47.04 
 
 
422 aa  321  9.999999999999999e-87  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.000000612987  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3097  GTP-binding proten HflX  45.06 
 
 
461 aa  318  7.999999999999999e-86  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000356343  normal  0.400149 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1441  small GTP-binding protein  49.51 
 
 
413 aa  317  3e-85  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2666  putative GTP-binding protein  45.62 
 
 
441 aa  316  5e-85  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2262  GTP-binding proten HflX  45.72 
 
 
435 aa  313  1.9999999999999998e-84  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1051  GTP-binding proten HflX  44.13 
 
 
509 aa  313  2.9999999999999996e-84  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.128813 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1737  GTP-binding protein, HSR1-related  43.93 
 
 
434 aa  312  7.999999999999999e-84  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.260139  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7080  GTP-binding proten HflX  41.53 
 
 
502 aa  311  2e-83  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.750227 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2721  GTP-binding proten HflX  49.71 
 
 
442 aa  310  4e-83  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.43015  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1408  GTP-binding proten HflX  44.9 
 
 
441 aa  306  6e-82  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3979  GTP-binding protein, HSR1-related  44.16 
 
 
432 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0355  GTP - binding protein, phage lambda cII repressor  45.34 
 
 
489 aa  304  2.0000000000000002e-81  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1355  GTP-binding protein HflX  43.47 
 
 
435 aa  303  3.0000000000000004e-81  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1731  GTP-binding proten HflX  42.82 
 
 
434 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1922  GTPase  50 
 
 
375 aa  303  3.0000000000000004e-81  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.321489  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0396  GTP-binding protein, HSR1-related  44.8 
 
 
489 aa  301  2e-80  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4340  GTP-binding protein, HSR1-related  49.23 
 
 
451 aa  300  2e-80  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.436695  normal  0.136604 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0534  GTP-binding proten HflX  48.29 
 
 
420 aa  301  2e-80  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000187355  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2334  small GTP-binding protein  44.36 
 
 
454 aa  300  2e-80  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3144  small GTP-binding protein  43.83 
 
 
454 aa  300  3e-80  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000830464  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2768  GTP-binding protein, HSR1-related  46.85 
 
 
432 aa  299  6e-80  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10600  GTP-binding proten HflX  44.19 
 
 
521 aa  298  9e-80  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.697427  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3611  GTP-binding proten HflX  50.27 
 
 
414 aa  298  1e-79  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0108116  normal  0.379187 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2436  GTP-binding proten HflX  43.67 
 
 
493 aa  298  1e-79  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.292704  normal  0.693712 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2759  putative GTPase HflX  45.36 
 
 
429 aa  297  2e-79  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.563886  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0772  GTP-binding proten HflX  45.32 
 
 
437 aa  297  2e-79  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.426006  normal  0.338027 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0410  GTP-binding protein HflX  45.34 
 
 
420 aa  297  2e-79  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4723  putative GTPase HflX  42.5 
 
 
426 aa  296  3e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4759  putative GTPase HflX  42.5 
 
 
426 aa  297  3e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4630  putative GTPase HflX  42.5 
 
 
426 aa  296  3e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.048412  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4640  putative GTPase HflX  42.5 
 
 
426 aa  296  3e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.208484  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4780  putative GTPase HflX  42.5 
 
 
426 aa  296  3e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0452958  normal  0.331117 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00093  putative GTPase HflX  41.83 
 
 
429 aa  296  4e-79  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1231  small GTP-binding protein  42.32 
 
 
503 aa  296  4e-79  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.592117  normal  0.0200783 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1800  GTP-binding proten HflX  41.22 
 
 
479 aa  296  4e-79  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0394  small GTP-binding protein  45.5 
 
 
406 aa  296  5e-79  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000766043  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0820  small GTP-binding protein domain-containing protein  44.58 
 
 
493 aa  295  8e-79  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3241  GTP-binding proten HflX  46.27 
 
 
553 aa  295  8e-79  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.300166  normal  0.108052 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2926  GTP1/OBG protein  42.86 
 
 
444 aa  295  9e-79  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0180067  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4704  putative GTPase HflX  43 
 
 
426 aa  294  1e-78  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002260  GTP-binding protein HflX  41.34 
 
 
429 aa  295  1e-78  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1584  GTP-binding proten HflX  43.45 
 
 
434 aa  294  2e-78  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2215  GTP-binding proten HflX  40.35 
 
 
484 aa  294  2e-78  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.166526  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0970  GTP-binding proten HflX  44.07 
 
 
433 aa  294  2e-78  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.602614 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04040  predicted GTPase  42.75 
 
 
426 aa  293  3e-78  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.188583  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3820  GTP-binding proten HflX  42.75 
 
 
426 aa  293  3e-78  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0373648  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4644  putative GTPase HflX  42.75 
 
 
426 aa  293  3e-78  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0602066 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00650  GTP-binding protein HflX  45.01 
 
 
429 aa  293  3e-78  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.108619  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3840  putative GTPase HflX  42.75 
 
