More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_1737 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007512  Plut_1355  GTP-binding protein HflX  75 
 
 
435 aa  662    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1174  GTP-binding protein HflX  74.41 
 
 
431 aa  646    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.929711  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1584  GTP-binding proten HflX  77.42 
 
 
434 aa  671    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1737  GTP-binding protein, HSR1-related  100 
 
 
434 aa  882    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.260139  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1731  GTP-binding proten HflX  79.63 
 
 
434 aa  707    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1506  GTP-binding proten HflX  73.57 
 
 
433 aa  619  1e-176  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00115562  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0970  GTP-binding proten HflX  71.77 
 
 
433 aa  615  1e-175  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.602614 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2721  GTP-binding proten HflX  54.24 
 
 
442 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.43015  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4167  GTP-binding proten HflX  57.32 
 
 
396 aa  367  1e-100  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000123151  unclonable  0.00000000000307153 
 
 
-
 
NC_002950  PG1886  GTP-binding protein HflX  49.01 
 
 
406 aa  354  1e-96  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.968139 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0477  GTP-binding proten HflX  48.25 
 
 
401 aa  352  8e-96  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00918489  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1171  GTP-binding protein, HSR1-related  47.38 
 
 
409 aa  349  7e-95  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1232  hypothetical protein  48.92 
 
 
395 aa  338  9.999999999999999e-92  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.125901 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04515  GTP-binding protein HflX  47.78 
 
 
407 aa  332  1e-89  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.546831  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3121  GTP-binding proten HflX  53.46 
 
 
411 aa  327  2.0000000000000001e-88  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.653968 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6253  GTP-binding proten HflX  49.7 
 
 
426 aa  323  3e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0590  GTP-binding proten HflX  49.48 
 
 
396 aa  322  7e-87  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3840  GTP1/OBG family GTP-binding protein  46.81 
 
 
392 aa  311  1e-83  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1713  GTP-binding proten HflX  43.38 
 
 
464 aa  300  3e-80  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.639031  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10790  GTP-binding proten HflX  41.53 
 
 
433 aa  299  5e-80  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000931239  unclonable  0.00000000274038 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1110  GTP-binding protein, HSR1-related  45.84 
 
 
422 aa  299  8e-80  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.000000612987  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2349  GTP-binding protein HflX  49.01 
 
 
392 aa  298  9e-80  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1100  GTP-binding protein HflX  49.01 
 
 
387 aa  298  9e-80  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0068  GTP-binding protein HflX  49.01 
 
 
387 aa  298  9e-80  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0515568  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1828  GTP-binding protein HflX  49.01 
 
 
387 aa  298  9e-80  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2221  GTP-binding proten HflX  49.01 
 
 
387 aa  298  1e-79  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.997598  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2183  GTP-binding proten HflX  49.01 
 
 
387 aa  298  1e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2240  GTP-binding protein HflX  48.45 
 
 
392 aa  296  3e-79  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.224831  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1434  GTP-binding protein HSR1-related  39.66 
 
 
419 aa  296  4e-79  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1339  GTP-binding protein HflX  48.73 
 
 
387 aa  296  4e-79  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.519508  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4893  GTP-binding protein HflX  49.16 
 
 
433 aa  296  6e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0010  hypothetical protein  46.39 
 
 
414 aa  296  6e-79  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4769  GTP-binding protein, HSR1-related  49.16 
 
 
433 aa  296  6e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4945  GTP-binding proten HflX  50.6 
 
 
433 aa  296  6e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.017296 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0010  hypothetical protein  46.78 
 
 
414 aa  296  7e-79  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1612  GTP-binding proten HflX  45.8 
 
 
436 aa  296  7e-79  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000211402  unclonable  5.44053e-16 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1469  GTP-binding proten HflX  48.17 
 
 
396 aa  295  1e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.795442  normal  0.339069 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0574  GTP-binding protein, HSR1-related  44.56 
 
 
421 aa  293  3e-78  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.227405  hitchhiker  0.000000000264606 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1414  GTP-binding proten HflX  47.89 
 
 
414 aa  293  5e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000434774 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1408  GTP-binding proten HflX  43.32 
 
 
441 aa  292  7e-78  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2081  small GTP-binding protein  43.87 
 
 
582 aa  292  8e-78  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00812611  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3144  small GTP-binding protein  46.83 
 
 
454 aa  292  1e-77  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000830464  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3097  GTP-binding proten HflX  45.92 
 
 
461 aa  291  2e-77  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000356343  normal  0.400149 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1951  GTP-binding protein  40.57 
 
 
419 aa  291  2e-77  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.697887  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1689  GTP1/OBG protein  38.69 
 
 
419 aa  291  2e-77  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1693  GTP-binding protein  39.61 
 
 
419 aa  290  3e-77  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.78132  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1828  GTP-binding protein  39.61 
 
 
419 aa  290  3e-77  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.990495  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1835  GTP-binding protein  40.31 
 
 
419 aa  290  4e-77  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5672  GTP-binding proten HflX  44.47 
 
 
433 aa  289  6e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1674  GTP-binding protein  40.31 
 
 
419 aa  289  6e-77  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.887073  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1259  GTP-binding protein, HSR1-related  45.43 
 
