More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_02571 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_0382  putative GTP-binding protein, transporter associated  65.23 
 
 
555 aa  686    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.506856  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2311  putative GTP-binding protein, transporter associated  66.13 
 
 
558 aa  685    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.303102 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02571  putative GTP-binding protein, transport associated  100 
 
 
558 aa  1117    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0275  GTP-binding proten HflX  41.55 
 
 
564 aa  328  1.0000000000000001e-88  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0275  GTP-binding proten HflX  41.37 
 
 
564 aa  326  9e-88  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4208  GTP-binding protein, HSR1-related  40.84 
 
 
574 aa  321  1.9999999999999998e-86  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.552873 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1906  GTP-binding proten HflX  40.28 
 
 
583 aa  314  1.9999999999999998e-84  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3241  GTP-binding proten HflX  49.86 
 
 
553 aa  313  4.999999999999999e-84  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.300166  normal  0.108052 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2448  GTP-binding protein HflX  41.9 
 
 
535 aa  308  1.0000000000000001e-82  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00382552 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1834  GTP-binding protein, HSR1-related  51.4 
 
 
528 aa  295  1e-78  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.807644  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2283  GTP-binding proten HflX  38.63 
 
 
549 aa  284  3.0000000000000004e-75  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1408  GTP-binding proten HflX  48.23 
 
 
441 aa  283  5.000000000000001e-75  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1737  GTP-binding protein, HSR1-related  43.82 
 
 
434 aa  277  5e-73  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.260139  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1731  GTP-binding proten HflX  44.24 
 
 
434 aa  271  2e-71  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1171  GTP-binding protein, HSR1-related  47.33 
 
 
409 aa  269  1e-70  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1612  GTP-binding proten HflX  46.11 
 
 
436 aa  268  2e-70  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000211402  unclonable  5.44053e-16 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04515  GTP-binding protein HflX  46.2 
 
 
407 aa  267  2.9999999999999995e-70  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.546831  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0898  GTP-binding proten HflX  46.51 
 
 
417 aa  267  4e-70  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.105158  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1584  GTP-binding proten HflX  45.48 
 
 
434 aa  266  5e-70  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1886  GTP-binding protein HflX  41.64 
 
 
406 aa  266  8.999999999999999e-70  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.968139 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00650  GTP-binding protein HflX  46.38 
 
 
429 aa  266  8.999999999999999e-70  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.108619  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2721  GTP-binding proten HflX  44.14 
 
 
442 aa  265  2e-69  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.43015  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0477  GTP-binding proten HflX  44.24 
 
 
401 aa  264  3e-69  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00918489  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0497  GTP-binding proten HflX  45.08 
 
 
441 aa  264  4e-69  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.135524  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1355  GTP-binding protein HflX  43.37 
 
 
435 aa  263  6.999999999999999e-69  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0970  GTP-binding proten HflX  44.04 
 
 
433 aa  263  8e-69  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.602614 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002260  GTP-binding protein HflX  44.44 
 
 
429 aa  261  2e-68  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3611  GTP-binding proten HflX  48.73 
 
 
414 aa  261  2e-68  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0108116  normal  0.379187 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0010  hypothetical protein  44.96 
 
 
414 aa  261  2e-68  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0010  hypothetical protein  44.96 
 
 
414 aa  261  3e-68  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1174  GTP-binding protein HflX  41.29 
 
 
431 aa  260  4e-68  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.929711  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3183  small GTP-binding protein  37.78 
 
 
532 aa  260  5.0000000000000005e-68  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2221  GTP-binding proten HflX  46.78 
 
 
387 aa  259  8e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.997598  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1441  small GTP-binding protein  43.21 
 
 
413 aa  259  1e-67  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1469  GTP-binding proten HflX  45.45 
 
 
396 aa  258  1e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.795442  normal  0.339069 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1259  GTP-binding protein, HSR1-related  48.57 
 
 
421 aa  258  1e-67  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.027448  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1982  GTP-binding protein  45.68 
 
 
433 aa  258  2e-67  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.699413  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00093  putative GTPase HflX  44.17 
 
 
429 aa  258  2e-67  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2240  GTP-binding protein HflX  46.49 
 
 
392 aa  258  2e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.224831  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0879  GTP-binding proten HflX  37.43 
 
 
561 aa  258  2e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2349  GTP-binding protein HflX  46.49 
 
 
392 aa  257  3e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1414  GTP-binding proten HflX  46.97 
 
 
414 aa  257  3e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000434774 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0068  GTP-binding protein HflX  46.49 
 
 
387 aa  257  3e-67  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0515568  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2183  GTP-binding proten HflX  46.49 
 
 
387 aa  258  3e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1100  GTP-binding protein HflX  46.49 
 
 
387 aa  257  3e-67  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3023  GTP-binding proten HflX  37.85 
 
 
540 aa  257  3e-67  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1828  GTP-binding protein HflX  46.49 
 
 
387 aa  257  3e-67  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2535  GTP-binding proten HflX  46.38 
 
 
404 aa  257  4e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0955087  hitchhiker  0.0000726108 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1600  small GTP-binding protein  46.38 
 
 
404 aa  257  4e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0793347  normal  0.128476 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1051  GTP-binding proten HflX  44.01 
 