 
426 aa  293  3e-78  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.209609  hitchhiker  0.000000230034 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1174  GTP-binding protein HflX  43.31 
 
 
431 aa  293  3e-78  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.929711  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4731  putative GTPase HflX  42.75 
 
 
426 aa  293  3e-78  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04002  hypothetical protein  42.75 
 
 
426 aa  293  3e-78  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.170688  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5689  putative GTPase HflX  42.75 
 
 
426 aa  293  3e-78  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0600434  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4415  putative GTPase HflX  42.75 
 
 
426 aa  293  3e-78  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.446722  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17490  GTP-binding proten HflX  43.72 
 
 
517 aa  293  5e-78  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.106124  normal  0.236778 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3269  GTP-binding proten HflX  44.72 
 
 
485 aa  293  5e-78  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000617793  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4167  GTP-binding proten HflX  45.34 
 
 
396 aa  293  5e-78  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000123151  unclonable  0.00000000000307153 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3981  GTP-binding proten HflX  43.43 
 
 
487 aa  292  9e-78  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0693971  normal  0.0467716 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3539  small GTP-binding protein  44.25 
 
 
431 aa  291  1e-77  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0887499  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3905  GTP-binding proten HflX  41.77 
 
 
512 aa  290  2e-77  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.13556  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12738  GTP-binding protein hflX  42.86 
 
 
495 aa  291  2e-77  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.324868 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1466  small GTP-binding protein  45.97 
 
 
522 aa  290  2e-77  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00807526  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23070  GTP-binding proten HflX  44.96 
 
 
515 aa  290  3e-77  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0748737 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1868  GTP-binding protein, HSR1-related  43.52 
 
 
481 aa  290  3e-77  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0249572  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4893  GTP-binding protein HflX  49.41 
 
 
433 aa  290  4e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0010  hypothetical protein  47.8 
 
 
414 aa  290  4e-77  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4769  GTP-binding protein, HSR1-related  49.41 
 
 
433 aa  290  4e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4945  GTP-binding proten HflX  49.41 
 
 
433 aa  290  4e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.017296 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0010  hypothetical protein  47.8 
 
 
414 aa  289  5.0000000000000004e-77  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1469  GTP-binding proten HflX  48.97 
 
 
396 aa  289  6e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.795442  normal  0.339069 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1562  GTP-binding proten HflX  44.22 
 
 
505 aa  289  6e-77  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.410019  hitchhiker  0.00407104 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2776  putative GTPase HflX  43.62 
 
 
439 aa  289  8e-77  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.114582  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1886  GTP-binding protein HflX  45.5 
 
 
406 aa  288  1e-76  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.968139 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0636  GTP-binding protein, HSR1-related  48.19 
 
 
433 aa  288  1e-76  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0477069 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1612  GTP-binding proten HflX  42.89 
 
 
436 aa  288  1e-76  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000211402  unclonable  5.44053e-16 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1255  GTP-binding proten HflX  41.4 
 
 
515 aa  288  1e-76  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0497  GTP-binding proten HflX  40.96 
 
 
441 aa  287  2e-76  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.135524  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2240  GTP-binding protein HflX  49.26 
 
 
392 aa  287  2.9999999999999996e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.224831  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1140  GTP-binding proten HflX  44.26 
 
 
501 aa  286  2.9999999999999996e-76  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.762868 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1982  GTP-binding protein  43.8 
 
 
433 aa  286  4e-76  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.699413  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1830  GTP-binding proten HflX  48.67 
 
 
395 aa  286  4e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.497778 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5107  small GTP-binding protein  48.67 
 
 
396 aa  286  4e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.245706  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1806  small GTP-binding protein  48.67 
 
 
395 aa  286  4e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1506  GTP-binding proten HflX  47.75 
 
 
433 aa  286  4e-76  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00115562  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0326  GTP-binding protein HflX  42.58 
 
 
428 aa  286  5e-76  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00154  GTP-binding protein  47.8 
 
 
428 aa  286  5e-76  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1717  GTP-binding proten HflX  48.38 
 
 
396 aa  286  5e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.658318  normal  0.277641 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1744  small GTP-binding protein  48.67 
 
 
396 aa  286  5e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10790  GTP-binding proten HflX  40.91 
 
 
433 aa  286  5.999999999999999e-76  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000931239  unclonable  0.00000000274038 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1468  GTP-binding proten HflX  45.7 
 
 
553 aa  285  7e-76  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000115477 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0278  GTP-binding protein, HSR1-related  43.62 
 
 
432 aa  285  9e-76  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.134684  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2183  GTP-binding proten HflX  48.67 
 
 
387 aa  285  9e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2349  GTP-binding protein HflX  48.67 
 
 
392 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5672  GTP-binding proten HflX  43.56 
 
 
433 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0178  GTP-binding proten HflX  47.07 
 
 
596 aa  284  2.0000000000000002e-75  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.22171  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1828  GTP-binding protein HflX  48.67 
 
 
387 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0068  GTP-binding protein HflX  48.67 
 
 
387 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0515568  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>