 
421 aa  289  6e-77  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.027448  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1650  GTP-binding protein  40.31 
 
 
419 aa  289  7e-77  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.101149  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2979  GTP-binding protein, HSR1-related  45.96 
 
 
384 aa  289  7e-77  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.908653  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1872  GTP-binding protein  40.05 
 
 
419 aa  289  7e-77  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000726379 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2012  GTP-binding proten HflX  45.72 
 
 
440 aa  288  9e-77  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1441  small GTP-binding protein  44.77 
 
 
413 aa  288  1e-76  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2334  small GTP-binding protein  50 
 
 
454 aa  288  1e-76  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1717  GTP-binding proten HflX  47.32 
 
 
396 aa  288  1e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.658318  normal  0.277641 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0396  GTP-binding protein, HSR1-related  42.82 
 
 
489 aa  288  1e-76  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0772  GTP-binding proten HflX  40.71 
 
 
437 aa  288  1e-76  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.426006  normal  0.338027 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65300  putative GTP-binding protein  44.47 
 
 
433 aa  288  1e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0497  GTP-binding proten HflX  42.59 
 
 
441 aa  288  2e-76  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.135524  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0355  GTP - binding protein, phage lambda cII repressor  42.58 
 
 
489 aa  286  2.9999999999999996e-76  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5107  small GTP-binding protein  47.04 
 
 
396 aa  286  5e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.245706  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1087  small GTP-binding protein domain-containing protein  43.09 
 
 
436 aa  286  5e-76  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.824642  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1830  GTP-binding proten HflX  47.04 
 
 
395 aa  286  5.999999999999999e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.497778 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1806  small GTP-binding protein  47.04 
 
 
395 aa  286  5.999999999999999e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1255  GTP-binding proten HflX  46.7 
 
 
515 aa  286  7e-76  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11140  small GTP-binding protein  50.29 
 
 
395 aa  286  7e-76  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1744  small GTP-binding protein  47.04 
 
 
396 aa  286  7e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3508  GTP-binding protein  39.12 
 
 
419 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27610  GTP-binding proten HflX  43.13 
 
 
482 aa  284  2.0000000000000002e-75  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0636  GTP-binding protein, HSR1-related  47.11 
 
 
433 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0477069 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2535  GTP-binding proten HflX  46.01 
 
 
404 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0955087  hitchhiker  0.0000726108 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2768  GTP-binding protein, HSR1-related  44.05 
 
 
432 aa  284  2.0000000000000002e-75  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1868  GTP-binding protein, HSR1-related  41.88 
 
 
481 aa  283  3.0000000000000004e-75  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0249572  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3837  GTP-binding protein, HSR1-related  43.07 
 
 
493 aa  283  3.0000000000000004e-75  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1600  small GTP-binding protein  46.61 
 
 
404 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0793347  normal  0.128476 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3820  GTP-binding proten HflX  42.93 
 
 
426 aa  283  5.000000000000001e-75  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0373648  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1472  GTP-binding proten HflX  42.82 
 
 
436 aa  282  8.000000000000001e-75  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2448  GTP-binding protein HflX  50 
 
 
535 aa  282  8.000000000000001e-75  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00382552 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04040  predicted GTPase  42.93 
 
 
426 aa  281  1e-74  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.188583  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5689  putative GTPase HflX  42.93 
 
 
426 aa  281  1e-74  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0600434  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4415  putative GTPase HflX  42.93 
 
 
426 aa  281  1e-74  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.446722  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1916  GTP-binding protein  42.74 
 
 
401 aa  281  1e-74  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.328695  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4644  putative GTPase HflX  42.93 
 
 
426 aa  281  1e-74  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0602066 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4731  putative GTPase HflX  42.93 
 
 
426 aa  281  1e-74  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4704  putative GTPase HflX  42.93 
 
 
426 aa  281  1e-74  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3840  putative GTPase HflX  42.93 
 
 
426 aa  281  1e-74  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.209609  hitchhiker  0.000000230034 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2631  GTP-binding protein HSR1-related  43.24 
 
 
429 aa  281  1e-74  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.315157  unclonable  0.00000000000608691 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0898  GTP-binding proten HflX  45.4 
 
 
417 aa  282  1e-74  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.105158  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3979  GTP-binding protein, HSR1-related  41.38 
 
 
432 aa  281  1e-74  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04002  hypothetical protein  42.93 
 
 
426 aa  281  1e-74  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.170688  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0583  GTP-binding protein HflX  44.5 
 
 
512 aa  280  2e-74  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.622699 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1231  small GTP-binding protein  43.6 
 
 
503 aa  281  2e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.592117  normal  0.0200783 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002260  GTP-binding protein HflX  45.69 
 
 
429 aa  281  2e-74  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4640  putative GTPase HflX  42.15 
 
 
426 aa  280  3e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.208484  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2926  GTP1/OBG protein  45.58 
 
 
444 aa  280  3e-74  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0180067  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3918  putative GTPase HflX  43.24 
 
 
426 aa  280  3e-74  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.240209  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4780  putative GTPase HflX  42.15 
 
 
426 aa  280  3e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0452958  normal  0.331117 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>