 
509 aa  257  5e-67  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.128813 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2081  small GTP-binding protein  46.55 
 
 
582 aa  257  5e-67  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00812611  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0432  putative GTPase HflX  45.22 
 
 
426 aa  256  5e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000150209  unclonable  0.0000000363353 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1830  GTP-binding proten HflX  45.3 
 
 
395 aa  256  6e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.497778 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1806  small GTP-binding protein  45.3 
 
 
395 aa  256  6e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5107  small GTP-binding protein  45.18 
 
 
396 aa  256  7e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.245706  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0203  GTP-binding protein, HSR1-related  39.65 
 
 
608 aa  256  7e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3979  GTP-binding protein, HSR1-related  46.24 
 
 
432 aa  256  7e-67  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2012  GTP-binding proten HflX  45.36 
 
 
440 aa  256  8e-67  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2666  putative GTP-binding protein  46.26 
 
 
441 aa  256  9e-67  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1339  GTP-binding protein HflX  46.2 
 
 
387 aa  256  1.0000000000000001e-66  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.519508  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3204  GTP-binding protein, HSR1-related  45.01 
 
 
435 aa  256  1.0000000000000001e-66  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.266449  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0493  putative GTPase HflX  44.66 
 
 
433 aa  255  1.0000000000000001e-66  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0353897  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4780  putative GTPase HflX  42.86 
 
 
426 aa  254  2.0000000000000002e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0452958  normal  0.331117 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4723  putative GTPase HflX  42.86 
 
 
426 aa  254  2.0000000000000002e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4630  putative GTPase HflX  42.86 
 
 
426 aa  254  2.0000000000000002e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.048412  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4640  putative GTPase HflX  42.86 
 
 
426 aa  254  2.0000000000000002e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.208484  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0227  GTP-binding proten HflX  39.47 
 
 
607 aa  255  2.0000000000000002e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.160426  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3820  GTP-binding proten HflX  43.82 
 
 
426 aa  254  3e-66  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0373648  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0216  GTP-binding proten HflX  39.47 
 
 
607 aa  254  3e-66  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10790  GTP-binding proten HflX  44.93 
 
 
433 aa  254  3e-66  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000931239  unclonable  0.00000000274038 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4759  putative GTPase HflX  42.86 
 
 
426 aa  254  3e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1744  small GTP-binding protein  46.51 
 
 
396 aa  254  3e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1231  small GTP-binding protein  42.24 
 
 
503 aa  254  3e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.592117  normal  0.0200783 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2759  putative GTPase HflX  43.36 
 
 
429 aa  254  4.0000000000000004e-66  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.563886  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4704  putative GTPase HflX  43.13 
 
 
426 aa  254  4.0000000000000004e-66  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3508  GTP-binding protein  40.16 
 
 
419 aa  253  4.0000000000000004e-66  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04040  predicted GTPase  43.82 
 
 
426 aa  253  6e-66  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.188583  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3840  putative GTPase HflX  43.82 
 
 
426 aa  253  6e-66  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.209609  hitchhiker  0.000000230034 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5689  putative GTPase HflX  43.82 
 
 
426 aa  253  6e-66  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0600434  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4644  putative GTPase HflX  43.82 
 
 
426 aa  253  6e-66  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0602066 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4731  putative GTPase HflX  43.82 
 
 
426 aa  253  6e-66  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4415  putative GTPase HflX  43.82 
 
 
426 aa  253  6e-66  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.446722  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04002  hypothetical protein  43.82 
 
 
426 aa  253  6e-66  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.170688  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5672  GTP-binding proten HflX  45.33 
 
 
433 aa  253  8.000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4167  GTP-binding proten HflX  45.65 
 
 
396 aa  253  8.000000000000001e-66  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000123151  unclonable  0.00000000000307153 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0536  putative GTPase HflX  43.32 
 
 
426 aa  253  8.000000000000001e-66  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000302275  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3384  GTP-binding proten HflX  45.14 
 
 
385 aa  253  9.000000000000001e-66  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1693  GTP-binding protein  40.71 
 
 
419 aa  252  1e-65  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.78132  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3918  putative GTPase HflX  43.48 
 
 
426 aa  252  1e-65  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.240209  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1828  GTP-binding protein  40.71 
 
 
419 aa  252  1e-65  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.990495  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1835  GTP-binding protein  40.16 
 
 
419 aa  252  1e-65  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65300  putative GTP-binding protein  44.63 
 
 
433 aa  252  1e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0356  putative GTPase HflX  43.26 
 
 
426 aa  252  1e-65  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.152366  hitchhiker  0.00466267 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3720  putative GTPase HflX  43.48 
 
 
426 aa  252  2e-65  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00523075  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1048  GTP-binding protein  43.22 
 
 
454 aa  251  2e-65  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2589  GTP-binding protein, HSR1-related  46.2 
 
 
382 aa  251  2e-65  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0427105  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1506  GTP-binding proten HflX  42.51 
 
 
433 aa  251  2e-65  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00115562  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1717  GTP-binding proten HflX  44.63 
 
 
396 aa  251  2e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.658318  normal  0.277641 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0940  GTP-binding proten HflX  43.22 
 
 
454 aa  251  3e-65  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1689  GTP1/OBG protein  39.89 
 
 
419 aa  251  3e-65  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>